TPS36 | ICGRC

Annotations

Contact

Cross Reference

Location on Map

Properties

Relationship

Publication

Sequences

Summary

Annotations

This record has the following annotations.
Term	Name	Definition
GO:0000287	magnesium ion binding	Interacting selectively and non-covalently with magnesium (Mg) ions. [GOC:ai]
GO:0016829	lyase activity
GO:0010333	terpene synthase activity	Catalysis of the formation of cyclic terpenes through the cyclization of linear terpenes (e.g. isopentenyl-PP, geranyl-PP, farnesyl-PP and geranylgeranyl-PP) containing varying numbers of isoprene units. [EC:4.2.3.-, GOC:tair_curators]
INTERPRO:IPR008930	Terpenoid_cyclase/PrenylTrfase
INTERPRO:IPR005630	Terpene_synthase_metal-bd
INTERPRO:IPR036965	Terpene_synth_N_sf
INTERPRO:IPR008949	Isoprenoid_synthase_dom_sf
INTERPRO:IPR001906	Terpene_synth_N

Click a tab below to view blast alignments.

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS36 vs. Genbank
Match Name: CM010795.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 8, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 776.713 bits (420), Expect = 0.000e+0
Identity = 425/427 (99.53%), Postives = 425/427 (99.53%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGATTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGCAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATATCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 796
                ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17920019 TATTTTACAGAGATTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGCAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATATCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 17919593

HSP 2 Score: 604.975 bits (327), Expect = 1.137e-170
Identity = 395/427 (92.51%), Postives = 395/427 (92.51%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGATTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGCAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATATCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 796
                ||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||     |||||||      |||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17858534 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAGACCAGAAAAAAGAGTTCAAAGAAAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTGAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACC------ATGATGATGATCATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTCATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTCGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 17858114

HSP 3 Score: 604.975 bits (327), Expect = 1.137e-170
Identity = 395/427 (92.51%), Postives = 395/427 (92.51%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGATTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGCAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATATCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 796
                ||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||     ||||| |  |||||||||||||||   |||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17879385 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGA-C--CATGATGATGATGAT---GATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 17878965

HSP 4 Score: 538.495 bits (291), Expect = 1.169e-150
Identity = 293/294 (99.66%), Postives = 293/294 (99.66%), Query Frame = 1

Query:     1399 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTACCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGAACAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1692
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17913510 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTACCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 17913217

HSP 5 Score: 521.875 bits (282), Expect = 1.178e-145
Identity = 290/294 (98.64%), Postives = 290/294 (98.64%), Query Frame = 1

Query:     1399 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTACCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGAACAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1692
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17857131 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTCAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 17856838

HSP 6 Score: 499.716 bits (270), Expect = 5.517e-139
Identity = 286/294 (97.28%), Postives = 286/294 (97.28%), Query Frame = 1

Query:     1399 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTACCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGAACAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1692
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17877917 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 17877624

HSP 7 Score: 499.716 bits (270), Expect = 5.517e-139
Identity = 275/277 (99.28%), Postives = 275/277 (99.28%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGAGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTTAGTCATGTATCTTCAG 379
                ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17920369 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGCGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTTAGTCATGTATCTTCAG 17920094

HSP 8 Score: 464.629 bits (251), Expect = 2.013e-128
Identity = 251/251 (100.00%), Postives = 251/251 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1149 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAATTCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATTTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 1399
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17913845 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAATTCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATTTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 17913595

HSP 9 Score: 449.856 bits (243), Expect = 5.636e-124
Identity = 266/277 (96.03%), Postives = 266/277 (96.03%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGAGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTTAGTCATGTATCTTCAG 379
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct: 17879736 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 17879461

HSP 10 Score: 444.316 bits (240), Expect = 2.622e-122
Identity = 265/277 (95.67%), Postives = 265/277 (95.67%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGAGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTTAGTCATGTATCTTCAG 379
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||
Sbjct: 17858882 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAGAATCCTTTAGTTAAACTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 17858607

HSP 11 Score: 442.47 bits (239), Expect = 9.431e-122
Identity = 247/251 (98.41%), Postives = 247/251 (98.41%), Query Frame = 1

Query:     1149 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAATTCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATTTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 1399
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17857461 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACTATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTCTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 17857211

HSP 12 Score: 442.47 bits (239), Expect = 9.431e-122
Identity = 247/251 (98.41%), Postives = 247/251 (98.41%), Query Frame = 1

Query:     1149 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAATTCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATTTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 1399
                |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 17878261 GTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAG 17878011

HSP 13 Score: 401.843 bits (217), Expect = 1.601e-109
Identity = 220/221 (99.55%), Postives = 220/221 (99.55%), Query Frame = 1

Query:      793 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCT-GACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCGGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1012
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17919478 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCGGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 17919258

HSP 14 Score: 370.45 bits (200), Expect = 4.514e-100
Identity = 216/223 (96.86%), Postives = 216/223 (96.86%), Query Frame = 1

Query:      793 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCT---GACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCGGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1012
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17878861 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 17878639

HSP 15 Score: 366.757 bits (198), Expect = 5.839e-99
Identity = 216/224 (96.43%), Postives = 216/224 (96.43%), Query Frame = 1

Query:      793 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCT---GACAGAGTAGTGGAA-ATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCGGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1012
                |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 17858017 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGGTTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAGATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTAAAATATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGGGGCAATTGAGAGGT 17857794

HSP 16 Score: 261.498 bits (141), Expect = 2.834e-67
Identity = 141/141 (100.00%), Postives = 141/141 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1009 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTGAAGAAGGCG 1149
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17919173 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTGAAGAAGGCG 17919033

HSP 17 Score: 250.418 bits (135), Expect = 6.135e-64
Identity = 139/141 (98.58%), Postives = 139/141 (98.58%), Query Frame = 1

Query:     1009 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTGAAGAAGGCG 1149
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct: 17878552 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCG 17878412

HSP 18 Score: 231.952 bits (125), Expect = 2.222e-58
Identity = 136/141 (96.45%), Postives = 136/141 (96.45%), Query Frame = 1

Query:     1009 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTGAAGAAGGCG 1149
                |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||
Sbjct: 17857707 AGGTGGAATATAAATGAATTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTTAAAGAAAATGG-ATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAGCG 17857568

HSP 19 Score: 207.945 bits (112), Expect = 3.745e-51
Identity = 112/112 (100.00%), Postives = 112/112 (100.00%), Query Frame = 1

Query:        1 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 112
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17920568 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 17920457

HSP 20 Score: 180.245 bits (97), Expect = 8.164e-43
Identity = 107/112 (95.54%), Postives = 107/112 (95.54%), Query Frame = 1

Query:        1 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 112
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17879920 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGG 17879809

[Close]

BLAST of TPS36 vs. Genbank
Match Name: AGQN03000461.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 000460F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 743.473 bits (402), Expect = 0.000e+0
Identity = 419/427 (98.13%), Postives = 419/427 (98.13%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGATTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGCAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATATCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 796
                ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     5016 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 4590

HSP 2 Score: 521.875 bits (282), Expect = 1.178e-145
Identity = 290/294 (98.64%), Postives = 290/294 (98.64%), Query Frame = 1

Query:     1399 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTACCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGAACAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1692
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     3600 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTCAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 3307

HSP 3 Score: 472.016 bits (255), Expect = 1.203e-130
Identity = 270/277 (97.47%), Postives = 270/277 (97.47%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGAGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTTAGTCATGTATCTTCAG 379
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct:     5370 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 5095

HSP 4 Score: 453.549 bits (245), Expect = 4.357e-125
Identity = 249/251 (99.20%), Postives = 249/251 (99.20%), Query Frame = 1

Query:     1149 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAATTCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATTTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 1399
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     3938 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 3688

HSP 5 Score: 381.53 bits (206), Expect = 2.085e-103
Identity = 218/223 (97.76%), Postives = 218/223 (97.76%), Query Frame = 1

Query:      793 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCT---GACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCGGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1012
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     4475 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATT-AAATATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 4254

HSP 6 Score: 255.958 bits (138), Expect = 1.319e-65
Identity = 140/141 (99.29%), Postives = 140/141 (99.29%), Query Frame = 1

Query:     1009 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTGAAGAAGGCG 1149
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct:     4168 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTGAAGAAAGCG 4028

HSP 7 Score: 207.945 bits (112), Expect = 3.745e-51
Identity = 112/112 (100.00%), Postives = 112/112 (100.00%), Query Frame = 1

Query:        1 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 112
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     5551 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 5440

[Close]

BLAST of TPS36 vs. Genbank
Match Name: AGQN03004076.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 004080F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 433.236 bits (234), Expect = 5.676e-119
Identity = 263/277 (94.95%), Postives = 263/277 (94.95%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGAGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTTAGTCATGTATCTTCAG 379
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||
Sbjct:    48408 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 48133

HSP 2 Score: 398.15 bits (215), Expect = 2.070e-108
Identity = 357/424 (84.20%), Postives = 357/424 (84.20%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGATTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGCAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGAC-A--AGGCAAAGTCAATTTACTAGA-GTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATATCAAAAAGAGCTCAAA 783
                ||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||| || ||  || ||   ||||||||| ||||| || |||||  | ||   |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||| ||| |||| || |||
Sbjct:    48062 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTA-TATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATT-TAATG--GTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAA 47643

[Close]

BLAST of TPS36 vs. Genbank
Match Name: CM010798.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 9, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 420.31 bits (227), Expect = 4.419e-115
Identity = 263/280 (93.93%), Postives = 263/280 (93.93%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGAGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACAT-T--TAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTTAGTCATGTATCTTCAG 379
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||
Sbjct: 32384855 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAAATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 32384577

HSP 2 Score: 398.15 bits (215), Expect = 2.070e-108
Identity = 357/424 (84.20%), Postives = 357/424 (84.20%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGATTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGCAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGAC-A--AGGCAAAGTCAATTTACTAGA-GTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATATCAAAAAGAGCTCAAA 783
                ||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||| || ||  || ||   ||||||||| ||||| || |||||  | ||   |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||| ||| |||| || |||
Sbjct: 32384505 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTA-TATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATT-TAATG--GTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAA 32384086

[Close]

BLAST of TPS36 vs. Genbank
Match Name: AGQN03004600.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 004604F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 161.779 bits (87), Expect = 2.957e-37
Identity = 105/114 (92.11%), Postives = 105/114 (92.11%), Query Frame = 1

Query:      171 GAAGGAGAGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAA 284
                |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct:    20374 GAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGATTGAACATATAAATGGTTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAAATAAGACAATATTAAACCTAACATATAA 20261

[Close]

BLAST of TPS36 vs. Genbank
Match Name: CM010790.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 161.779 bits (87), Expect = 2.957e-37
Identity = 105/114 (92.11%), Postives = 105/114 (92.11%), Query Frame = 1

Query:      171 GAAGGAGAGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAA 284
                |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct: 14673360 GAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGATTGAACAGATAAATAATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAAATAAGACAATATTAAACCTAACATATAA 14673247


Match Name	Summary
CM010795.2	E-Value: 1.137e-170, PID: 99.53 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 8, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03000461.1	E-Value: 1.178e-145, PID: 98.13 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 000460F, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03004076.1	E-Value: 5.676e-119, PID: 94.95 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 004080F, whole genome shotgun sequence [more]
CM010798.2	E-Value: 4.419e-115, PID: 93.93 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 9, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03004600.1	E-Value: 2.957e-37, PID: 92.11 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 004604F, whole genome shotgun sequence [more]
CM010790.2	E-Value: 2.957e-37, PID: 92.11 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS36 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-51512_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 1360.25 bits (736), Expect = 0.000e+0
Identity = 832/874 (95.19%), Postives = 832/874 (95.19%), Query Frame = 1

Query:      822 AAGGCTACCATTTGCT---GACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCGGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTGAAGAAGGCGTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAATTCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATTTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTACCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGAACAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1692
                ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      429 AAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT-------------------T--GCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCGTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1281

HSP 2 Score: 623.441 bits (337), Expect = 4.138e-177
Identity = 407/440 (92.50%), Postives = 407/440 (92.50%), Query Frame = 1

Query:      356 ATGGATTTAGTCATGTATCTTCAGAGATTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGCAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATATCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGG 795
                ||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||     ||||| |  |||||||||||||   |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:        1 ATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG-G-TTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGA-C--CATGATGATGATG---ATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGG 432

[Close]

BLAST of TPS36 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-51510_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 961.378 bits (520), Expect = 0.000e+0
Identity = 536/544 (98.53%), Postives = 536/544 (98.53%), Query Frame = 1

Query:     1149 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAATTCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATTTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTACCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGAACAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1692
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      765 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACTATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTCTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTCAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1308

HSP 2 Score: 909.672 bits (492), Expect = 0.000e+0
Identity = 599/648 (92.44%), Postives = 599/648 (92.44%), Query Frame = 1

Query:      111 GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGAGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTTAGTCATGTATCTTCAGAGATTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGCAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCA 758
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||   |||  |   | ||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||     |||||||      |||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:       27 GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAGAATCCTTTAGTTAAACTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATT----CA---ATC--C--TG-TTTTCAATGCCTTCAAAGACCAGAAAAAAGAGTTCAAAGAAAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTGAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACC------ATGATGATGATCATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTCATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTCGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCA 656

HSP 3 Score: 193.172 bits (104), Expect = 1.383e-47
Identity = 106/107 (99.07%), Postives = 106/107 (99.07%), Query Frame = 1

Query:      906 AACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1012
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct:      657 AACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGGGGCAATTGAGAGGT 763

[Close]

BLAST of TPS36 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-61665_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 798.873 bits (432), Expect = 0.000e+0
Identity = 674/784 (85.97%), Postives = 674/784 (85.97%), Query Frame = 1

Query:       13 TTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGAGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACAT-T--TAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTTAGTCATGTATCTTCAGAGATTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGCAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGAC-A--AGGCAAAGTCAATTTACTAGA-GTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATATCAAAAAGAGCTCAAA 783
                |||||||| ||||   ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||   ||| |  |   |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||| || ||  || ||   ||||||||| ||||| || |||||  | ||   |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||| ||| |||| || |||
Sbjct:       31 TTCAAAGAACAAC---CAGCAATAGTCCGTCGATCAGGAAACTACAAACCCCCATTGTGGGATGCTCATTTTATCCAATCACTCCAA------------GAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAAATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATT----CA---ATCCT--G---TTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTA-TATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATT-TAATG--GTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAA 783

[Close]

BLAST of TPS36 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-51517_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 693.614 bits (375), Expect = 0.000e+0
Identity = 377/378 (99.74%), Postives = 377/378 (99.74%), Query Frame = 1

Query:     1315 ATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTACCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGAACAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1692
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:        1 ATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTACCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 378

[Close]

BLAST of TPS36 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-51519_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 643.754 bits (348), Expect = 0.000e+0
Identity = 348/348 (100.00%), Postives = 348/348 (100.00%), Query Frame = 1

Query:      406 CAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTC 753
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      808 CAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTC 1155

HSP 2 Score: 468.323 bits (253), Expect = 2.052e-130
Identity = 308/330 (93.33%), Postives = 308/330 (93.33%), Query Frame = 1

Query:      821 AAAGGCTACCATTTGCT-GACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCGGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTGAAGAAGGCG 1149
                ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     1156 AAAGGCTACCATTTGCTAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCGGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT----T-----------------GCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTGAAGAAGGCG 1464

HSP 3 Score: 436.93 bits (236), Expect = 5.787e-121
Identity = 238/239 (99.58%), Postives = 238/239 (99.58%), Query Frame = 1

Query:      131 GAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGAGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTTAGTCAT 369
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      569 GAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGCGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTTAGTCAT 807


Match Name	Summary
PKGMv1-51512_t	E-Value: 4.138e-177, PID: 95.19 Description: No definition line [more]
PKGMv1-51510_t	E-Value: 1.383e-47, PID: 98.53 Description: No definition line [more]
PKGMv1-61665_t	E-Value: 0.000e+0, PID: 85.97 Description: No definition line [more]
PKGMv1-51517_t	E-Value: 0.000e+0, PID: 99.74 Description: No definition line [more]
PKGMv1-51519_t	E-Value: 2.052e-130, PID: 100.00 Description: No definition line [more]

blastn of TPS CDS against cs10 genome

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS36 vs. Genbank
Match Name: NC_044376.1
Description: Cannabis sativa chromosome 9, cs10, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 737.934 bits (399), Expect = 0.000e+0
Identity = 418/427 (97.89%), Postives = 418/427 (97.89%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGATTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGCAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATATCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 796
                ||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23664319 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 23663893

HSP 2 Score: 619.748 bits (335), Expect = 3.988e-175
Identity = 397/427 (92.97%), Postives = 397/427 (92.97%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGATTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGCAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATATCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 796
                ||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||     ||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23641323 TATTTTGCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACGAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAAGGTCAAACTAAATCTGTTGA-C--CATGATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 23640900

HSP 3 Score: 604.975 bits (327), Expect = 1.117e-170
Identity = 395/427 (92.51%), Postives = 395/427 (92.51%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGATTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGCAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATATCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 796
                ||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||     ||||||||| |  |||||||||   |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23623988 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAGACCAGAAAAAAGAGTTCAAAGAAAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTGAAACAATACTTGATGACGAGGCAAGGTCAAACTAAATCTGTTGACCAT-A--ATGATGATG---ATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTCATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTCGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 23623568

HSP 4 Score: 527.415 bits (285), Expect = 2.487e-147
Identity = 291/294 (98.98%), Postives = 291/294 (98.98%), Query Frame = 1

Query:     1399 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTACCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGAACAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1692
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23622580 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTATTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 23622287

HSP 5 Score: 521.875 bits (282), Expect = 1.157e-145
Identity = 290/294 (98.64%), Postives = 290/294 (98.64%), Query Frame = 1

Query:     1399 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTACCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGAACAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1692
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23662905 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTCAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 23662612

HSP 6 Score: 494.176 bits (267), Expect = 2.522e-137
Identity = 285/294 (96.94%), Postives = 285/294 (96.94%), Query Frame = 1

Query:     1399 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTACCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGAACAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1692
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23639848 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGTCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTACAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTTCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 23639555

HSP 7 Score: 460.936 bits (249), Expect = 2.558e-127
Identity = 268/277 (96.75%), Postives = 268/277 (96.75%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGAGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTTAGTCATGTATCTTCAG 379
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct: 23664673 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAGTGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACTTTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 23664398

HSP 8 Score: 444.316 bits (240), Expect = 2.576e-122
Identity = 265/277 (95.67%), Postives = 265/277 (95.67%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGAGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTTAGTCATGTATCTTCAG 379
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||
Sbjct: 23624336 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAGAATCCTTTAGTTAAACTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 23624061

HSP 9 Score: 442.47 bits (239), Expect = 9.265e-122
Identity = 247/251 (98.41%), Postives = 247/251 (98.41%), Query Frame = 1

Query:     1149 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAATTCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATTTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 1399
                |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 23640192 GTTGGGTGATCTATGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATTTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAG 23639942

HSP 10 Score: 442.47 bits (239), Expect = 9.265e-122
Identity = 247/251 (98.41%), Postives = 247/251 (98.41%), Query Frame = 1

Query:     1149 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAATTCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATTTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 1399
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23663239 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACTATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTCTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 23662989

HSP 11 Score: 438.776 bits (237), Expect = 1.199e-120
Identity = 264/277 (95.31%), Postives = 264/277 (95.31%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGAGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTTAGTCATGTATCTTCAG 379
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct: 23641678 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAACATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTAAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 23641403

HSP 12 Score: 436.93 bits (236), Expect = 4.311e-120
Identity = 246/251 (98.01%), Postives = 246/251 (98.01%), Query Frame = 1

Query:     1149 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAATTCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATTTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 1399
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23622915 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTTATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACTATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTCTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 23622665

HSP 13 Score: 420.31 bits (227), Expect = 4.341e-115
Identity = 263/280 (93.93%), Postives = 263/280 (93.93%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGAGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACAT-T--TAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTTAGTCATGTATCTTCAG 379
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||
Sbjct: 23502770 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAAATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 23502492

HSP 14 Score: 398.15 bits (215), Expect = 2.034e-108
Identity = 357/424 (84.20%), Postives = 357/424 (84.20%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGATTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGCAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGAC-A--AGGCAAAGTCAATTTACTAGA-GTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATATCAAAAAGAGCTCAAA 783
                ||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||| || ||  || ||   ||||||||| ||||| || |||||  | ||   |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||| ||| |||| || |||
Sbjct: 23502420 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTA-TATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATT-TAATG--GTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAA 23502001

HSP 15 Score: 375.99 bits (203), Expect = 9.531e-102
Identity = 217/223 (97.31%), Postives = 217/223 (97.31%), Query Frame = 1

Query:      793 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCT---GACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCGGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1012
                |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 23623471 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGGTTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGGGGCAATTGAGAGGT 23623249

HSP 16 Score: 375.99 bits (203), Expect = 9.531e-102
Identity = 217/223 (97.31%), Postives = 217/223 (97.31%), Query Frame = 1

Query:      793 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCT---GACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCGGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1012
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23640785 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTGAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 23640563

HSP 17 Score: 370.45 bits (200), Expect = 4.434e-100
Identity = 216/223 (96.86%), Postives = 216/223 (96.86%), Query Frame = 1

Query:      793 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCT---GACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCGGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1012
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23663778 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 23663556

HSP 18 Score: 250.418 bits (135), Expect = 6.028e-64
Identity = 139/141 (98.58%), Postives = 139/141 (98.58%), Query Frame = 1

Query:     1009 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTGAAGAAGGCG 1149
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct: 23640476 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCG 23640336

HSP 19 Score: 250.418 bits (135), Expect = 6.028e-64
Identity = 139/141 (98.58%), Postives = 139/141 (98.58%), Query Frame = 1

Query:     1009 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTGAAGAAGGCG 1149
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct: 23663470 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATTTGAAGAAAGCG 23663330

HSP 20 Score: 239.338 bits (129), Expect = 1.305e-60
Identity = 137/141 (97.16%), Postives = 137/141 (97.16%), Query Frame = 1

Query:     1009 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTGAAGAAGGCG 1149
                |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||
Sbjct: 23623162 AGGTGGAATATAAATGAATTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTTAAAGAAAATGGGATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAGCG 23623022

HSP 21 Score: 207.945 bits (112), Expect = 3.679e-51
Identity = 112/112 (100.00%), Postives = 112/112 (100.00%), Query Frame = 1

Query:        1 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 112
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23664855 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 23664744

HSP 22 Score: 185.785 bits (100), Expect = 1.724e-44
Identity = 108/112 (96.43%), Postives = 108/112 (96.43%), Query Frame = 1

Query:        1 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 112
                |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23641872 AGTACTACAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGG 23641761


Match Name	Summary
NC_044376.1	E-Value: 3.988e-175, PID: 97.89 Description: Cannabis sativa chromosome 9, cs10, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS36 vs. Genbank
Match Name: XM_030652513.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723095), mRNA

HSP 1 Score: 2950.22 bits (1597), Expect = 0.000e+0
Identity = 1663/1695 (98.11%), Postives = 1663/1695 (98.11%), Query Frame = 1

Query:        1 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGAGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTTAGTCATGTATCTTCAGAGATTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGCAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATATCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCT---GACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCGGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTGAAGAAGGCGTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAATTCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATTTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTACCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGAACAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1692
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      107 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAGTGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACTTTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATTTGAAGAAAGCGTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACTATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTCTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTCAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1801

[Close]

BLAST of TPS36 vs. Genbank
Match Name: XM_030652514.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723096), mRNA

HSP 1 Score: 2765.55 bits (1497), Expect = 0.000e+0
Identity = 1630/1695 (96.17%), Postives = 1630/1695 (96.17%), Query Frame = 1

Query:        1 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGAGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTTAGTCATGTATCTTCAGAGATTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGCAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATATCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCT---GACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCGGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTGAAGAAGGCGTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAATTCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATTTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTACCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGAACAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1692
                |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||     ||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      110 AGTACTACAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAACATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTAAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACGAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAAGGTCAAACTAAATCTGTTGA-C--CATGATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTGAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCGTTGGGTGATCTATGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATTTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGTCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTACAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTTCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1801

[Close]

BLAST of TPS36 vs. Genbank
Match Name: XM_030652515.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723097), mRNA

HSP 1 Score: 2750.78 bits (1489), Expect = 0.000e+0
Identity = 1628/1695 (96.05%), Postives = 1628/1695 (96.05%), Query Frame = 1

Query:        1 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGAGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTTAGTCATGTATCTTCAGAGATTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGCAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATATCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCT---GACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCGGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTGAAGAAGGCGTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAATTCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATTTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTACCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGAACAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1692
                |||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||     ||||||||| |  |||||||||   |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      128 AGTACTACAATATTCAAAGAACAACCGGAAGCAATTGTCCGACGATCAGGAAACTACAAACCCACGTTGTGGGATGCTCATTTTTTCAAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAGAATCCTTTAGTTAAACTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAGACCAGAAAAAAGAGTTCAAAGAAAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTGAAACAATACTTGATGACGAGGCAAGGTCAAACTAAATCTGTTGACCAT-A--ATGATGATG---ATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTCATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTCGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGGTTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGGGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAATTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTTAAAGAAAATGGGATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAGCGTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTTATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACTATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTCTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTATTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1816

[Close]

BLAST of TPS36 vs. Genbank
Match Name: XM_030652072.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115722765), mRNA

HSP 1 Score: 1288.24 bits (697), Expect = 0.000e+0
Identity = 1340/1651 (81.16%), Postives = 1340/1651 (81.16%), Query Frame = 1

Query:       13 TTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGAGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACAT-T--TAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTTAGTCATGTATCTTCAGAGATTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGCAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGAC-A--AGGCAAAGTCAATTTACTAGA-GTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATATCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCT-GACAGAG--TAGTGGAAATTTTCTATTCTGCA--GTGGCATTGAAATATGAGGCGGAATTTGGAT-TTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTC-ATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTT-TTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTGAAGAAGGCGTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAATTCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATTTA-TCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGA--AAATGAAA-GCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTACCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGG-GT--GATGGTTTTGGTACTAAT 1635
                |||||||| ||||   ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||| || ||  || ||   ||||||||| ||||| || |||||  | ||   |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||| ||| |||| || ||| ||  |  |||||||||||    | ||||  |   ||||||| |||| |||||  || | ||  |||| ||||  |||| |  || |  |||| | | |||| |||| |  | ||| ||| |||   |||   || | ||||| || ||||  ||| |||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||  ||| | |||| ||| ||| | || |||||| ||||||||    | || || || || ||||||||||||||||| ||| | |||  ||||||    |||||||| ||  | ||| | || || ||| |||||||||||| ||  ||||||||| | |||||  ||| |  |||| | |||||||| || |||  ||||||||| |||| ||| |||||| ||| |||||| || ||||||| |||| | ||||||||||  |||||| ||  ||| |||  |  || | | || ||||||| | || || | | |||| | |||| | ||||||||   ||||||||||||||| ||| || | ||| |||||||||   ||  |||| || | |||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||   ||||| ||| || ||||  ||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||| |  ||      | |||||||  |||||||  ||||||||| || |||| ||||| |||||   |||||||  ||| || || |||| |   |||||  |||||||||||
Sbjct:      160 TTCAAAGAACAAC---CAGCAATAGTCCGTCGATCAGGAAACTACAAACCCCCATTGTGGGATGCTCATTTTATCCAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAAATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTA-TATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATT-TAATG--GTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAACATGCTGTAAGGTGGTGGAAAACTACTAGTCTAGGAGAAAGGTTACCCTTTGCAAGAGATAGGATAGTTGAAACGTTCT-TA-TGGACTGTGGGAGTTAAATTTGAGCCACAGTTTAGATATTGCC-GAAAAATGCTCACAAAGATGGGTCAATTGGTAAC-CTCAATGGACGATATATTTGACGTGTATGGTACGCTTGATGAGCTA-AGCCTCTTTCAAGACGCATTGGAAAGGTGGGATATAAATACGATAGACCAACTTCCAGATTACATGAAGATATTTTTTTTGGCTGCTTATAATGTGGTGAATGAAATGGCGTATGACGTGCTAAAACAAAATGGGATTCTCATTATCAAATATTTAAAGAAAACGTGGACGGATTTATGTAAATGTTACATGTTGGAGGCAAATTGGTATCATAGTGGATACACACCAAGCTTGGAAGAATACATTAAAAATGGATGGATATCAATTGCAGAACC-CTTAATTCTAGTCAATCTTTATTGCCTTATAACCAATCCAATAAAAGAAGATGACATGGACTGCTTGCTTCAATATCCCACCTTTATTCGTATCTCAGGAATCATTGCTCGACTTGTTGATGATTTAGGAACTTCATCGGATGAACTGAAAAGAGGAGACAATCCTAAATCGATTCAATGCTATATGAAAGAAAATGGTATTTGTGATGAAAAGAATGGCCGTGAACACATAAGGAATTTAATCAGTGAAACATGGAAGGAAATGAATGAAGCTCGAGTGGGTGAGTCTCCATTTTCTCAAGCTTTTATTGAAACTGCCATAGATTTCGTTAGGACAGCAATGATGATATACCAAAAGGAGCAAGATGGGGTTGGTACTAAT 1797


Match Name	Summary
XM_030652513.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 98.11 Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723095), mRNA [more]
XM_030652514.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 96.17 Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723096), mRNA [more]
XM_030652515.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 96.05 Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723097), mRNA [more]
XM_030652072.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 81.16 Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115722765), mRNA [more]

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

Performed on: 2021-09-02
Display provided by the neXtProt Feature Viewer


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 12..31
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 1..11
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 32..51
None	No IPR available	COILS	Coil	Coil	coord: 38..58
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225	FAMILY NOT NAMED	coord: 13..563
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225:SF9		coord: 13..563
IPR001906	Terpene synthase, N-terminal domain	PFAM	PF01397	Terpene_synth	coord: 24..210 e-value: 3.6E-47 score: 160.5
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	GENE3D	1.10.600.10		coord: 23..546 e-value: 1.3E-185 score: 619.6
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	SUPERFAMILY	48576	Terpenoid synthases	coord: 237..562
IPR036965	Terpene synthase, N-terminal domain superfamily	GENE3D	1.50.10.130		coord: 60..236 e-value: 1.3E-185 score: 619.6
IPR005630	Terpene synthase, metal-binding domain	PFAM	PF03936	Terpene_synth_C	coord: 242..506 e-value: 1.3E-90 score: 303.4
IPR008930	Terpenoid cyclases/protein prenyltransferase alpha-alpha toroid	SUPERFAMILY	48239	Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases	coord: 20..233

TPS36

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

blastn of TPS CDS against cs10 genome

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

NCBI Download

Sequences

Sequence	AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGG AAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAG TCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAA GATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGAGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCT TGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAG ATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTG TGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCG ACAATATGGATTTAGTCATGTATCTTCAGAGATTTTCAATGCCTTCAAAA ACGAGCAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATG GTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATT AGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGA CAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCAT GATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAG ATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA ATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAAC TTCGTTCAGTCAGCATATCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTG GAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTGACAGAGTAGTGG AAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCGGAATTTGGATTT GTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGA TATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGG CAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATG AAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTA TGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTGAAGAAGGCGT TGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGT GGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAATTCAAT TACAATACCTCTTTGTCTTATTTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAA TTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGT GTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGA TGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTG AAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATT AGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATA CTCTCAAGTGTTTATTGAATCTACCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGG AGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTT AAGAACAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT
Sequence Length	1692
Sequence Checksum	6ba9c9a55c0f7a78ea7afad3a1d204b6

Sequence

AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGG
AAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAG
TCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAA
GATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGAGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCT
TGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAG
ATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTG
TGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCG
ACAATATGGATTTAGTCATGTATCTTCAGAGATTTTCAATGCCTTCAAAA
ACGAGCAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATG
GTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATT
AGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGA
CAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCAT
GATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAG
ATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA
ATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAAC
TTCGTTCAGTCAGCATATCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTG
GAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTGACAGAGTAGTGG
AAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCGGAATTTGGATTT
GTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGA
TATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGG
CAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATG
AAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTA
TGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTGAAGAAGGCGT
TGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGT
GGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAATTCAAT
TACAATACCTCTTTGTCTTATTTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAA
TTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGT
GTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGA
TGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTG
AAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATT
AGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATA
CTCTCAAGTGTTTATTGAATCTACCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGG
AGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTT
AAGAACAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT

Sequence Length

1692

Sequence Checksum

6ba9c9a55c0f7a78ea7afad3a1d204b6

Summary

Resource Type	mRNA
Organism	Cannabis sativa L.
Name	TPS36
Identifier	TPS36
Time Accessioned	Tuesday, November 4, 2025 - 02:11
Time Last Modified	Tuesday, November 4, 2025 - 02:11