Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer
Show Results Table
BLAST of MN967475.1 vs. Genbank
Match Name:
NC_044371.1
Description: Cannabis sativa chromosome 1, cs10, whole genome shotgun sequence
HSP 1 Score: 689.921 bits (373), Expect = 0.000e+0
Identity = 393/403 (97.52%), Postives = 393/403 (97.52%), Query Frame = 1
Query: 365 CAGATGTGTTTAACGAGTTGATGAAGGACAAAAAGGGAAATTTCAATGTTTTAGTGGAAGAAGACAGAGAGGGACTAAGAGAATTGTTTGAAGCCTCACAAGTAAGAATAGAAGGAGAAGAGGTACTAGAGGAAGCTGAAGTGTTTAGTGGCGAACACCTAAAAGAATGGGCAAATCTTCATCGTCATACGAGTGAAGCTCGAAGTATTCAATTAACGTTAGACCAACCTTGTCATAAAAGCTTGGCCAGGGTCACATCTCCAAACTTTTTGGACAGTTTCTCAGCCAACACTGCTACCAGAGACCAAGGCTGGACCTGGATGACCCTTTTAAACAAACTGGTCACAATGGACTTCAAAATAGTTCAGTCTATTCACCAAAGGGAAATTGTTCAAGTCTCCAA 767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct: 93263552 CAGATGTGTTTAACGAGTTGATGAAGGACAAAAAGGGAAATTTCAATGTTTTAGTGGAAGAAGACAGAGAGGGACTAAGAGAATTGTTTGAAGCCTCACAAGTAAGAATAGAAGGAGAAGAGGTACTAGAGGAAGCTGAAGTGTTCAGTGGCGGACACCTAAAAGAATGGGCAAATCTTCATCGTCATACGAGTGAAGCTCGAAGTATTCAATTAACGCTAGACCAACCTTGTCATAAAAGCTTGGCCAGGGTCACATCTCCAAACTTTTTGGACAGTTTCTCGGCCAACACTACTACCATAGACCAAGGCTGGACCTGGATGACCCTTTTAAACAAACTGGTCACAATGGACTTCAAAATAGTACAGTCTATTCACCAAAGGGAAATTGTCCTTGTCTCCAA 93263150
HSP 2 Score: 562.502 bits (304), Expect = 6.669e-158
Identity = 304/304 (100.00%), Postives = 304/304 (100.00%), Query Frame = 1
Query: 64 CCGTTTTACATGGAGTATACACGTAATATACGAGAGATGAAGAACGTAATGAACAGTATTATTTTGGCTGATGATGATTATCGTGAACGCTCCATAGAAGCTTTGAACTTGGTCAACGCTGTGCTTAGAGTCGGCATTGATTATCATGTCCAAGATGAGATTAAATCTATCCTTGAAAGGGAACATATAATTTTCAGTGACCATATTAGTAACCAATATTTTAATAATATTAATCAAGACCACCTGTATGAGGTTTCTCTTCGTTTCCGATTACTGAGACAAGGAGGTTATGATGTCTCTCCAG 367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 93263962 CCGTTTTACATGGAGTATACACGTAATATACGAGAGATGAAGAACGTAATGAACAGTATTATTTTGGCTGATGATGATTATCGTGAACGCTCCATAGAAGCTTTGAACTTGGTCAACGCTGTGCTTAGAGTCGGCATTGATTATCATGTCCAAGATGAGATTAAATCTATCCTTGAAAGGGAACATATAATTTTCAGTGACCATATTAGTAACCAATATTTTAATAATATTAATCAAGACCACCTGTATGAGGTTTCTCTTCGTTTCCGATTACTGAGACAAGGAGGTTATGATGTCTCTCCAG 93263659
HSP 3 Score: 531.109 bits (287), Expect = 1.881e-148
Identity = 289/290 (99.66%), Postives = 289/290 (99.66%), Query Frame = 1
Query: 1367 AGGATGAGAATCAAAATGGGCATGATGGGTCTTACGTTGAGTGCTACATGAAAAGACACAAGGAGTGTTCAATGGGCGAAGCAAGGGAGCAAGTGATTCGTATGATTAAAAATGAGTGGGAACGCCTCAATAAGGAGTGTTTCTCGCCAAAACATTTTCCCATGTGCTTCAGAAAGGGTTGTCTTAATGCTGCTAGGATGGTTCCAGTGATGTATGACTATGATGATCATCATCGCCTTCCAGGCCTCCAGAATTATATCAACTCACTTCTCTCTCATCAAACAATATAA 1656
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 93260957 AGGATGAGAATCAAAATGGGCATGATGGGTCTTACGTTGAGTGCTACATGAAAAGACACAAGGAGTGTTCAATGGGCGAAGCAAGGGAGCAAGTGATTCGTATGATTAAAAATGAGTGGGAACGCCTCAATAAGGAGTGTTTCTCGTCAAAACATTTTCCCATGTGCTTCAGAAAGGGTTGTCTTAATGCTGCTAGGATGGTTCCAGTGATGTATGACTATGATGATCATCATCGCCTTCCAGGCCTCCAGAATTATATCAACTCACTTCTCTCTCATCAAACAATATAA 93260668
HSP 4 Score: 459.089 bits (248), Expect = 9.001e-127
Identity = 250/251 (99.60%), Postives = 250/251 (99.60%), Query Frame = 1
Query: 1119 GTGGGGAAAACTGTGCAATGCGTTCTTGTTAGAAGCAGAGTGGTTTGGTTGTGGGAAGTTGCCAAATGAAGAGGTGTATTTGAAGAACGCGATTGTGAGTTCTGGTGTACACGTGGTGCTAGTTCATATGTTCTTTCTCTTAGGTGAAGGTATATCCATGGAAGCTGTAAACTTACTGGACAACATTCCAGGCCTTGTGTCTTCTACAGCAGCAATTCTTCGTCTTTGGGATGACTTAGGAAGTGCCAAGG 1369
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 93261331 GTGGGGAAAACTGTGCAATGCGTTCTTGTTAGAAGCAGAGTGGTTTGGTTGTGGGAAGTTGCCAAATGAAGAGGAGTATTTGAAGAACGCGATTGTGAGTTCTGGTGTACACGTGGTGCTAGTTCATATGTTCTTTCTCTTAGGTGAAGGTATATCCATGGAAGCTGTAAACTTACTGGACAACATTCCAGGCCTTGTGTCTTCTACAGCAGCAATTCTTCGTCTTTGGGATGACTTAGGAAGTGCCAAGG 93261081
HSP 5 Score: 405.537 bits (219), Expect = 1.189e-110
Identity = 219/219 (100.00%), Postives = 219/219 (100.00%), Query Frame = 1
Query: 768 ATGGTGGAAAGAGCTTGGTTTGGCAGAGGAGTTGAAATTTGCTAGAGACCAACCCCTAAAATGGTACCTCTGGACAGTGGCAAGTCTACCAGATCCAAGCTTGTCTGAAGAGAGGATTGAACTAACTAAACCCATTTCTCTCGTCTACATAATAGATGATATTTTTGATGTTTATGGGACACTAGACGAACTCACTCTTTTCACAGACGCAGTTAATAA 986
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 93262932 ATGGTGGAAAGAGCTTGGTTTGGCAGAGGAGTTGAAATTTGCTAGAGACCAACCCCTAAAATGGTACCTCTGGACAGTGGCAAGTCTACCAGATCCAAGCTTGTCTGAAGAGAGGATTGAACTAACTAAACCCATTTCTCTCGTCTACATAATAGATGATATTTTTGATGTTTATGGGACACTAGACGAACTCACTCTTTTCACAGACGCAGTTAATAA 93262714
HSP 6 Score: 246.725 bits (133), Expect = 7.628e-63
Identity = 133/133 (100.00%), Postives = 133/133 (100.00%), Query Frame = 1
Query: 987 TTGGGAAATTAAAGAGCAGTTACCCGACTATTTGAAGATATGTTTCAAGGCACTTGATGATATAACCAACAAAATTAGCTACGTGGTGTACAGAAAACATGGATGGAACCCAATTGACTCCTTAAGAAAATCG 1119
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 93262231 TTGGGAAATTAAAGAGCAGTTACCCGACTATTTGAAGATATGTTTCAAGGCACTTGATGATATAACCAACAAAATTAGCTACGTGGTGTACAGAAAACATGGATGGAACCCAATTGACTCCTTAAGAAAATCG 93262099
HSP 7 Score: 113.766 bits (61), Expect = 8.072e-23
Identity = 61/61 (100.00%), Postives = 61/61 (100.00%), Query Frame = 1
Query: 1 ATGGCTTCTCCCTTTCTTTATGTCCCTTCTAAACACGGCAATGGATTACAAAGTTTCACAG 61
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 93264141 ATGGCTTCTCCCTTTCTTTATGTCCCTTCTAAACACGGCAATGGATTACAAAGTTTCACAG 93264081
Match Name | Summary |
NC_044371.1 | E-Value: 6.669e-158, PID: 97.52 Description: Cannabis sativa chromosome 1, cs10, whole genome shotgun sequence [more] |