MN967477.1 | ICGRC

Annotations

Contact

Cross Reference

Location on Map

Properties

Relationship

Publication

Sequences

Summary

Annotations

This record has the following annotations.
Term	Name	Definition
GO:0000287	magnesium ion binding	Interacting selectively and non-covalently with magnesium (Mg) ions. [GOC:ai]
GO:0016829	lyase activity
GO:0010333	terpene synthase activity	Catalysis of the formation of cyclic terpenes through the cyclization of linear terpenes (e.g. isopentenyl-PP, geranyl-PP, farnesyl-PP and geranylgeranyl-PP) containing varying numbers of isoprene units. [EC:4.2.3.-, GOC:tair_curators]
INTERPRO:IPR008930	Terpenoid_cyclase/PrenylTrfase
INTERPRO:IPR008949	Isoprenoid_synthase_dom_sf
INTERPRO:IPR036965	Terpene_synth_N_sf
INTERPRO:IPR005630	Terpene_synthase_metal-bd
INTERPRO:IPR001906	Terpene_synth_N

Click a tab below to view blast alignments.

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of MN967477.1 vs. Genbank
Match Name: CM010799.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 7, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 699.154 bits (378), Expect = 0.000e+0
Identity = 378/378 (100.00%), Postives = 378/378 (100.00%), Query Frame = 1

Query:      380 GTATATTTGAAAAATTTAAAGACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGACGTTTCGGGTTTACTTAGTTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGGCCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATTGTGAGGT 757
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 22531288 GTATATTTGAAAAATTTAAAGACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGACGTTTCGGGTTTACTTAGTTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGGCCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATTGTGAGGT 22530911

HSP 2 Score: 669.607 bits (362), Expect = 0.000e+0
Identity = 372/377 (98.67%), Postives = 372/377 (98.67%), Query Frame = 1

Query:      381 TATATTTGAAAAATTTAAAGACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGACGTTTCGGGTTTACTTAGTTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGGCCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATTGTGAGGT 757
                |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 47153135 TATATTTGAAAAATTTAAGGACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGATGTTTCGGGTTTGCTTAATTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGGCCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTACATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATTGTGAGGT 47153511

HSP 3 Score: 632.674 bits (342), Expect = 5.345e-179
Identity = 366/378 (96.83%), Postives = 366/378 (96.83%), Query Frame = 1

Query:      380 GTATATTTGAAAAATTTAAAGACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGACGTTTCGGGTTTACTTAGTTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGGCCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATTGTGAGGT 757
                ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct: 22508798 GTATATTTGAAAAATTTAAGGACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGATGTTTCGGGTTTACTTAGTTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCATAGCCTTGCATAGGCCTCTAAGAAAGACCATAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTACATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAACTTAGTGAAATTATGAGGT 22508421

HSP 4 Score: 568.042 bits (307), Expect = 1.529e-159
Identity = 353/376 (93.88%), Postives = 353/376 (93.88%), Query Frame = 1

Query:      382 ATATTTGAAAAATTTAAAGACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGACGTTTCGGGTTTACTTAGTTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGGCCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATTGTGAGGT 757
                |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  ||||| | |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct: 22489693 ATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGAAAGGTAACTTTAAAGAAAGCCTAATAACCGATGTTCCAGGTTTGCTTAGCTTGTATGAGGCTTCGCACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAAATCATCCATTATCACATCAAATATCCATAGCCTTGGAAAGGCCTCTAAGAAAGACCATAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTACATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAACTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATGTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAACTTAGTGAAATTATGAGGT 22489318

HSP 5 Score: 555.115 bits (300), Expect = 1.190e-155
Identity = 352/378 (93.12%), Postives = 352/378 (93.12%), Query Frame = 1

Query:      380 GTATATTTGAAAAATTTAAAGACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGACGTTTCGGGTTTACTTAGTTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGGCCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATTGTGAGGT 757
                |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||   |||| | ||||| || ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct: 22558675 GTATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGAAAGGTAACTTTAAAGGAAGCCTAATAACTGATGTTCCAGGTTTGCTTAGCTTGTATGAGGCTTCGCACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCATAGCCCTGCATAGGCCTCTAAGAAAGACCATAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTACATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAACTTAGTGAAATTATGAGGT 22558298

HSP 6 Score: 555.115 bits (300), Expect = 1.190e-155
Identity = 352/378 (93.12%), Postives = 352/378 (93.12%), Query Frame = 1

Query:      380 GTATATTTGAAAAATTTAAAGACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGACGTTTCGGGTTTACTTAGTTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGGCCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATTGTGAGGT 757
                |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||   |||| | ||||| || ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct: 47132574 GTATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGAAAGGTAACTTTAAAGGAAGCCTAATAACTGATGTTCCAGGTTTGCTTAGCTTGTATGAGGCTTCGCACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACTACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCATAGCCTTGCATAGGCCTCTAAGAAAGACCATAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTACATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAACTTAGTGAAATTATGAGGT 47132951

HSP 7 Score: 536.649 bits (290), Expect = 4.311e-150
Identity = 290/290 (100.00%), Postives = 290/290 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1361 AGTTTGAACAAGAGAGAAATCACGTACTATCTACAGTGGAATGTTACATGAAGCAATATGAGGTTTCAGAGGAAGAAGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGCCAATTGTTGGAAAGAAATAAATGAAGACTTTATTAGACCAACTAGTGTGCCTTTTCCTATTTTATTTCGTATTATTAATTTGACCAAGACAGCTGATTTTATGTACAGAGAAGGTGGTGACCAATATACACATGTTGGAAAGGTGTTGAAAGATAGCATTGCTGCTTTACTTATAGATCCAATC 1650
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 22525478 AGTTTGAACAAGAGAGAAATCACGTACTATCTACAGTGGAATGTTACATGAAGCAATATGAGGTTTCAGAGGAAGAAGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGCCAATTGTTGGAAAGAAATAAATGAAGACTTTATTAGACCAACTAGTGTGCCTTTTCCTATTTTATTTCGTATTATTAATTTGACCAAGACAGCTGATTTTATGTACAGAGAAGGTGGTGACCAATATACACATGTTGGAAAGGTGTTGAAAGATAGCATTGCTGCTTTACTTATAGATCCAATC 22525189

HSP 8 Score: 512.642 bits (277), Expect = 7.266e-143
Identity = 279/280 (99.64%), Postives = 279/280 (99.64%), Query Frame = 1

Query:     1371 AGAGAGAAATCACGTACTATCTACAGTGGAATGTTACATGAAGCAATATGAGGTTTCAGAGGAAGAAGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGCCAATTGTTGGAAAGAAATAAATGAAGACTTTATTAGACCAACTAGTGTGCCTTTTCCTATTTTATTTCGTATTATTAATTTGACCAAGACAGCTGATTTTATGTACAGAGAAGGTGGTGACCAATATACACATGTTGGAAAGGTGTTGAAAGATAGCATTGCTGCTTTACTTATAGATCCAATC 1650
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 47158969 AGAGAGAAATCACGTACTATCTACAGTGGAATGTTACATGAAGCAATATGAGGTTTCAGAGGAAGAAGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGCCAATTGTTGGAAAGAAATAAATGAAGACTTTATTAGGCCAACTAGTGTGCCTTTTCCTATTTTATTTCGTATTATTAATTTGACCAAGACAGCTGATTTTATGTACAGAGAAGGTGGTGACCAATATACACATGTTGGAAAGGTGTTGAAAGATAGCATTGCTGCTTTACTTATAGATCCAATC 47159248

HSP 9 Score: 472.016 bits (255), Expect = 1.233e-130
Identity = 258/259 (99.61%), Postives = 258/259 (99.61%), Query Frame = 1

Query:      125 ACTT-GGTTTGCAAACAAGAAAGAATTGAAGAATTAATACAAGTTGTGAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCACATCATTTTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCATCATCAAAATCATCAAGATCTACATGATGCTTCTCTTTGGTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTA 382
                |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 22531627 ACTTAGGTTTGCAAACAAGAAAGAATTGAAGAATTAATACAAGTTGTGAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCACATCATTTTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCATCATCAAAATCATCAAGATCTACATGATGCTTCTCTTTGGTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTA 22531369

HSP 10 Score: 472.016 bits (255), Expect = 1.233e-130
Identity = 258/259 (99.61%), Postives = 258/259 (99.61%), Query Frame = 1

Query:      125 ACTT-GGTTTGCAAACAAGAAAGAATTGAAGAATTAATACAAGTTGTGAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCACATCATTTTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCATCATCAAAATCATCAAGATCTACATGATGCTTCTCTTTGGTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTA 382
                |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 47152795 ACTTAGGTTTGCAAACAAGAAAGAATTGAAGAATTAATACAAGTTGTGAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCACATCATTTTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCATCATCAAAATCATCAAGATCTACATGATGCTTCTCTTTGGTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTA 47153053

HSP 11 Score: 464.629 bits (251), Expect = 2.063e-128
Identity = 251/251 (100.00%), Postives = 251/251 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1112 AGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAG 1362
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 47156237 AGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAG 47156487

HSP 12 Score: 448.01 bits (242), Expect = 2.078e-123
Identity = 250/254 (98.43%), Postives = 250/254 (98.43%), Query Frame = 1

Query:      129 GGTTTGCAAACAAGAAAGAATTGAAGAATTAATACAAGTTGTGAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCACATCATTTTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCATCATCAAAATCATCAAGATCTACATGATGCTTCTCTTTGGTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTA 382
                ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 22509132 GGTTTGCAAACAAGAAAGAGTTGAAGAATTAATACAAGTTGTAAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCACATCATTTTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCATCATCAAAATCATCATGATCTACATGATGCTTCTCTTCGGTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTA 22508879

HSP 13 Score: 440.623 bits (238), Expect = 3.477e-121
Identity = 248/252 (98.41%), Postives = 248/252 (98.41%), Query Frame = 1

Query:     1112 AGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTT-GATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAG 1362
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 22528186 AGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTTTGATAGCCACAAGTTATGTAG-AATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTC--CAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAG 22527938

HSP 14 Score: 438.776 bits (237), Expect = 1.251e-120
Identity = 252/259 (97.30%), Postives = 252/259 (97.30%), Query Frame = 1

Query:      125 ACTT-GGTTTGCAAACAAGAAAGAATTGAAGAATTAATACAAGTTGTGAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCACATCATTTTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCATCATCAAAATCATCAAGATCTACATGATGCTTCTCTTTGGTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTA 382
                |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 22559014 ACTTAGGTTTGCAAACAAGAAAGAATTGAAGAATTAATACAAGTTGTAAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCACATCATTTTGAAAGTGAAATCGAGAAATTATTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCATCATCAAAATCATCATGATCTACATGATGCTTCTCTTTGCTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTA 22558756

HSP 15 Score: 407.383 bits (220), Expect = 3.527e-111
Identity = 247/259 (95.37%), Postives = 247/259 (95.37%), Query Frame = 1

Query:      125 ACTT-GGTTTGCAAACAAGAAAGAATTGAAGAATTAATACAAGTTGTGAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCACATCATTTTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCATCATCAAAATCATCAAGATCTACATGATGCTTCTCTTTGGTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTA 382
                |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 47132223 ACTTAGGTTTGCAAAGAAGAAAGAATTGAAGAATTAATACAAGTTGTAAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCACATCATTTTGAAAGTGAAATTGAGAAAT--TTGGAACATTTAAGTA-C--CACTCATCATCAAAATCATCATGATCTACATGATGCTTCTCTTTGCTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTA 47132476

HSP 16 Score: 398.15 bits (215), Expect = 2.123e-108
Identity = 225/230 (97.83%), Postives = 225/230 (97.83%), Query Frame = 1

Query:      747 AATTGTGAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTAGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAGGT 976
                |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 22530340 AATTATTAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTCGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACTGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAGGT 22530111

HSP 17 Score: 392.61 bits (212), Expect = 9.876e-107
Identity = 238/251 (94.82%), Postives = 238/251 (94.82%), Query Frame = 1

Query:     1112 AGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAG 1362
                ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 22505946 AGATGAAAAGAATTATTAGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTGAATGAAGGATATTTGCCAAGGTTGGATGAGCATTTGAGAGTTTCATATGTTTCTTGTGGTTACGTTATGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAGATTGGCTCTCTAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCCACTCTCCTATCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAG 22505696

HSP 18 Score: 390.763 bits (211), Expect = 3.552e-106
Identity = 224/230 (97.39%), Postives = 224/230 (97.39%), Query Frame = 1

Query:      747 AATTGTGAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTAGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAGGT 976
                |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 47154076 AATTATTAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGT-TATTATGAACCCAAATACTCT-GAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACTGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAGGT 47154303

HSP 19 Score: 377.837 bits (204), Expect = 2.765e-102
Identity = 238/254 (93.70%), Postives = 238/254 (93.70%), Query Frame = 1

Query:      129 GGTTTGCAAACAAGAAAGAATTGAAGAATTAATACAAGTTGTGAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCACATCATTTTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCATCATCAAAATCATCAAGATCTACATGATGCTTCTCTTTGGTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTA 382
                ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 22490033 GGTTTGCAAACAAGAAAGAGTTGAAGAATTAATACAAGTTGTAAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCATATCATTTCGAGAGTGAAATCGAGAAATTATTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCATCATCAAAATAAT-A--ATCTACATGATGTTTCTCTTCGGTTTAGACTATTAAGACAAAGTGGATTTAAGGTTTCATCAAGTA 22489783

HSP 20 Score: 364.91 bits (197), Expect = 2.153e-98
Identity = 233/251 (92.83%), Postives = 233/251 (92.83%), Query Frame = 1

Query:     1112 AGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAG 1362
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||| || || |||||||||
Sbjct: 22547839 AGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTGAGTGAAGGATATTTGCCAAGGTTGGATGAGCATTTGAGAGTTTCATATGTTTCTTGTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGTATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAAATTGTTTCAGCTTCCACTCTCCTTGCTAGGTTCATGGATGATATTGGTTCTCGCAAG 22547589

HSP 21 Score: 359.37 bits (194), Expect = 1.002e-96
Identity = 232/251 (92.43%), Postives = 232/251 (92.43%), Query Frame = 1

Query:     1112 AGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAG 1362
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||| || || |||||||||
Sbjct: 47136712 AGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTGAGTGAAGGATATTTCCCAAGCTTGGATGAGCATTTGGGAGTTTCATATGTTTCTTGTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGTATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAAATTGTTTCAGCTTCCACTCTCCTTGCTAGGTTCATGGATGATATTGGTTCTCGCAAG 47136962

HSP 22 Score: 353.83 bits (191), Expect = 4.660e-95
Identity = 217/230 (94.35%), Postives = 217/230 (94.35%), Query Frame = 1

Query:      747 AATTGTGAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTAGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAGGT 976
                |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct: 22557740 AATTATTAGGTGGTGGAAAGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTTCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACAGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTCGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTAGCCTCAATCACTGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTGAGCTTCTTACAAAAGCAATGCAAAGGT 22557511

HSP 23 Score: 353.83 bits (191), Expect = 4.660e-95
Identity = 217/230 (94.35%), Postives = 217/230 (94.35%), Query Frame = 1

Query:      747 AATTGTGAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTAGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAGGT 976
                |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct: 47133496 AATTATTAGGTGGTGGAAAGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTTCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACAGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTCGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTAGCCTCAATCACTGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTGAGCTTCTTACAAAAGCAATGCAAAGGT 47133725

HSP 24 Score: 348.29 bits (188), Expect = 2.168e-93
Identity = 216/230 (93.91%), Postives = 216/230 (93.91%), Query Frame = 1

Query:      747 AATTGTGAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTAGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAGGT 976
                |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||
Sbjct: 22488795 AATTATTAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGTAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTCGAGCAAGAAAGCTTTTGACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACTGATGATACTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTGAGCTTCTTACAAAAGCAATTCAAAGGT 22488566

HSP 25 Score: 337.211 bits (182), Expect = 4.693e-90
Identity = 214/230 (93.04%), Postives = 214/230 (93.04%), Query Frame = 1

Query:      747 AATTGTGAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTAGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAGGT 976
                |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct: 22507895 AATTATTAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGTAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACTGTATTTTTGGATCTTGAATGTATATTATGAACCCAAATACTCTCGAGCAAGAAAGCTTTTGACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACTGATGATACTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTGAGCTTCTTACCAAAGCAATTCAAAGGT 22507666

HSP 26 Score: 298.431 bits (161), Expect = 2.215e-78
Identity = 247/290 (85.17%), Postives = 247/290 (85.17%), Query Frame = 1

Query:     1361 AGTTTGAACAAGAGAGAAATCACGTACTATCTACAGTGGAATGTTACATGAAGCAATATGAGGTTTCAGAGGAAGAAGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGCCAATTGTTGGAAAGAAATAAATGAAGACTTTATTAGACCAACTAGTGTGCCTTTTCCTATTTTATTTCGTATTATTAATTTGACCAAGACAGCTGATTTTATGTACAGAGAAGGTGGTGACCAATATACACATGTTGGAAAGGTGTTGAAAGATAGCATTGCTGCTTTACTTATAGATCCAATC 1650
                ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| || || ||||  ||| || | |||| ||| || | ||| ||||| ||| |||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct: 47138013 AGTTTGAGCAAAAGAGAAATCACATACCATCTACAGTGGATTGTTACATGAAACAATATGAGGTATCAGAGGAAGAGGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGACACCCACTGGAAAGAAATTAATGAAGACTTTATTAGGCCAACTGTTGTGCCTTTTCCTATCTTAGTTCGTGTTCTTAATTTTACAAAAACAGTAGATCTTCTTTACAAAGAGGGCGATGATCAATACACAAATGTTGGAAAAGTGCTCAAAGAAAGCATTGCTGCTTTGCTTATAGATTCAATC 47138302

HSP 27 Score: 292.891 bits (158), Expect = 1.030e-76
Identity = 246/290 (84.83%), Postives = 246/290 (84.83%), Query Frame = 1

Query:     1361 AGTTTGAACAAGAGAGAAATCACGTACTATCTACAGTGGAATGTTACATGAAGCAATATGAGGTTTCAGAGGAAGAAGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGCCAATTGTTGGAAAGAAATAAATGAAGACTTTATTAGACCAACTAGTGTGCCTTTTCCTATTTTATTTCGTATTATTAATTTGACCAAGACAGCTGATTTTATGTACAGAGAAGGTGGTGACCAATATACACATGTTGGAAAGGTGTTGAAAGATAGCATTGCTGCTTTACTTATAGATCCAATC 1650
                ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| || ||   ||| ||| || | |||| ||| |||| ||| ||||| ||| |||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 22505066 AGTTTGAGCAACAGAGAAATCACATACCATCTACAGTTGATTGTTACATGAAACAATATGGAGTATCAGAGGAAGAGGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGTCACCTACTGGAAAGAAATCAATGAAGACTTTATTAGGCCAACTGTTGTGCCTTTTCCTATCTTACTTCGTGTTCTTAATTTTACAAAAGTAGCAGATCTTCTTTACAAAGAGGGTGATGATCAATACACAAATGTTGGAAAAGTGCTCAAAGAAAGCATTGCTGCTTTACTTATAGATTCAATC 22504777

HSP 28 Score: 292.891 bits (158), Expect = 1.030e-76
Identity = 246/290 (84.83%), Postives = 246/290 (84.83%), Query Frame = 1

Query:     1361 AGTTTGAACAAGAGAGAAATCACGTACTATCTACAGTGGAATGTTACATGAAGCAATATGAGGTTTCAGAGGAAGAAGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGCCAATTGTTGGAAAGAAATAAATGAAGACTTTATTAGACCAACTAGTGTGCCTTTTCCTATTTTATTTCGTATTATTAATTTGACCAAGACAGCTGATTTTATGTACAGAGAAGGTGGTGACCAATATACACATGTTGGAAAGGTGTTGAAAGATAGCATTGCTGCTTTACTTATAGATCCAATC 1650
                ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| || || ||||  ||| || | |||| ||| || | ||| ||||| ||| |||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct: 22546539 AGTTTGAGCAAAAGAGAAATCACATACCATCTACAGTGGATTGTTACATGAAACAATATGGGGTATCAGAGGAAGAGGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGACACCCACTGGAAAGAAATTAATGAAGACTTTATTAGGCCAACTGTTGTGCCTTTTCCTATCTTAGTTCGTGTTCTTAATTTTACAAAAACAGTAGATCTTCTTTACAAAGAGGGCGATGATCAATACACAAATGTTGGAAAAGTGCTCAAAGAAAGCATTGCTGCTTTGCTTATAGATTCAATC 22546250

HSP 29 Score: 255.958 bits (138), Expect = 1.352e-65
Identity = 140/141 (99.29%), Postives = 140/141 (99.29%), Query Frame = 1

Query:      973 AGGTGGGACATAAATTGTATGGATAAACTTGAGCCAGAATATTTGAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGAATCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAG 1113
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 22528417 AGGTGGGACATAAATTGTATGGATAAACTTGAGCCAGAATATTTAAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGAATCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAG 22528277

HSP 30 Score: 255.958 bits (138), Expect = 1.352e-65
Identity = 140/141 (99.29%), Postives = 140/141 (99.29%), Query Frame = 1

Query:      973 AGGTGGGACATAAATTGTATGGATAAACTTGAGCCAGAATATTTGAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGAATCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAG 1113
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 47156003 AGGTGGGACATAAATTGTATGGATAAACTTGAGCCAGAATATTTAAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGAATCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAG 47156143

HSP 31 Score: 243.031 bits (131), Expect = 1.053e-61
Identity = 131/131 (100.00%), Postives = 131/131 (100.00%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTAAGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGCGATCGATTCCTCCATTACAATGTTTCAGAACAAGACTTGGT 131
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 22531870 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTAAGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGCGATCGATTCCTCCATTACAATGTTTCAGAACAAGACTTGGT 22531740

HSP 32 Score: 243.031 bits (131), Expect = 1.053e-61
Identity = 131/131 (100.00%), Postives = 131/131 (100.00%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTAAGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGCGATCGATTCCTCCATTACAATGTTTCAGAACAAGACTTGGT 131
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 22559267 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTAAGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGCGATCGATTCCTCCATTACAATGTTTCAGAACAAGACTTGGT 22559137

HSP 33 Score: 243.031 bits (131), Expect = 1.053e-61
Identity = 131/131 (100.00%), Postives = 131/131 (100.00%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTAAGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGCGATCGATTCCTCCATTACAATGTTTCAGAACAAGACTTGGT 131
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 47152550 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTAAGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGCGATCGATTCCTCCATTACAATGTTTCAGAACAAGACTTGGT 47152680

HSP 34 Score: 239.338 bits (129), Expect = 1.362e-60
Identity = 137/141 (97.16%), Postives = 137/141 (97.16%), Query Frame = 1

Query:      973 AGGTGGGACATAAATTGTATGGATAAACTTGAGCCAGAATATTTGAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGAATCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAG 1113
                |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||
Sbjct: 22487110 AGGTGGGACATAAATTGTCTGGATAAACTTGAGCCAGAATATTTAAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGAATCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTCGAGTATGAAAAAGAAGAG 22486970

HSP 35 Score: 239.338 bits (129), Expect = 1.362e-60
Identity = 137/141 (97.16%), Postives = 137/141 (97.16%), Query Frame = 1

Query:      973 AGGTGGGACATAAATTGTATGGATAAACTTGAGCCAGAATATTTGAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGAATCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAG 1113
                |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 22506172 AGGTGGGACATAAATTGTATAGATAAACTTGAGCCAGAATATTTAAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGATTCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTCGAGTATGCAAAAGAAGAG 22506032

HSP 36 Score: 239.338 bits (129), Expect = 1.362e-60
Identity = 137/141 (97.16%), Postives = 137/141 (97.16%), Query Frame = 1

Query:      973 AGGTGGGACATAAATTGTATGGATAAACTTGAGCCAGAATATTTGAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGAATCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAG 1113
                ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 47136474 AGGTGGGACATAACTTGTATGGATAAACTTGAGCCAGAATATTTAAAGACATATTATAAGGCAATGTTGGATTCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAG 47136614

HSP 37 Score: 237.491 bits (128), Expect = 4.897e-60
Identity = 130/131 (99.24%), Postives = 130/131 (99.24%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTAAGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGCGATCGATTCCTCCATTACAATGTTTCAGAACAAGACTTGGT 131
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 47131972 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTAAGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGCGATCGATTCCTCCATTACAATATTTCAGAACAAGACTTGGT 47132102

HSP 38 Score: 231.952 bits (125), Expect = 2.278e-58
Identity = 129/131 (98.47%), Postives = 129/131 (98.47%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTAAGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGCGATCGATTCCTCCATTACAATGTTTCAGAACAAGACTTGGT 131
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 22509388 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTATGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGCGATCGATTCCTCCATTACAATATTTCAGAACAAGACTTGGT 22509258

HSP 39 Score: 215.332 bits (116), Expect = 2.295e-53
Identity = 126/131 (96.18%), Postives = 126/131 (96.18%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTAAGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGCGATCGATTCCTCCATTACAATGTTTCAGAACAAGACTTGGT 131
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 22490289 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTATGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAATAAAATTTCACCCTTCTATTTGGGGGGATCGATTCCTCCATTACAATATTTCAGAACAAGACTTGGT 22490159

HSP 40 Score: 207.945 bits (112), Expect = 3.840e-51
Identity = 133/142 (93.66%), Postives = 133/142 (93.66%), Query Frame = 1

Query:      973 AGGTGGGACATAAATTGTATGGATAAACTTGAGCCAGAATATTTGAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGAATCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATG-CAAAAGAAGAG 1113
                ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 22548072 AGGTGGGACATAACTTGTATGGATAAACTTGAGCCAGAATATTTAAAGACATATTATAAGGCAATGTTG-ATTCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAG-AA-AA-TATACAAACTTGAGTATGGCAAAAGAAGAG 22547935

[Close]

BLAST of MN967477.1 vs. Genbank
Match Name: CM010793.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 3, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 606.821 bits (328), Expect = 3.240e-171
Identity = 360/376 (95.74%), Postives = 360/376 (95.74%), Query Frame = 1

Query:      382 ATATTTGAAAAATTTAAAGACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGACGTTTCGGGTTTACTTAGTTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGGCCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATTGTGAGGT 757
                |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||
Sbjct: 42337758 ATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGAAAGGTAATTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGATGTTTCGGGTTTGCTTAGTTTGTATGAGGCTTCCTACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCATTGGAAAGGCCATTAAGAAAGACCATAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAATGGAGCTTAGCGAAATTATGAGGT 42337383

HSP 2 Score: 604.975 bits (327), Expect = 1.165e-170
Identity = 361/378 (95.50%), Postives = 361/378 (95.50%), Query Frame = 1

Query:      380 GTATATTTGAAAAATTTAAAGACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGACGTTTCGGGTTTACTTAGTTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGGCCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATTGTGAGGT 757
                ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct: 42309187 GTATATTTGAAAAATTTAAGGACGATGAAGGTAACTTTAAGAGAAGCTTGATAACCGATGTTTCGGGTTTACTTAGCTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAATAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCATAGCCTTGCATAGGCCTCTAAGAAAGACCATAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTACATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAATATTGCTGGAGCTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAACTTAGTGAAATTATGAGGT 42308810

HSP 3 Score: 388.917 bits (210), Expect = 1.278e-105
Identity = 240/254 (94.49%), Postives = 240/254 (94.49%), Query Frame = 1

Query:      129 GGTTTGCAAACAAGAAAGAATTGAAGAATTAATACAAGTTGTGAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCACATCATTTTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCATCATCAAAATCATCAAGATCTACATGATGCTTCTCTTTGGTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTA 382
                |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 42309532 GGTTTGTAAACAACAAAGAGTTGAAGAATTAATACAAGTTGTAAGGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTAATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCATATCATTTTGAAAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTA-C--CACTCATCATCAAAATCATCATGATCTTCATGATGCTTCTCTTTGCTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTA 42309282

HSP 4 Score: 298.431 bits (161), Expect = 2.215e-78
Identity = 250/293 (85.32%), Postives = 250/293 (85.32%), Query Frame = 1

Query:     1361 AGTTTGAACAAGAGAGAAATCACGTACTATCTACAGTGGAATGTTACATGAAGCAATATGAGGTTTCAGAGGAAGAAGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGCCAATTGTTGGAAAGAAATAAATGAAGACTTTATTAGACCAACTAGTGTGCCTTTTCCTATTTTATTTCGTATTATTAATTTGACCAAGACAGC-T--GATTTTATGTACAGAGAAGGTGGTGACCAATATACACATGTTGGAAAGGTGTTGAAAGATAGCATTGCTGCTTTACTTATAGATCCAATC 1650
                ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  | ||||||| ||||| ||| ||||| || ||||| | || || | ||  |  ||| || | |||| | | |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 42333582 AGTTTGAGCAAGAGAGAAATCACATACCATCTACAGTGGAATGTTACATGAAGCAATATGGGGTATCAGAAAAAGAGGCAATTGAAGAACTGAATAAAAGAGTGGTCAATTATTGGAAAGAAATTAATGAAGACTTCATTAGGCCAACTGTTATGCCTTTCCCTATCTTAGTTCGTGTTCTTAATGTTAC-AA-A-AGTATTGGATCTTCTTTACAAAAATGGTGATGATCAATATACACATGTTGGAAAAGTGTTTAAAGAAAGCATTGCTGCTTTACTTATAGATCCAATC 42333293

HSP 5 Score: 292.891 bits (158), Expect = 1.030e-76
Identity = 226/259 (87.26%), Postives = 226/259 (87.26%), Query Frame = 1

Query:     1105 AAAGAAGAGATGAAAAGAATT-ATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAG 1362
                ||| || ||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| || ||||     ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  | || ||||||||||| || || |||||||||
Sbjct: 42334421 AAA-AACAGATGAAAA-AATTGATTCGAGCTTATTTAGAAGAAGCTCGATGGTTGAACGATGGATACTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAAAGTTTCTTATGTTTCTTGTGCTTACACAACGTTAATCGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAAATTGTTTCGGCTTCGACTCTACTTGCTAGGTTCATGGATGATATTGGTTCTCGCAAG 42334165

HSP 6 Score: 183.939 bits (99), Expect = 6.471e-44
Identity = 121/131 (92.37%), Postives = 121/131 (92.37%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTAAGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGCGATCGATTCCTCCATTACAATGTTTCAGAACAAGACTTGGT 131
                ||||| || | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 42309777 ATGTC-AA-A-TCAAGTCTTGGCTTCATCTCAATTAGGTGAAAAAATTCTTGCTCGACCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGCGACCGATTCCTCCATTACAATATTTCAGAACAAGACTTGGT 42309650

[Close]

BLAST of MN967477.1 vs. Genbank
Match Name: CM010792.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 2, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 595.741 bits (322), Expect = 7.013e-168
Identity = 360/378 (95.24%), Postives = 360/378 (95.24%), Query Frame = 1

Query:      380 GTATATTTGAAAAATTTAAAGACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGACGTTTCGGGTTTACTTAGTTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGGCCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATTGTGAGGT 757
                ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct:  1769592 GTATATTTGAAAAATTTAAGGACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCT--ATAACCGATGTTTCGGGTTTGCTTAG-TTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCATAGCCTTGCATAGGCCTCTAAGAAAGACCATAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTACATCTCAATCTATGAAAAGGATGTCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGACCTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAACTTAGTGAAATTATGAGGT 1769966

HSP 2 Score: 568.042 bits (307), Expect = 1.529e-159
Identity = 353/376 (93.88%), Postives = 353/376 (93.88%), Query Frame = 1

Query:      382 ATATTTGAAAAATTTAAAGACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGACGTTTCGGGTTTACTTAGTTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGGCCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATTGTGAGGT 757
                |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  ||||| | |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct:  1785169 ATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGAAAGGTAACTTTAAAGAAAGCCTAATAACCGATGTTCCAGGTTTGCTTAGCTTGTATGAGGCTTCGCACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAAATCATCCATTATCACATCAAATATCCATAGCCTTGGAAAGGCCTCTAAGAAAGACCATAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTACATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAACTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATGTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAACTTAGTGAAATTATGAGGT 1785544

HSP 3 Score: 448.01 bits (242), Expect = 2.078e-123
Identity = 250/254 (98.43%), Postives = 250/254 (98.43%), Query Frame = 1

Query:      129 GGTTTGCAAACAAGAAAGAATTGAAGAATTAATACAAGTTGTGAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCACATCATTTTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCATCATCAAAATCATCAAGATCTACATGATGCTTCTCTTTGGTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTA 382
                ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  1769258 GGTTTGCAAACAAGAAAGAGTTGAAGAATTAATACAAGTTGTAAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCACATCATTTTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCATCATCAAAATCATCATGATCTACATGATGCTTCTCTTCGGTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTA 1769511

HSP 4 Score: 387.07 bits (209), Expect = 4.595e-105
Identity = 237/251 (94.42%), Postives = 237/251 (94.42%), Query Frame = 1

Query:     1112 AGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAG 1362
                |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  1788690 AGATGAAAAGAACTATTGGAGGTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTGAATGAAGGATATTTCCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTTTCATATGTTTCTTCTGCTAACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTTTGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAGATTGGCTCTCCAAACACCCTAACATTGTTTCAGCTTCCACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAG 1788940

HSP 5 Score: 381.53 bits (206), Expect = 2.138e-103
Identity = 236/251 (94.02%), Postives = 236/251 (94.02%), Query Frame = 1

Query:     1112 AGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAG 1362
                ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  1772425 AGATGAAAAGAATTATTAGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTGAATGAAGGATATTTCCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTTTCATATGTTTCTTGTGGTTACATTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTTGGAATGTATGATATTGTAACACATGAAACTCTAGATTGGCTCTCTAAAGACCCTAAGATTATTTCAGCTTCCACTCTCCTATCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAG 1772675

HSP 6 Score: 355.677 bits (192), Expect = 1.296e-95
Identity = 234/254 (92.13%), Postives = 234/254 (92.13%), Query Frame = 1

Query:      129 GGTTTGCAAACAAGAAAGAATTGAAGAATTAATACAAGTTGTGAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCACATCATTTTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCATCATCAAAATCATCAAGATCTACATGATGCTTCTCTTTGGTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTA 382
                ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| || |  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||
Sbjct:  1784826 GGTTTGCAAACAAGAAAGAGTTGAAGAATTAATACAAGTTGTAAAGAAAGAGATATTGTCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCATATCATTTCGAGAGTGAAATCGAGAAATTATTGGAACAATTAAGTACTGGCATTCATCATCAAAATAAT-A--ATCTACATGATGTTTCTCTTCGGTTTAGACTATTAAGACAAAGTGGATTTAAGGTTTCATCAAGTA 1785076

HSP 7 Score: 348.29 bits (188), Expect = 2.168e-93
Identity = 216/230 (93.91%), Postives = 216/230 (93.91%), Query Frame = 1

Query:      747 AATTGTGAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTAGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAGGT 976
                |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct:  1786059 AATTATTAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGTAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACTATATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTCGAGCAAGAAAGCTTTTGACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACTGATGATACTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTGAGCTTCTTACCAAAGCAATTCAAAGGT 1786288

HSP 8 Score: 342.75 bits (185), Expect = 1.009e-91
Identity = 215/230 (93.48%), Postives = 215/230 (93.48%), Query Frame = 1

Query:      747 AATTGTGAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTAGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAGGT 976
                |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct:  1770487 AATTATTAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGTAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGAATGTATATTATGAACCCAAATACTCTCGAGCAAGAAAGCTTTTGACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACTGATGATACTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTGAGCTTCTTACCAAAGCAATTCAAAGGT 1770716

HSP 9 Score: 261.498 bits (141), Expect = 2.906e-67
Identity = 241/290 (83.10%), Postives = 241/290 (83.10%), Query Frame = 1

Query:     1361 AGTTTGAACAAGAGAGAAATCACGTACTATCTACAGTGGAATGTTACATGAAGCAATATGAGGTTTCAGAGGAAGAAGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGCCAATTGTTGGAAAGAAATAAATGAAGACTTTATTAGACCAACTAGTGTGCCTTTTCCTATTTTATTTCGTATTATTAATTTGACCAAGACAGCTGATTTTATGTACAGAGAAGGTGGTGACCAATATACACATGTTGGAAAGGTGTTGAAAGATAGCATTGCTGCTTTACTTATAGATCCAATC 1650
                ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||  || ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| || ||   ||| ||| || | |||| ||| || | ||| ||||| ||| |||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct:  1773309 AGTTTGAGCAACAGAGAAATCACATACCATCTACAGTTGATTGTTACATGAAACAATATGGAGTATC--AGGAAGAGGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGTCACCTACTGG-AAGAAATCAATGAAGACTTTATTAGGCCAACTGTTGTGCCTTTTCCTATCTTACTTCGTGTTCTTAATTTTACAAAAGTAGCAGATCTTCTTTACAAAGAGGGCGATGATCAATACACAAATGTTGGAAAAGTGCTCAAAGAAAGCATTGCTGCTTTGCTTATAGATTCAATC 1773595

HSP 10 Score: 244.878 bits (132), Expect = 2.926e-62
Identity = 138/141 (97.87%), Postives = 138/141 (97.87%), Query Frame = 1

Query:      973 AGGTGGGACATAAATTGTATGGATAAACTTGAGCCAGAATATTTGAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGAATCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAG 1113
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct:  1788200 AGGTGGGACATAAATTGTATGGATAAACTTGAGCCAGAATATTTAAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGATTCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTCGAGTATGCAAAAGAAGAG 1788340

HSP 11 Score: 239.338 bits (129), Expect = 1.362e-60
Identity = 137/141 (97.16%), Postives = 137/141 (97.16%), Query Frame = 1

Query:      973 AGGTGGGACATAAATTGTATGGATAAACTTGAGCCAGAATATTTGAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGAATCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAG 1113
                |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct:  1772197 AGGTGGGACATAAATTGTCTGGATAAACTTGAGCCAGAATATTTAAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGATTCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTCGAGTATGCAAAAGAAGAG 1772337

HSP 12 Score: 226.412 bits (122), Expect = 1.060e-56
Identity = 126/128 (98.44%), Postives = 126/128 (98.44%), Query Frame = 1

Query:        4 TCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTAAGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGCGATCGATTCCTCCATTACAATGTTTCAGAACAAGACTTGGT 131
                ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct:  1768982 TCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTATGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGCGATCGATTCCTCCATTACAATATTTCAGAACAAGACTTGGT 1769109

HSP 13 Score: 215.332 bits (116), Expect = 2.295e-53
Identity = 126/131 (96.18%), Postives = 126/131 (96.18%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTAAGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGCGATCGATTCCTCCATTACAATGTTTCAGAACAAGACTTGGT 131
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct:  1784570 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTATGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAATAAAATTTCACCCTTCTATTTGGGGGGATCGATTCCTCCATTACAATATTTCAGAACAAGACTTGGT 1784700

HSP 14 Score: 143.312 bits (77), Expect = 1.098e-31
Identity = 167/210 (79.52%), Postives = 167/210 (79.52%), Query Frame = 1

Query:      754 AGGTGGTGGAAGGAGCAT-GAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACC-CAAAT-ACTCTAGAGCAAGAA-AACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTAC 959
                ||||||||||| ||  || || |||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |||| || || | | |||||||  || |  | || | |||||||  | ||| ||| ||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||| |||||
Sbjct: 54899051 AGGTGGTGGAAAGA-AATAGACTTTGTACACAAACTACCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAGCTATACCTTTGGCTATTAGGAGTTTTTCATGAACCTGAATTGTCACT-G-GCAAGAATTATTTC-AACAAAAGTTATTGCATTGGCCTCAGTTGCAGATGATATTTATGATGCATATGGTACATTTGAAGAGCTTGAGCTCCTTAC 54899256

HSP 15 Score: 67.5997 bits (36), Expect = 6.799e-9
Identity = 46/50 (92.00%), Postives = 46/50 (92.00%), Query Frame = 1

Query:     1112 AGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAAT 1161
                |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||
Sbjct:  1788418 AGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTT---GAAGCTCGATGGTTGAAT 1788464

[Close]

BLAST of MN967477.1 vs. Genbank
Match Name: AGQN03004369.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 004373F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 374.144 bits (202), Expect = 3.577e-101
Identity = 235/251 (93.63%), Postives = 235/251 (93.63%), Query Frame = 1

Query:     1112 AGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAG 1362
                |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||
Sbjct:    55677 AGATGAAAAGAACTATTGGAGGTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTGAATGAAGGATATTTCCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTTTCATATGTTTCTTCTGCTAACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTTTGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAGATTGGCTCTCCAAACACCCTAACATTGTTTCAGCTTCCACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATC-CATAGGCTCTCGCAAG 55428

HSP 2 Score: 87.9128 bits (47), Expect = 5.219e-15
Identity = 49/50 (98.00%), Postives = 49/50 (98.00%), Query Frame = 1

Query:     1112 AGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAAT 1161
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct:    55957 AGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTGAAT 55908

[Close]

BLAST of MN967477.1 vs. Genbank
Match Name: AGQN03001103.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 001103F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 198.712 bits (107), Expect = 2.311e-48
Identity = 129/140 (92.14%), Postives = 129/140 (92.14%), Query Frame = 1

Query:      837 TGTATATTATGAACCCAAATACTCTAGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAGGT 976
                ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct:    97087 TGTATATTATGAACCCAAATATTCTCGAGCAAGAAAGCTTTTGACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACTGATGATGCTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTGAGCTTCTTACCAAAGCAATTCAAAGGT 97226

[Close]

BLAST of MN967477.1 vs. Genbank
Match Name: CM010794.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 4, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 193.172 bits (104), Expect = 1.075e-46
Identity = 128/140 (91.43%), Postives = 128/140 (91.43%), Query Frame = 1

Query:      837 TGTATATTATGAACCCAAATACTCTAGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAGGT 976
                ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct: 10511803 TGTATATTATGAACCCAAATATTCTCGAGCAAGAAAGCTTTTGACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCATTGATGATACTTATGATGCATATTGTACTATTGATGAGCTTGAGCTTCTTACCAAAGCAATTCAAAGGT 10511664

HSP 2 Score: 135.926 bits (73), Expect = 1.838e-29
Identity = 180/233 (77.25%), Postives = 180/233 (77.25%), Query Frame = 1

Query:      754 AGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTAGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAGGTG-GGACATAA 985
                ||||||||||| ||    || || ||||| ||| | || ||||||||| ||||||||||||| || ||  |||||||| | || || | | |||||||  ||| ||||   ||||||||| |  |||  |||| |||| || || ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||| |||| || ||| ||||||| |  ||||  ||||||||
Sbjct:   916336 AGGTGGTGGAAAGAATTAGACTTGGCAAACAAACTACCATTTGCAAGAAATAGGATTGTGGAGCTATACCTTTGGATACTAGGAGTCTTTCATGAACCTCAATTCTCTCTTGCAAGAAAAATCTTAATTAAAGCCATTTCAATGGCCTCAGTTGCAGATGATATTTATGATGCATATGGTACATTTGAAGAACTTGAGCTCCTCACCGAAGCAATTCTCAGGTTTGGACATAA 916568


Match Name	Summary
CM010799.2	E-Value: 5.345e-179, PID: 100.00 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 7, whole genome shotgun sequence [more]
CM010793.2	E-Value: 3.240e-171, PID: 95.74 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 3, whole genome shotgun sequence [more]
CM010792.2	E-Value: 7.013e-168, PID: 95.24 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 2, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03004369.1	E-Value: 3.577e-101, PID: 93.63 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 004373F, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03001103.1	E-Value: 2.311e-48, PID: 92.14 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 001103F, whole genome shotgun sequence [more]
CM010794.2	E-Value: 1.075e-46, PID: 91.43 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 4, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of MN967477.1 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-80524_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 826.573 bits (447), Expect = 0.000e+0
Identity = 491/509 (96.46%), Postives = 491/509 (96.46%), Query Frame = 1

Query:      466 GCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGGCCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATTGTGAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTAGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAG 974
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:       22 GCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGGCCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATT---------------GAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTCGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACTGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAG 515

[Close]

BLAST of MN967477.1 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-14315_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 741.627 bits (401), Expect = 0.000e+0
Identity = 515/572 (90.03%), Postives = 515/572 (90.03%), Query Frame = 1

Query:     1036 ATGTTGGAATCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAGTTTGAACAAGAGAGAAATCACGTACTATCTACAGTGGAATGTTACATGAAGCAATATGAGGTTTCAGAGGAAGAAGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGCCAATTGTTGGAAAGAAATAAATGAAGACTTTATTAGACCAACTAGTGTGCCTTTTCCTATTTTATTTCGTATTATTAATTTGACCAAGACAGCTGATTTTATGTACAGAGAAGGTGGTGACCAATATACACATGTTGGAAA 1607
                |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||| || || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| || || ||||  ||| || | |||| ||| || | ||| ||||| ||| ||||||||||
Sbjct:        1 ATGTTGGATTCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTGAGTGAAGGATATTTCCCAAGCTTGGATGAGCATTTGGGAGTTTCATATGTTTCTTGTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGTATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAAATTGTTTCAGCTTCCACTCTCCTTGCTAGGTTCATGGATGATATTGGTTCTCGCAAGTTTGAGCAAAAGAGAAATCACATACCATCTACAGTGGATTGTTACATGAAACAATATGAGGTATCAGAGGAAGAGGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGACACCCACTGGAAAGAAATTAATGAAGACTTTATTAGGCCAACTGTTGTGCCTTTTCCTATCTTAGTTCGTGTTCTTAATTTTACAAAAACAGTAGATCTTCTTTACAAAGAGGGCGATGATCAATACACAAATGTTGGAAA 572

[Close]

BLAST of MN967477.1 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-80520_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 691.767 bits (374), Expect = 0.000e+0
Identity = 508/572 (88.81%), Postives = 508/572 (88.81%), Query Frame = 1

Query:     1036 ATGTTGGAATCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAGTTTGAACAAGAGAGAAATCACGTACTATCTACAGTGGAATGTTACATGAAGCAATATGAGGTTTCAGAGGAAGAAGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGCCAATTGTTGGAAAGAAATAAATGAAGACTTTATTAGACCAACTAGTGTGCCTTTTCCTATTTTATTTCGTATTATTAATTTGACCAAGACAGCTGATTTTATGTACAGAGAAGGTGGTGACCAATATACACATGTTGGAAA 1607
                |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| || ||   ||| ||| || | |||| ||| |||| ||| ||||| ||| ||||||||||
Sbjct:        1 ATGTTGGATTCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTCGAGTATGCAAAAGAAGAGATGAAAAGAATTATTAGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTGAATGAAGGATATTTGCCAAGGTTGGATGAGCATTTGAGAGTTTCATATGTTTCTTGTGGTTACGTTATGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAGATTGGCTCTCTAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCCACTCTCCTATCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCA------------AGAGAAATCACATACCATCTACAGTTGATTGTTACATGAAACAATATGGAGTATCAGAGGAAGAGGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGTCACCTACTGGAAAGAAATCAATGAAGACTTTATTAGGCCAACTGTTGTGCCTTTTCCTATCTTACTTCGTGTTCTTAATTTTACAAAAGTAGCAGATCTTCTTTACAAAGAGGGTGATGATCAATACACAAATGTTGGAAA 560

[Close]

BLAST of MN967477.1 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-14317_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 632.674 bits (342), Expect = 7.050e-180
Identity = 342/342 (100.00%), Postives = 342/342 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1021 ACATATTATAAGGTAATGTTGGAATCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAG 1362
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      373 ACATATTATAAGGTAATGTTGGAATCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAG 714

HSP 2 Score: 630.828 bits (341), Expect = 2.536e-179
Identity = 349/353 (98.87%), Postives = 349/353 (98.87%), Query Frame = 1

Query:      398 AAGACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGACGTTTCGGGTTTACTTAGTTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGGCCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATT 750
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:       20 AAGACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGATGTTTCGGGTTTGCTTAATTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGGCCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTACATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATT 372

[Close]

BLAST of MN967477.1 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-80525_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 603.128 bits (326), Expect = 5.527e-171
Identity = 438/494 (88.66%), Postives = 438/494 (88.66%), Query Frame = 1

Query:     1114 ATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAGTTTGAACAAGAGAGAAATCACGTACTATCTACAGTGGAATGTTACATGAAGCAATATGAGGTTTCAGAGGAAGAAGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGCCAATTGTTGGAAAGAAATAAATGAAGACTTTATTAGACCAACTAGTGTGCCTTTTCCTATTTTATTTCGTATTATTAATTTGACCAAGACAGCTGATTTTATGTACAGAGAAGGTGGTGACCAATATACACATGTTGGAAA 1607
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||| || || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| || || ||||  ||| || | |||| ||| || | ||| ||||| ||| ||||||||||
Sbjct:        1 ATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTGAGTGAAGGATATTTGCCAAGGTTGGATGAGCATTTGAGAGTTTCATATGTTTCTTGTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGTATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAAATTGTTTCAGCTTCCACTCTCCTTGCTAGGTTCATGGATGATATTGGTTCTCGCAAGTTTGAGCAAAAGAGAAATCACATACCATCTACAGTGGATTGTTACATGAAACAATATGGGGTATCAGAGGAAGAGGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGACACCCACTGGAAAGAAATTAATGAAGACTTTATTAGGCCAACTGTTGTGCCTTTTCCTATCTTAGTTCGTGTTCTTAATTTTACAAAAACAGTAGATCTTCTTTACAAAGAGGGCGATGATCAATACACAAATGTTGGAAA 494

[Close]

BLAST of MN967477.1 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-17784_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 514.489 bits (278), Expect = 2.664e-144
Identity = 415/482 (86.10%), Postives = 415/482 (86.10%), Query Frame = 1

Query:     1172 TGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAGTTTGAACAAGAGAGAAATCACGTACTATCTACAGTGGAATGTTACATGAAGCAATATGAGGTTTCAGAGGAAGAAGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGCCAATTGTTGGAAAGAAATAAATGAAGACTTTATTAGACCAACTAGTGTGCCTTTTCCTATTTTATTTCGTATTATTAATTTGACCAAGACAGC-T--GATTTTATGTACAGAGAAGGTGGTGACCAATATACACATGTTGGAAAGGTGTTGAAAGATAGCATTGCTGCTTTACTTATAGATCCAATC 1650
                ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| || ||||     ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  | || ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  | ||||||| ||||| ||| ||||| || ||||| | || || | ||  |  ||| || | |||| | | |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      191 TGCAAAGCTTCGATGAGCATTTGAAAGTTTCTTATGTTTCTTGTGCTTACACAACGTTAATCGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAAATTGTTTCGGCTTCGACTCTACTTGCTAGGTTCATGGATGATATTGGTTCTCGCAAGTTTGAGCAAGAGAGAAATCACATACCATCTACAGTGGAATGTTACATGAAGCAATATGGGGTATCAGAAAAAGAGGCAATTGAAGAACTGAATAAAAGAGTGGTCAATTATTGGAAAGAAATTAATGAAGACTTCATTAGGCCAACTGTTATGCCTTTCCCTATCTTAGTTCGTGTTCTTAATGTTAC-AA-A-AGTATTGGATCTTCTTTACAAAAATGGTGATGATCAATATACACATGTTGGAAAAGTGTTTAAAGAAAGCATTGCTGCTTTACTTATAGATCCAATC 669

[Close]

BLAST of MN967477.1 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-74151_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 510.796 bits (276), Expect = 3.446e-143
Identity = 310/327 (94.80%), Postives = 310/327 (94.80%), Query Frame = 1

Query:     1036 ATGTTGGAATCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAG 1362
                |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:        1 ATGTTGGATTCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTCGAGTATGCAAAAGAAGAGATGAAAAGAATTATTAGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTGAATGAAGGATATTTCCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTTTCATATGTTTCTTGTGGTTACATTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTTGGAATGTATGATATTGTAACACATGAAACTCTAGATTGGCTCTCTAAAGACCCTAAGATTATTTCAGCTTCCACTCTCCTATCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAG 327

[Close]

BLAST of MN967477.1 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-80521_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 477.556 bits (258), Expect = 3.496e-133
Identity = 274/282 (97.16%), Postives = 274/282 (97.16%), Query Frame = 1

Query:      398 AAGACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGACGTTTCGGGTTTACTTAGTTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGGCCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAG 679
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:       20 AAGACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGATGTTTCGGGTTTACTTAGTTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCATAGCCTTGCATAGGCCTCTAAGAAAGACCATAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTACATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAG 301

HSP 2 Score: 311.357 bits (168), Expect = 3.752e-83
Identity = 196/210 (93.33%), Postives = 196/210 (93.33%), Query Frame = 1

Query:      766 GAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTAGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAGG 975
                ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||
Sbjct:      301 GAGCATGAGTTTGTAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACTGTATTTTTGGATCTTGAATGTATATTATGAACCCAAATACTCTCGAGCAAGAAAGCTTTTGACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACTGATGATACTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTGAGCTTCTTACCAAAGCAATTCAAAGG 510

[Close]

BLAST of MN967477.1 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-80523_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 335.364 bits (181), Expect = 2.226e-90
Identity = 181/181 (100.00%), Postives = 181/181 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1036 ATGTTGGAATCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTG 1216
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:        1 ATGTTGGAATCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTG 181

HSP 2 Score: 122.999 bits (66), Expect = 1.887e-26
Identity = 66/66 (100.00%), Postives = 66/66 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1297 GACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAG 1362
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      181 GACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAG 246

[Close]

BLAST of MN967477.1 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-57795_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 130.386 bits (70), Expect = 1.128e-28
Identity = 163/209 (77.99%), Postives = 163/209 (77.99%), Query Frame = 1

Query:      778 GCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTAGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAGGTG-GGACATAA 985
                ||||| ||| | || ||||||||| ||||||||||||| || ||  |||||||| | || || | | |||||||  ||| ||||   ||||||||| |  |||  |||| |||| || || ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||| |||| || ||| ||||||| |  ||||  ||||||||
Sbjct:       31 GCAAACAAACTACCATTTGCAAGAAATAGGATTGTGGAGCTATACCTTTGGATACTAGGAGTCTTTCATGAACCTCAATTCTCTCTTGCAAGAAAAATCTTAATTAAAGCCATTTCAATGGCCTCAGTTGCAGATGATATTTATGATGCATATGGTACATTTGAAGAACTTGAGCTCCTCACCGAAGCAATTCTCAGGTTTGGACATAA 239


Match Name	Summary
PKGMv1-80524_t	E-Value: 0.000e+0, PID: 96.46 Description: No definition line [more]
PKGMv1-14315_t	E-Value: 0.000e+0, PID: 90.03 Description: No definition line [more]
PKGMv1-80520_t	E-Value: 0.000e+0, PID: 88.81 Description: No definition line [more]
PKGMv1-14317_t	E-Value: 7.050e-180, PID: 100.00 Description: No definition line [more]
PKGMv1-80525_t	E-Value: 5.527e-171, PID: 88.66 Description: No definition line [more]
PKGMv1-17784_t	E-Value: 2.664e-144, PID: 86.10 Description: No definition line [more]
PKGMv1-74151_t	E-Value: 3.446e-143, PID: 94.80 Description: No definition line [more]
PKGMv1-80521_t	E-Value: 3.496e-133, PID: 97.16 Description: No definition line [more]
PKGMv1-80523_t	E-Value: 2.226e-90, PID: 100.00 Description: No definition line [more]
PKGMv1-57795_t	E-Value: 1.128e-28, PID: 77.99 Description: No definition line [more]

blastn of TPS CDS against cs10 genome

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of MN967477.1 vs. Genbank
Match Name: NC_044377.1
Description: Cannabis sativa chromosome 6, cs10, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 595.741 bits (322), Expect = 6.890e-168
Identity = 358/376 (95.21%), Postives = 358/376 (95.21%), Query Frame = 1

Query:      382 ATATTTGAAAAATTTAAAGACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGACGTTTCGGGTTTACTTAGTTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGGCCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATTGTGAGGT 757
                |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 76737497 ATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGAAAGGTAATTTTAAGAAAAGTTTGATAACCGATGTTTCGGGTTTGCTTAGTTTGTATGAGGCTTCCTACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAATAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCATTGGAAAGGCCATTAAGAAAGACCATAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAACTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAATGGAGCTTAGTGAAATTATGAGGT 76737122

HSP 2 Score: 593.895 bits (321), Expect = 2.478e-167
Identity = 359/378 (94.97%), Postives = 359/378 (94.97%), Query Frame = 1

Query:      380 GTATATTTGAAAAATTTAAAGACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGACGTTTCGGGTTTACTTAGTTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGGCCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATTGTGAGGT 757
                ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct: 76691963 GTATATTTGAAAAATTTAAGGACGCTGAAGGTAATTTTGAGAAAAGCTTGATAACCGATGTTTCGGGTTTACTTAGTTTGTATGAGGCTTCGCACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGACGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCATAGCCTTGCATAGGCCTCTAAGAAAGACCATAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTACATCTCAATCTATGAAAAGGATGTCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGACCTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAACTTAGTGAAATTATGAGGT 76691586

HSP 3 Score: 573.582 bits (310), Expect = 3.229e-161
Identity = 354/376 (94.15%), Postives = 354/376 (94.15%), Query Frame = 1

Query:      382 ATATTTGAAAAATTTAAAGACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGACGTTTCGGGTTTACTTAGTTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGGCCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATTGTGAGGT 757
                |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct: 76675533 ATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGAAAGGTAACTTTAAAGAAAGCCTAATAACCGATGTTTCAGGTTTGCTTAGCTTGTATGAGGCTTCGCACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAAATCATCCATTATCACATCAAATATCCATAGCCTTGGAAAGGCCTCTAAGAAAGACCATAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTACATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAACTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATGTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAACTTAGTGAAATTATGAGGT 76675158

HSP 4 Score: 560.655 bits (303), Expect = 2.514e-157
Identity = 353/378 (93.39%), Postives = 353/378 (93.39%), Query Frame = 1

Query:      380 GTATATTTGAAAAATTTAAAGACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGACGTTTCGGGTTTACTTAGTTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGGCCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATTGTGAGGT 757
                |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||
Sbjct: 76710169 GTATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGGAAGGTAACTTTAAAGAAAGCCTAATAACCGATGTTCCAGGTTTGCTTAGCTTGTATGAGGCTTCGCACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCATAGTCCTGCATAGGCCTCTAAGAAAGACCATAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTACATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAACTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAACTTAGTGAAATTACGAGGT 76709792

HSP 5 Score: 442.47 bits (239), Expect = 9.499e-122
Identity = 249/254 (98.03%), Postives = 249/254 (98.03%), Query Frame = 1

Query:      129 GGTTTGCAAACAAGAAAGAATTGAAGAATTAATACAAGTTGTGAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCACATCATTTTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCATCATCAAAATCATCAAGATCTACATGATGCTTCTCTTTGGTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTA 382
                ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 76692297 GGTTTGCAAACAAGAAAAAGTTGAAGAATTAATACAAGTTGTGAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTACCACATCATTTTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCATCATCAAAATCATCATGATCTACATGATGCTTCTCTTCGGTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTA 76692044

HSP 6 Score: 422.156 bits (228), Expect = 1.238e-115
Identity = 246/254 (96.85%), Postives = 246/254 (96.85%), Query Frame = 1

Query:      129 GGTTTGCAAACAAGAAAGAATTGAAGAATTAATACAAGTTGTGAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCACATCATTTTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCATCATCAAAATCATCAAGATCTACATGATGCTTCTCTTTGGTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTA 382
                ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 76710500 GGTTTGCAAACAAGAAAAAGTTGAAGAATTAATACAAGTTGTAAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCATATCATTTTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTATC---ACTCATCATCAAAATCATCATGATCTACATGATGCTTCTCTTTGGTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTA 76710250

HSP 7 Score: 398.15 bits (215), Expect = 2.086e-108
Identity = 239/251 (95.22%), Postives = 239/251 (95.22%), Query Frame = 1

Query:     1112 AGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAG 1362
                ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 76689142 AGATGAAAAGAATTATTAGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTCCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTTTCATATGTTTCTTGTGGTTACGTTATGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAGATTGGCTCTCTAAAGACCCTAAGATTATTTCAGCTTCCACTCTCCTATCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAG 76688892

HSP 8 Score: 387.07 bits (209), Expect = 4.514e-105
Identity = 237/251 (94.42%), Postives = 237/251 (94.42%), Query Frame = 1

Query:     1112 AGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAG 1362
                |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 76672663 AGATGAAAAGAACTATTGGAGGTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTGAATGAAGGATATTTCCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTTTCATATGTTTCTTCTGCTAACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTTTGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAGATTGGCTCTCCAAACACCCTAACATTGTTTCAGCTTCCACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAG 76672413

HSP 9 Score: 381.53 bits (206), Expect = 2.100e-103
Identity = 222/230 (96.52%), Postives = 222/230 (96.52%), Query Frame = 1

Query:      747 AATTGTGAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTAGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAGGT 976
                |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 76640283 AATTATTAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTCAAGCAAGAAAGCTTTTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACTGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCCAAGCAATGCAGAGGT 76640054

HSP 10 Score: 372.297 bits (201), Expect = 1.264e-100
Identity = 237/254 (93.31%), Postives = 237/254 (93.31%), Query Frame = 1

Query:      129 GGTTTGCAAACAAGAAAGAATTGAAGAATTAATACAAGTTGTGAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCACATCATTTTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCATCATCAAAATCATCAAGATCTACATGATGCTTCTCTTTGGTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTA 382
                ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |  ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 76675873 GGTTTGCAAACAAGAAAGAGTTGAAGAATTAATACAAGTTGTAAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCATATCATTTCGAGAGTGAAATCGAGAAATTATTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCATCATCAAAATAAT-AATA--TACATGATGTTTCTCTTCGGTTTAGACTATTAAGACAAAGTGGATTTAAGGTTTCATCAAGTA 76675623

HSP 11 Score: 370.45 bits (200), Expect = 4.546e-100
Identity = 234/251 (93.23%), Postives = 234/251 (93.23%), Query Frame = 1

Query:     1112 AGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAG 1362
                ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||
Sbjct: 76704585 AGATGAAAAGAATTATTGGAGGTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTGAATGAAGGATATTTCCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATGTTTCTTCTGGTAACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTTTGTAGGGATGCATGATGTTGTAACACATGAAACTCTAGATTGGCTCTCGAAAGACCCTAAAATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTTTCTAGGTTCATGGATGATATTGGTTCTCGCAAG 76704335

HSP 12 Score: 370.45 bits (200), Expect = 4.546e-100
Identity = 220/230 (95.65%), Postives = 220/230 (95.65%), Query Frame = 1

Query:      747 AATTGTGAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTAGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAGGT 976
                |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct: 76709319 AATTATTAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTCGAGCAAGGAAGCTTTTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACTGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATTCAAAGGT 76709090

HSP 13 Score: 342.75 bits (185), Expect = 9.911e-92
Identity = 215/230 (93.48%), Postives = 215/230 (93.48%), Query Frame = 1

Query:      747 AATTGTGAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTAGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAGGT 976
                |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct: 76691059 AATTATTAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGTAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGAATGTATATTATGAACCCAAATACTCTCGAGCAAGAAAGCTTTTGACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACTGATGATACTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTGAGCTTCTTACCAAAGCAATTCAAAGGT 76690830

HSP 14 Score: 337.211 bits (182), Expect = 4.611e-90
Identity = 214/230 (93.04%), Postives = 214/230 (93.04%), Query Frame = 1

Query:      747 AATTGTGAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTAGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAGGT 976
                |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct: 76674627 AATTATTAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGTAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACTATATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTCGAGCAAGAAAGCTTTTGACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACTGGTGATACTTATGATGCATATGGTACTATTGATAAGCTTGAGCTTCTTACCAAAGCAATTCAAAGGT 76674398

HSP 15 Score: 303.971 bits (164), Expect = 4.677e-80
Identity = 251/293 (85.67%), Postives = 251/293 (85.67%), Query Frame = 1

Query:     1361 AGTTTGAACAAGAGAGAAATCACGTACTATCTACAGTGGAATGTTACATGAAGCAATATGAGGTTTCAGAGGAAGAAGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGCCAATTGTTGGAAAGAAATAAATGAAGACTTTATTAGACCAACTAGTGTGCCTTTTCCTATTTTATTTCGTATTATTAATTTGACCAAGACAGC-T--GATTTTATGTACAGAGAAGGTGGTGACCAATATACACATGTTGGAAAGGTGTTGAAAGATAGCATTGCTGCTTTACTTATAGATCCAATC 1650
                ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  | ||||||| ||||| ||| ||||| || ||||| | || || | ||  |  ||| || | |||| | | |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 76733333 AGTTTGAGCAAGAGAGAAATCACATACCATCTACAGTGGAATGTTACATGAAGCAATATGAGGTATCAGAAAAAGAGGCAATTGAAGAACTGAATAAAAGAGTGGTCAATTATTGGAAAGAAATTAATGAAGACTTCATTAGGCCAACTGTTATGCCTTTCCCTATCTTAGTTCGTGTTCTTAATGTTAC-AA-A-AGTATTGGATCTTCTTTACAAAAATGGTGATGATCAATATACACATGTTGGAAAAGTGTTTAAAGAAAGCATTGCTGCTTTACTTATAGATCCAATC 76733044

HSP 16 Score: 292.891 bits (158), Expect = 1.012e-76
Identity = 226/259 (87.26%), Postives = 226/259 (87.26%), Query Frame = 1

Query:     1105 AAAGAAGAGATGAAAAGAATT-ATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAG 1362
                ||| || ||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| || ||||     ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  | || ||||||||||| || || |||||||||
Sbjct: 76734174 AAA-AACAGATGAAAA-AATTGATTCGAGCTTATTTAGAAGAAGCTCGATGGTTGAACGATGGATACTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAAAGTTTCTTATGTTTCTTGTGCTTACACAACGTTAATCGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAAATTGTTTCGGCTTCCACTCTACTTGCTAGGTTCATGGATGATATTGGTTCTCGCAAG 76733918

HSP 17 Score: 287.351 bits (155), Expect = 4.710e-75
Identity = 245/290 (84.48%), Postives = 245/290 (84.48%), Query Frame = 1

Query:     1361 AGTTTGAACAAGAGAGAAATCACGTACTATCTACAGTGGAATGTTACATGAAGCAATATGAGGTTTCAGAGGAAGAAGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGCCAATTGTTGGAAAGAAATAAATGAAGACTTTATTAGACCAACTAGTGTGCCTTTTCCTATTTTATTTCGTATTATTAATTTGACCAAGACAGCTGATTTTATGTACAGAGAAGGTGGTGACCAATATACACATGTTGGAAAGGTGTTGAAAGATAGCATTGCTGCTTTACTTATAGATCCAATC 1650
                ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| || ||   ||| ||| || | |||| ||| |||| ||| ||||| ||| |||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct: 76688258 AGTTTGAGCAACAGAGAAATCACATACCATCTACAGTTGATTGTTACATGAAACAATATGGAGTATCAGAGGAAGAGGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGTCACCTACTGGAAAGAAATTAATGAAGACTTTATTAGGCCAACTGTTGTGCCTTTTCCTATCTTACTTCGTGTTCTTAATTTTACAAAAGTAGCAGATCTTCTTTACAAAGAGGGTGATGATCAATACACAAATGTTGGAAAAGTGCTCAAAGAAAGCATTGCTGCTTTGCTTATAGATTCAATC 76687969

HSP 18 Score: 276.271 bits (149), Expect = 1.020e-71
Identity = 244/291 (83.85%), Postives = 244/291 (83.85%), Query Frame = 1

Query:     1361 AGTTTGAACAAGAGAGAAATCACGTACTATCTACAGTGGAATGTTACATGAAGCAATATGAGGTTTCAGAGGAAGAAGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGCCAATTGTTGGAAAGAAATAAATGAAGACTTTATTAGACCAACTAG-TGTGCCTTTTCCTATTTTATTTCGTATTATTAATTTGACCAAGACAGCTGATTTTATGTACAGAGAAGGTGGTGACCAATATACACATGTTGGAAAGGTGTTGAAAGATAGCATTGCTGCTTTACTTATAGATCCAATC 1650
                ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || |||||| |||||||| ||| ||||| || ||||||| || || | ||  ||| || | |||| ||| || | ||| ||||| ||| |||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct: 76703321 AGTTTGAGCAAAAGAGAAATCACATACCATCTACAGTGGATTGTTACATGAAACAATATGGGGTATCAGAGGAAGAGGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGACACCCACTGGAAAGAAATTAATGAAGACTTTATTAGGCCAGC-AGTTGTGCCCTTTCCTATCTTAGTTCGTGTTCTTAATTTTACAAAAATAGTAGATCTTCTTTACAAAGAGGGCGATGATCAATACACAAATGTTGGAAAAGTGCTCAAAGAAAGCATTGCTGCTTTGCTTATAGATTCAATC 76703032

HSP 19 Score: 239.338 bits (129), Expect = 1.338e-60
Identity = 137/141 (97.16%), Postives = 137/141 (97.16%), Query Frame = 1

Query:      973 AGGTGGGACATAAATTGTATGGATAAACTTGAGCCAGAATATTTGAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGAATCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAG 1113
                |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 76689370 AGGTGGGACATAAATTGTCTGGATAAACTTGAGCCAGAATATTTAAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGATTCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTCGAGTATGCAAAAGAAGAG 76689230

HSP 20 Score: 239.338 bits (129), Expect = 1.338e-60
Identity = 137/141 (97.16%), Postives = 137/141 (97.16%), Query Frame = 1

Query:      973 AGGTGGGACATAAATTGTATGGATAAACTTGAGCCAGAATATTTGAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGAATCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAG 1113
                |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 76704821 AGGTGGGACATAAATTGTATGGATAAACTTAAGCAAGAATATTTAAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGATTCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAG 76704681

HSP 21 Score: 226.412 bits (122), Expect = 1.041e-56
Identity = 128/131 (97.71%), Postives = 128/131 (97.71%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTAAGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGCGATCGATTCCTCCATTACAATGTTTCAGAACAAGACTTGGT 131
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 76692545 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTATGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGTGATCGATTCCTCCATTACAATATTTCAGAACAAGACTTGGT 76692415

HSP 22 Score: 226.412 bits (122), Expect = 1.041e-56
Identity = 128/131 (97.71%), Postives = 128/131 (97.71%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTAAGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGCGATCGATTCCTCCATTACAATGTTTCAGAACAAGACTTGGT 131
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 76710752 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTAAGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAACAAAATTTCACCCTTCTATTTGGGGTGATCGATTCCTCCATTACAATATTTCAGAACAAGACTTGGT 76710622

HSP 23 Score: 215.332 bits (116), Expect = 2.254e-53
Identity = 126/131 (96.18%), Postives = 126/131 (96.18%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTAAGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGCGATCGATTCCTCCATTACAATGTTTCAGAACAAGACTTGGT 131
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 76676121 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTATGTGACAAAATTATTGCTCGCCCAACAACAAAATTTCACCCTTCTATTTGGGGTGATCGATTCCTCCATTACAATATTTCAGAACAAGACTTGGT 76675991

HSP 24 Score: 200.558 bits (108), Expect = 6.312e-49
Identity = 130/141 (92.20%), Postives = 130/141 (92.20%), Query Frame = 1

Query:      973 AGGTGGGACATAAATTGTATGGATAAACTTGAGCCAGAATATTTGAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGAATCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAG 1113
                ||||||||||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 76639961 AGGTGGGACATAAGTTATATAGATAAACTTGAACCTGAATATTTGAAGACATATTATAAGGCAATGTTGGATTCTTATGAAGAGTTTGAAAAAGAGCTTAAAAAGAAAGAAATATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAG 76639821

HSP 25 Score: 189.479 bits (102), Expect = 1.366e-45
Identity = 128/141 (90.78%), Postives = 128/141 (90.78%), Query Frame = 1

Query:      973 AGGTGGGACATAAATTGTATGGATAAACTTGAGCCAGAATATTTGAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGAATCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAG 1113
                |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||
Sbjct: 76734487 AGGTGGGACATAAATTTTATAGATAAACTTGAGCCAGAATATTTGAAGACATATTATAAAGCAATGTTGACTTCTTATGAAGAATTTGAAAAAGAGTTTACAAAGGAAGAATTATACAAACATCAATATGCAAAAGAAGAG 76734347

HSP 26 Score: 143.312 bits (77), Expect = 1.079e-31
Identity = 167/210 (79.52%), Postives = 167/210 (79.52%), Query Frame = 1

Query:      754 AGGTGGTGGAAGGAGCAT-GAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACC-CAAAT-ACTCTAGAGCAAGAA-AACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTAC 959
                ||||||||||| ||  || || |||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |||| || || | | |||||||  || |  | || | |||||||  | ||| ||| ||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||| |||||
Sbjct: 21352992 AGGTGGTGGAAAGA-AATAGACTTTGTACACAAACTACCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAGCTATACCTTTGGCTATTAGGAGTTTTTCATGAACCTGAATTGTCACT-G-GCAAGAATTATTTC-AACAAAAGTTATTGCATTGGCCTCAGTTGCAGATGATATTTATGATGCATATGGTACATTTGAAGAGCTTGAGCTCCTTAC 21353197

[Close]

BLAST of MN967477.1 vs. Genbank
Match Name: NC_044372.1
Description: Cannabis sativa chromosome 3, cs10, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 204.252 bits (110), Expect = 4.880e-50
Identity = 130/140 (92.86%), Postives = 130/140 (92.86%), Query Frame = 1

Query:      837 TGTATATTATGAACCCAAATACTCTAGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAGGT 976
                ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct: 12551067 TGTATATTATGAACCCAAATACTCTCGAGCAAGAAAGCTTTTGACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACTGATGATGCTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTGAGCTTCTTACCAAAGCAATTCAAAGGT 12551206


Match Name	Summary
NC_044377.1	E-Value: 6.890e-168, PID: 95.21 Description: Cannabis sativa chromosome 6, cs10, whole genome shotgun sequence [more]
NC_044372.1	E-Value: 4.880e-50, PID: 92.86 Description: Cannabis sativa chromosome 3, cs10, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of MN967477.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030622956.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa alpha-humulene synthase-like (LOC115695865), mRNA

HSP 1 Score: 2488.56 bits (1347), Expect = 0.000e+0
Identity = 1549/1650 (93.88%), Postives = 1549/1650 (93.88%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTAAGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGCGATCGATTCCTCCATTACAATGTTTCAGAACAAGACTTGGTTTGCAAACAAGAAAGAATTGAAGAATTAATACAAGTTGTGAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCACATCATTTTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCATCATCAAAATCATCAAGATCTACATGATGCTTCTCTTTGGTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTATATTTGAAAAATTTAAAGACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGACGTTTCGGGTTTACTTAGTTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGGCCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATTGTGAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTAGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAGGTGGGACATAAATTGTATGGATAAACTTGAGCCAGAATATTTGAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGAATCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAGTTTGAACAAGAGAGAAATCACGTACTATCTACAGTGGAATGTTACATGAAGCAATATGAGGTTTCAGAGGAAGAAGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGCCAATTGTTGGAAAGAAATAAATGAAGACTTTATTAGACCAACTAGTGTGCCTTTTCCTATTTTATTTCGTATTATTAATTTGACCAAGACAGCTGATTTTATGTACAGAGAAGGTGGTGACCAATATACACATGTTGGAAAGGTGTTGAAAGATAGCATTGCTGCTTTACTTATAGATCCAATC 1650
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| || ||   ||| ||| || | |||| ||| |||| ||| ||||| ||| |||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct:       33 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTATGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGTGATCGATTCCTCCATTACAATATTTCAGAACAAGACTTGGTTTGCAAACAAGAAAAAGTTGAAGAATTAATACAAGTTGTGAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTACCACATCATTTTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCATCATCAAAATCATCATGATCTACATGATGCTTCTCTTCGGTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTATATTTGAAAAATTTAAGGACGCTGAAGGTAATTTTGAGAAAAGCTTGATAACCGATGTTTCGGGTTTACTTAGTTTGTATGAGGCTTCGCACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGACGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCATAGCCTTGCATAGGCCTCTAAGAAAGACCATAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTACATCTCAATCTATGAAAAGGATGTCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGACCTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAACTTAGTGAAATTATGAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGTAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGAATGTATATTATGAACCCAAATACTCTCGAGCAAGAAAGCTTTTGACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACTGATGATACTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTGAGCTTCTTACCAAAGCAATTCAAAGGTGGGACATAAATTGTCTGGATAAACTTGAGCCAGAATATTTAAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGATTCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTCGAGTATGCAAAAGAAGAGATGAAAAGAATTATTAGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTCCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTTTCATATGTTTCTTGTGGTTACGTTATGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAGATTGGCTCTCTAAAGACCCTAAGATTATTTCAGCTTCCACTCTCCTATCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAGTTTGAGCAACAGAGAAATCACATACCATCTACAGTTGATTGTTACATGAAACAATATGGAGTATCAGAGGAAGAGGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGTCACCTACTGGAAAGAAATTAATGAAGACTTTATTAGGCCAACTGTTGTGCCTTTTCCTATCTTACTTCGTGTTCTTAATTTTACAAAAGTAGCAGATCTTCTTTACAAAGAGGGTGATGATCAATACACAAATGTTGGAAAAGTGCTCAAAGAAAGCATTGCTGCTTTGCTTATAGATTCAATC 1682

[Close]

BLAST of MN967477.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030622957.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa germacrene-A synthase (LOC115695866), transcript variant X1, mRNA

HSP 1 Score: 2423.92 bits (1312), Expect = 0.000e+0
Identity = 1539/1651 (93.22%), Postives = 1539/1651 (93.22%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTAAGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGCGATCGATTCCTCCATTACAATGTTTCAGAACAAGACTTGGTTTGCAAACAAGAAAGAATTGAAGAATTAATACAAGTTGTGAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCACATCATTTTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCATCATCAAAATCATCAAGATCTACATGATGCTTCTCTTTGGTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTATATTTGAAAAATTTAAAGACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGACGTTTCGGGTTTACTTAGTTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGGCCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATTGTGAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTAGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAGGTGGGACATAAATTGTATGGATAAACTTGAGCCAGAATATTTGAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGAATCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAGTTTGAACAAGAGAGAAATCACGTACTATCTACAGTGGAATGTTACATGAAGCAATATGAGGTTTCAGAGGAAGAAGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGCCAATTGTTGGAAAGAAATAAATGAAGACTTTATTAGACCAACTAG-TGTGCCTTTTCCTATTTTATTTCGTATTATTAATTTGACCAAGACAGCTGATTTTATGTACAGAGAAGGTGGTGACCAATATACACATGTTGGAAAGGTGTTGAAAGATAGCATTGCTGCTTTACTTATAGATCCAATC 1650
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || |||||| |||||||| ||| ||||| || ||||||| || || | ||  ||| || | |||| ||| || | ||| ||||| ||| |||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct:       76 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTAAGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAACAAAATTTCACCCTTCTATTTGGGGTGATCGATTCCTCCATTACAATATTTCAGAACAAGACTTGGTTTGCAAACAAGAAAAAGTTGAAGAATTAATACAAGTTGTAAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCATATCATTTTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTAT---CACTCATCATCAAAATCATCATGATCTACATGATGCTTCTCTTTGGTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGGAAGGTAACTTTAAAGAAAGCCTAATAACCGATGTTCCAGGTTTGCTTAGCTTGTATGAGGCTTCGCACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCATAGTCCTGCATAGGCCTCTAAGAAAGACCATAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTACATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAACTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAACTTAGTGAAATTACGAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTCGAGCAAGGAAGCTTTTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACTGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATTCAAAGGTGGGACATAAATTGTATGGATAAACTTAAGCAAGAATATTTAAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGATTCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAGATGAAAAGAATTATTGGAGGTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTGAATGAAGGATATTTCCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATGTTTCTTCTGGTAACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTTTGTAGGGATGCATGATGTTGTAACACATGAAACTCTAGATTGGCTCTCGAAAGACCCTAAAATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTTTCTAGGTTCATGGATGATATTGGTTCTCGCAAGTTTGAGCAAAAGAGAAATCACATACCATCTACAGTGGATTGTTACATGAAACAATATGGGGTATCAGAGGAAGAGGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGACACCCACTGGAAAGAAATTAATGAAGACTTTATTAGGCCAGC-AGTTGTGCCCTTTCCTATCTTAGTTCGTGTTCTTAATTTTACAAAAATAGTAGATCTTCTTTACAAAGAGGGCGATGATCAATACACAAATGTTGGAAAAGTGCTCAAAGAAAGCATTGCTGCTTTGCTTATAGATTCAATC 1722

[Close]

BLAST of MN967477.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030622955.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa alpha-humulene synthase (LOC115695864), mRNA

HSP 1 Score: 2329.75 bits (1261), Expect = 0.000e+0
Identity = 1524/1653 (92.20%), Postives = 1524/1653 (92.20%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTAAGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGCGATCGATTCCTCCATTACAATGTTTCAGAACAAGACTTGGTTTGCAAACAAGAAAGAATTGAAGAATTAATACAAGTTGTGAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCACATCATTTTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCATCATCAAAATCATCAAGATCTACATGATGCTTCTCTTTGGTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTATATTTGAAAAATTTAAAGACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGACGTTTCGGGTTTACTTAGTTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGGCCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATTGTGAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTAGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAGGTGGGACATAAATTGTATGGATAAACTTGAGCCAGAATATTTGAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGAATCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAGTTTGAACAAGAGAGAAATCACGTACTATCTACAGTGGAATGTTACATGAAGCAATATGAGGTTTCAGAGGAAGAAGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGCCAATTGTTGGAAAGAAATAAATGAAGACTTTATTAGACCAACTAGTGTGCCTTTTCCTATTTTATTTCGTATTATTAATTTGACCAA-G-AC-AGCTGATTTTATGTACAGAGAAGGTGGTGACCAATATACACATGTTGGAAAGGTGTTGAAAGATAGCATTGCTGCTTTACTTATAGATCCAATC 1650
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||     ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| || || | |  || |  |||| | |||| ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||| | | | ||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||
Sbjct:       47 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTATGTGACAAAATTATTGCTCGCCCAACAACAAAATTTCACCCTTCTATTTGGGGTGATCGATTCCTCCATTACAATATTTCAGAACAAGACTTGGTTTGCAAACAAGAAAGAGTTGAAGAATTAATACAAGTTGTAAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCATATCATTTCGAGAGTGAAATCGAGAAATTATTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCATCATCAAAATAAT--A-ATATACATGATGTTTCTCTTCGGTTTAGACTATTAAGACAAAGTGGATTTAAGGTTTCATCAAGCATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGAAAGGTAACTTTAAAGAAAGCCTAATAACCGATGTTTCAGGTTTGCTTAGCTTGTATGAGGCTTCGCACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAAATCATCCATTATCACATCAAATATCCATAGCCTTGGAAAGGCCTCTAAGAAAGACCATAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTACATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAACTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATGTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAACTTAGTGAAATTATGAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGTAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACTATATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTCGAGCAAGAAAGCTTTTGACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACTGGTGATACTTATGATGCATATGGTACTATTGATAAGCTTGAGCTTCTTACCAAAGCAATTCAAAGGTGGGACATAAATTGTCTGGATAAACTTGAGCCAGAATATTTAAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGATTCTTATGAAGAATTTGAGAAGGAGCTTAAAAAAGAAGAATTATACAAACTCGAGTATGCAAAAGAAGAGATGAAAAGAACTATTGGAGGTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTGAATGAAGGATATTTCCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTTTCATATGTTTCTTCTGCTAACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTTTGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAGATTGGCTCTCCAAACACCCTAACATTGTTTCAGCTTCCACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAGTTTGAGCAAGAGAGAAATCACATACCATCTACAGTGGATTGTTACATGAAACAATACGGGGTATCAGAGGAAGAGGCAATTAAAGAACTTAATAAAAAAGTGGTCACCCACTGGAAAGAAATTAATGAAGATTTTATTAGGCCAACTGTTGTGCCTTTTCCTATCTTAGTTCGTGTTCTTAATTTTACAAAAGTAATAGATC-TTTT-T-TACAAAGAGGGTGATGATCAATACACACGTGTTGGAAAAGCGCTCAAAGAAAGCATTGATGCTTTGCTTATAGATTCAATC 1693

[Close]

BLAST of MN967477.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030622958.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa germacrene-A synthase (LOC115695866), transcript variant X2, mRNA

HSP 1 Score: 1786.83 bits (967), Expect = 0.000e+0
Identity = 1065/1113 (95.69%), Postives = 1065/1113 (95.69%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTAAGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGCGATCGATTCCTCCATTACAATGTTTCAGAACAAGACTTGGTTTGCAAACAAGAAAGAATTGAAGAATTAATACAAGTTGTGAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCACATCATTTTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCATCATCAAAATCATCAAGATCTACATGATGCTTCTCTTTGGTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTATATTTGAAAAATTTAAAGACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGACGTTTCGGGTTTACTTAGTTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGGCCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATTGTGAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTAGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAGGTGGGACATAAATTGTATGGATAAACTTGAGCCAGAATATTTGAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGAATCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAG 1113
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:       78 ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTAAGTGACAAAATTATTGCTCGTCCAACAACAAAATTTCACCCTTCTATTTGGGGTGATCGATTCCTCCATTACAATATTTCAGAACAAGACTTGGTTTGCAAACAAGAAAAAGTTGAAGAATTAATACAAGTTGTAAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCATATCATTTTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTAT---CACTCATCATCAAAATCATCATGATCTACATGATGCTTCTCTTTGGTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGGAAGGTAACTTTAAAGAAAGCCTAATAACCGATGTTCCAGGTTTGCTTAGCTTGTATGAGGCTTCGCACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCATAGTCCTGCATAGGCCTCTAAGAAAGACCATAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTACATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAACTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAACTTAGTGAAATTACGAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTCGAGCAAGGAAGCTTTTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACTGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATTCAAAGGTGGGACATAAATTGTATGGATAAACTTAAGCAAGAATATTTAAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGATTCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAG 1187

HSP 2 Score: 276.271 bits (149), Expect = 7.604e-73
Identity = 244/291 (83.85%), Postives = 244/291 (83.85%), Query Frame = 1

Query:     1361 AGTTTGAACAAGAGAGAAATCACGTACTATCTACAGTGGAATGTTACATGAAGCAATATGAGGTTTCAGAGGAAGAAGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGCCAATTGTTGGAAAGAAATAAATGAAGACTTTATTAGACCAACTAG-TGTGCCTTTTCCTATTTTATTTCGTATTATTAATTTGACCAAGACAGCTGATTTTATGTACAGAGAAGGTGGTGACCAATATACACATGTTGGAAAGGTGTTGAAAGATAGCATTGCTGCTTTACTTATAGATCCAATC 1650
                ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || |||||| |||||||| ||| ||||| || ||||||| || || | ||  ||| || | |||| ||| || | ||| ||||| ||| |||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct:     1186 AGTTTGAGCAAAAGAGAAATCACATACCATCTACAGTGGATTGTTACATGAAACAATATGGGGTATCAGAGGAAGAGGCAATTAAAGAACTTAATAAAAGAGTGGACACCCACTGGAAAGAAATTAATGAAGACTTTATTAGGCCAGC-AGTTGTGCCCTTTCCTATCTTAGTTCGTGTTCTTAATTTTACAAAAATAGTAGATCTTCTTTACAAAGAGGGCGATGATCAATACACAAATGTTGGAAAAGTGCTCAAAGAAAGCATTGCTGCTTTGCTTATAGATTCAATC 1475

[Close]

BLAST of MN967477.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030655054.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa alpha-humulene synthase (LOC115725506), mRNA

HSP 1 Score: 606.821 bits (328), Expect = 2.374e-172
Identity = 1211/1638 (73.93%), Postives = 1211/1638 (73.93%), Query Frame = 1

Query:       49 ATTGCTCGTCCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGCGATCGATTCCTCCATTACAATGTTTCAGAACAAGACTTGGTTTGC-A-AACAAG-AAAGAATTGAAGAATTAATACAAGTTGTGAAGAAAGA-G-A-TATT---ATCTTCAAATCATG-ATCA-A----TTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCACATCATTTTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACA-ATTAAGTATCGGCACTCATCATCAAAA--TC----ATCAAGATCTACATGATGCTTCTCTTTGGTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTATATTTGAAAAATTTAAAGACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGACGTTTCGGGTTTACTTAGTTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTT-A-AGGCTATTGTGGCAAATAGTAAAGA-TCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGGCCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAATC-TATG-AAA-AGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATTGTGAGGTGGTGGAAGGAGCAT-GAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACC-CAAAT-ACTCTAGAGCAAGAA-AACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAGGTGGGACATAAATTGTATGGATAAACTTGAGCCAGAATATTTGAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGAATCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAGATGAAAAGAATTA-TTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTCTCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTT-ATGTAGGAATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACCCTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATAGGCTCTCGCAAGTTTGAACAAGAGAGAAATCACGTACTATCTACAGTGGAATGTTACATGAAGCAATATGAGGTTTCAGAGGAAGAAGCAATTAAAGAACTTAATAAAAG-AGTGGCCAATTGTTGGAAAGAAATAAATGAAGACTTTATTAGACCAACTAGTGTGCCTTTTCCTATTTTATTTCGTATTATTAATTTGACCA-AGACAGCTGATTTTATGTACAGAGAAGGTGGTGACCAATATACACATGTTGGAAAGGTGTTGAAAGATAGCATTGCTGCTTTACTTATAGATCCAATC 1650
                |||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||  |||| ||||| || | | ||||||| ||||||||   | || | || ||| |  || |||| |||||||   |||| || | || ||| | | | ||   || ||   || |||  ||| |    |||||| |  | ||  || | |||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||| || |||  | |  |||| ||| |  ||   ||||  |||||||||   |    || ||||| |||||||  |||||    | |||||| ||||  | |||||||||||||  |||||||| | ||||||| ||| ||||||||| ||  |||| || |||||| |  |||||||||| ||| ||   ||||| || || || |||||||| ||||| || || ||| |||| || |  ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |   | | |||||  |||| | ||| |  |||||||||||| || || |||    ||||||| | || ||  |||||| || | |||||||||| || || |||  ||| || ||| || || | ||| | |||   ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||||| || | ||| ||||||||| |||||   ||||||||||| ||  || || |||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |||| || || | | |||||||  || |  | || | |||||||  | ||| ||| ||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||| |||||  || ||||  | ||||||||| ||||||||  |||| |||||   ||||||| |||  |||||| |||||||||  | ||  | | ||||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||   |||||| || | || |||| ||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||    ||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||||||||  || ||||  ||||||| ||| |||    || ||||||  ||   || |  | || ||| | |||  ||||||| |  ||  | |  | |||||||| |||||||| |||||  |   || ||  | | |||| |  || |||||||||||||||| |||||  |||||||| ||| | ||| ||||   ||  ||||| || ||  ||||||||| |||||||| ||| |||||  |||| |||  | | || || || |||   ||||   ||||  ||||||||||||||  |||  ||  | || ||  ||| |||||||| |||  |||||| || | || | |||||  | | ||  |   ||| || | |||| ||| |||| || |   ||||| ||| ||||||| | |   ||| ||||  ||| ||| ||||||||||||| ||||
Sbjct:      106 ATTGTTCGTCCAACAACAACTTATCAACCTTCTATTTGGGGGGAGAGATTTCTCCAATATAGTATTTCAGACCAAGACTT---TAGCTATAAAAAGCAGCGAGTTGACGAATTAAAGGAAGTGGTAAGGAGAGAGGTATTTTTAGAATGTTATGATAATGTTTCATATGTGTTGAAGATAGTGGATGATGTTCAACGTTTGGGATTGTCGTATCATTTTGAAAATGAAATAGAAAAAGCGCTACAACACATTTACGAT-AACACTATTCATCAAAACCACAAAGATGAAGATTTACATGACACTTCTACCCGCTTTAGACTATTGCGCCAACATGGATTTATGGTTTCATCTAATATATTTAAAATATTTAAAGATGAGCAAGGGAATTTTAAGGAGTGCTTGATAACTGACATTCTTGGTTTGCTGAGCTTATATGAGGCCTCACATTTAAGCTATATTGGCGAGAATATATTAAATGAAGCACTTGCTTTCACCACCACTCACCTTCATCAG-T-TTGTGAAAAAT-GAAAAAACACATCCATTATCAAATGAAGTATTACTAGCCTTGCAGAGACCTATAAGAAAGAGCCTAGAGAGGCTCCACGCCAGGCATTACATTTCA-TCTTACGAAAACAAGAT--TTCTCATAACAAAACATTGCTAGAACTTGCAAAGTTGGATTTCAATCTATTACAATGTTTGCATAGAAAAGAGCTTAGTCAAATTTCCAGGTGGTGGAAAGA-AATAGACTTTGTACACAAACTACCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAGCTATACCTTTGGCTATTAGGAGTTTTTCATGAACCTGAATTGTCACT-G-GCAAGAATTATTTC-AACAAAAGTTATTGCATTGGCCTCAGTTGCAGATGATATTTATGATGCATATGGTACATTTGAAGAGCTTGAGCTCCTTACTGAATCAATTAATAGGTGGGACTTAAATTGTGCGGATCAACTTCGTCCAGAATGTTTACAGACATTTTATAAGGTTCTTTTAAATTGTTATGAAGAATTTGAGAGTGAGCTTGGAAAGGAGGAAAGTTACAAAGTTTACTACGCAAGAGAAGCGATGAAAAGA-TTACTTGGAGCATATTTCAGTGAAGCTCGATGGTTGCACGAAGGATATTTCCCTAGCTTCGATGAGCATTTGAAGGTTTCTTTGATTTCTTGTGGATACACCATGATGATAGTGACCTCTTTAATT-GGCATGAAAGATTGTGTAACAAAGCAAGATTTTGAGTGGCTCTCAAAAGACCCCAAGATAATGAGAGATTGCAATATCCTTTGTAGGTTCATGGATGACATAGTCTCTCATAAGTTTGAGCAACAAAGAGATCATTCACCGTCTACCGTTGAGAGTTACATGAGGCAATATGGGGTGTCAGAACAAGAGGCATGTGATGAGCT-AAGAAAGCAAGTGATTAATTCATGGAAAGAAATAAACAAAGCATTCCTCAGGCCTTCTAATGTGCCTTATCCAGTTTTATCTCTTGTTCTCAATTTTTCGAGAGTAA-TGGATCTTCTCTACAAAGATGGTGATGGC---TATACGCATATTGGAAAAGAGACAAAAAATAGTGTTGTTGCGTTACTTATAGATCAAATC 1722


Match Name	Summary
XM_030622956.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 93.88 Description: PREDICTED: Cannabis sativa alpha-humulene synthase-like (LOC115695865), mRNA [more]
XM_030622957.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 93.22 Description: PREDICTED: Cannabis sativa germacrene-A synthase (LOC115695866), transcript variant X1, mRNA [more]
XM_030622955.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 92.20 Description: PREDICTED: Cannabis sativa alpha-humulene synthase (LOC115695864), mRNA [more]
XM_030622958.1	E-Value: 7.604e-73, PID: 95.69 Description: PREDICTED: Cannabis sativa germacrene-A synthase (LOC115695866), transcript variant X2, mRNA [more]
XM_030655054.1	E-Value: 2.374e-172, PID: 73.93 Description: PREDICTED: Cannabis sativa alpha-humulene synthase (LOC115725506), mRNA [more]

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

Performed on: 2021-09-02
Display provided by the neXtProt Feature Viewer


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 12..30
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 1..11
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 31..41
None	No IPR available	COILS	Coil	Coil	coord: 350..370
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225:SF42		coord: 5..550
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225	FAMILY NOT NAMED	coord: 5..550
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 1..13
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 36..60
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 14..35
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 1..19
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 20..39
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 40..41
IPR001906	Terpene synthase, N-terminal domain	PFAM	PF01397	Terpene_synth	coord: 29..198 e-value: 2.9E-52 score: 177.2
IPR005630	Terpene synthase, metal-binding domain	PFAM	PF03936	Terpene_synth_C	coord: 229..494 e-value: 5.2E-104 score: 347.3
IPR036965	Terpene synthase, N-terminal domain superfamily	GENE3D	1.50.10.130		coord: 65..223 e-value: 1.9E-192 score: 642.1
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	GENE3D	1.10.600.10		coord: 28..534 e-value: 1.9E-192 score: 642.1
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	SUPERFAMILY	48576	Terpenoid synthases	coord: 224..550
IPR008930	Terpenoid cyclases/protein prenyltransferase alpha-alpha toroid	SUPERFAMILY	48239	Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases	coord: 25..224

Cannabis sativa cultivar Purple Kush terpene synthase 22 mRNA
complete cds

Reanalysis of 21 trichome RNA-Seq samples, FN-clones109 (TMM50 minvalue)

Reanalysis of 21 trichome RNA-Seq samples, PK-clones109 (TMM50 minvalue)

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

blastn of TPS CDS against cs10 genome

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

NCBI Download

Sequences

Sequence	ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTAAGTGACAAAATTAT TGCTCGTCCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGCGATCGATTCC TCCATTACAATGTTTCAGAACAAGACTTGGTTTGCAAACAAGAAAGAATT GAAGAATTAATACAAGTTGTGAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGA TCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCACATCATT TTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCAT CATCAAAATCATCAAGATCTACATGATGCTTCTCTTTGGTTTAGATTATT AAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTATATTTGAAAAATTTAAAG ACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGACGTTTCGGGTTTA CTTAGTTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACT AGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAA ATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGG CCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAAT CTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGT TAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATT GTGAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAG AGATAGGATTGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAAC CCAAATACTCTAGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACC TCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCA GCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAGGTGGGACATAAATTGTATGGATAAAC TTGAGCCAGAATATTTGAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGAATCTTAT GAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTA TGCAAAAGAAGAGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTC GATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTC TCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGG AATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACC CTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATA GGCTCTCGCAAGTTTGAACAAGAGAGAAATCACGTACTATCTACAGTGGA ATGTTACATGAAGCAATATGAGGTTTCAGAGGAAGAAGCAATTAAAGAAC TTAATAAAAGAGTGGCCAATTGTTGGAAAGAAATAAATGAAGACTTTATT AGACCAACTAGTGTGCCTTTTCCTATTTTATTTCGTATTATTAATTTGAC CAAGACAGCTGATTTTATGTACAGAGAAGGTGGTGACCAATATACACATG TTGGAAAGGTGTTGAAAGATAGCATTGCTGCTTTACTTATAGATCCAATC ATCTTTCTAGAAGATCTCCTACAATATTCTCAGCTGCCATGGAAAATCGA TGTTCTTCTTTTATTCTCTCAAGATTTTCAGTGA
Sequence Length	1734
Sequence Checksum	e0d30990d3b3410f3c3ab326ec213dda

Sequence

ATGTCAAATATTCAAGTCTTAGCTTCATCTCAATTAAGTGACAAAATTAT
TGCTCGTCCAACAACAAATTTTCACCCTTCTATTTGGGGCGATCGATTCC
TCCATTACAATGTTTCAGAACAAGACTTGGTTTGCAAACAAGAAAGAATT
GAAGAATTAATACAAGTTGTGAAGAAAGAGATATTATCTTCAAATCATGA
TCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCACATCATT
TTGAGAGTGAAATTGAGAAATTGTTGGAACAATTAAGTATCGGCACTCAT
CATCAAAATCATCAAGATCTACATGATGCTTCTCTTTGGTTTAGATTATT
AAGACAACATGGATTTAATGTTTCATCAAGTATATTTGAAAAATTTAAAG
ACGATGAAGGTAACTTTAAGAAAAGCTTGATAACCGACGTTTCGGGTTTA
CTTAGTTTGTATGAGGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACT
AGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAAGGCTATTGTGGCAA
ATAGTAAAGATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGG
CCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTATATCTCAAT
CTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGT
TAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATT
GTGAGGTGGTGGAAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAG
AGATAGGATTGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAAC
CCAAATACTCTAGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACC
TCAATCACAGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCA
GCTTCTTACCAAAGCAATGCAGAGGTGGGACATAAATTGTATGGATAAAC
TTGAGCCAGAATATTTGAAGACATATTATAAGGTAATGTTGGAATCTTAT
GAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTA
TGCAAAAGAAGAGATGAAAAGAATTATTGGAGCTTATTTTGAAGAAGCTC
GATGGTTAAATGAAGGATATTTGCCAAGCTTCGATGAGCATTTGAGAGTC
TCTTATATTTCTTCTGGTTACGTTTTGTTGATAGCCACAAGTTATGTAGG
AATGCATGATATTGTAACACATGAAACTCTAAATTGGCTCTCCAAAGACC
CTAAGATTGTTTCAGCTTCTACTCTCCTCTCAAGATTCATGGATGACATA
GGCTCTCGCAAGTTTGAACAAGAGAGAAATCACGTACTATCTACAGTGGA
ATGTTACATGAAGCAATATGAGGTTTCAGAGGAAGAAGCAATTAAAGAAC
TTAATAAAAGAGTGGCCAATTGTTGGAAAGAAATAAATGAAGACTTTATT
AGACCAACTAGTGTGCCTTTTCCTATTTTATTTCGTATTATTAATTTGAC
CAAGACAGCTGATTTTATGTACAGAGAAGGTGGTGACCAATATACACATG
TTGGAAAGGTGTTGAAAGATAGCATTGCTGCTTTACTTATAGATCCAATC
ATCTTTCTAGAAGATCTCCTACAATATTCTCAGCTGCCATGGAAAATCGA
TGTTCTTCTTTTATTCTCTCAAGATTTTCAGTGA

Sequence Length

1734

Sequence Checksum

e0d30990d3b3410f3c3ab326ec213dda

Summary

Resource Type	mRNA
Accession	MN967477.1
Organism	Cannabis sativa L.
Name	MN967477.1
Identifier	MN967477.1
Time Accessioned	Thursday, November 21, 2024 - 09:18
Time Last Modified	Thursday, November 21, 2024 - 09:18