Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 genome
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BLAST of TPS55 vs. Genbank
Match Name:
CM010796.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 5, whole genome shotgun sequence
HSP 1 Score: 717.62 bits (388), Expect = 0.000e+0
Identity = 392/394 (99.49%), Postives = 392/394 (99.49%), Query Frame = 1
Query: 286 GATATATTTAAAAAATTCAAAGATGAGGATGGAAACTTTAAAAAATGTTTGGTAAGTGATACTCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGATGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATATCGTGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTGAATCTTCATACTAAGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTTAATCTATTACAATCCCTACACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATCAGCAGGT 679
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Sbjct: 52215614 GATATATTTAAAAAATTCAAAGATGAGGATGGAAACTTTAAAAAATGTTTGGTAAGTGATACTCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGGTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGATGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATATCGTGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTGAATCTTCATACTAAGCATTTCATTTCGATATACGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTTAATCTATTACAATCCCTACACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATCAGCAGGT 52215221
HSP 2 Score: 628.981 bits (340), Expect = 6.258e-178
Identity = 376/394 (95.43%), Postives = 376/394 (95.43%), Query Frame = 1
Query: 286 GATATATTTAAAAAATTCAAAGATGAGGATGGAAACTTTAAAAAATGTTTGGTAAGTGATACTCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGATGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATATCGTGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTGAATCTTCATACTAAGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTTAATCTATTACAATCCCTACACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATCAGCAGGT 679
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Sbjct: 52164441 GATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAGTCAGCAGGT 52164834
HSP 3 Score: 603.128 bits (326), Expect = 3.793e-170
Identity = 372/394 (94.42%), Postives = 372/394 (94.42%), Query Frame = 1
Query: 286 GATATATTTAAAAAATTCAAAGATGAGGATGGAAACTTTAAAAAATGTTTGGTAAGTGATACTCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGATGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATATCGTGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTGAATCTTCATACTAAGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTTAATCTATTACAATCCCTACACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATCAGCAGGT 679
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Sbjct: 52205743 GATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATAAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTACGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAGTTAGATTTT--TCTATTACAATCA-TGCACAAAAAGGA-CTTAGTGAAGTGAGCAGGT 52205354
HSP 4 Score: 508.949 bits (275), Expect = 8.506e-142
Identity = 283/287 (98.61%), Postives = 283/287 (98.61%), Query Frame = 1
Query: 1286 AGTTTGAGAAAGACAAATATGATGAAGATTCTGCCATTGAATCGTATATGATGCAACATGGTGTTTGTGAAGAAGAAGCCTATGATGAACTCAATAAGCTTATAATTAATTCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCAACTAAATTAGCTTCACCCATATTACTTAGGGTTCTTAATTTTTCTAGGGTTATGGATCTTCTCTACAAAAATGGTGATGGTTTTACACATGTTGGAAAAGTCACCAAAGATACTGTTGCTGCTTTGCTAATTGATCCCATT 1572
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Sbjct: 52211401 AGTTTGAGAAAGACAAATATGATGAAGATTCTGCCATTGAATCGTATATGATGCAACATGGTGTTTGTGAAGAAGAAGCCTATGATGAACTCAATAAGCTTATAATTAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCAACTAAATTAGCTTCACCCATATTACTTCGTGTTCTTAATTTTTCTAGGGTTATGGATCTTCTCTACAAAAATGGTGATGGTTTTACACATGTTGGAAAAGTCACCAAAGATTCTGTTGCTGCTTTGCTAATTGATCCCATT 52211115
HSP 5 Score: 508.949 bits (275), Expect = 8.506e-142
Identity = 290/297 (97.64%), Postives = 290/297 (97.64%), Query Frame = 1
Query: 1 CAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAGGTGATTAGAAGAGAAATATTTGGGGAATCATCAATATCATCATCAGCTTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATATGATAGAACAAATCTACAACAAAACCAATAATTTTGATCTTCTTAAGGATGAAGAGTTGCATGATGTTTCCTTGTGGGTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGGGTTTCTTCTGATA--TATTTA 295
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Sbjct: 52216404 CAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAGGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGAATCATCAATATCATCATCAGCTTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATATGATAGAACAAATCTACAACAAAACCAATAATTTTGATCTTCTTAAGGATGAAGAGTTGCATGATGTTTCCTTGTGGGTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGGGTTTCTTCTGGTACATATTTA 52216108
HSP 6 Score: 457.243 bits (247), Expect = 3.125e-126
Identity = 251/253 (99.21%), Postives = 251/253 (99.21%), Query Frame = 1
Query: 1035 GTTTAAAGAGTTAATCCGATCATATTTTGATGAAGCTCGATGGTTGAATAGTGGACGTGTCCCAAATTTTGAAGAGTACATGGAATTTGCAACCATTAATTGTGGTTACTATATGTTGATAGTGAGTTCTTTGGTTGGAATAAAAACTAGTATTGTAACCAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTATTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 1287
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Sbjct: 52214057 GTTTAAAGAGTTAATCCGATCATATTTTGATGAAGCTCGATGGTTGAATAGTGGACGTGTCCCAAATTTTGAAGAGTACATGGAATTTGCAACCATTAATTGTGGTTACTATATGTTGATAGTGAGTTCTTTGGTTGGAATGAAAACAAGTATTGTAACCAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTATTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 52213805
HSP 7 Score: 396.303 bits (214), Expect = 6.909e-108
Identity = 220/223 (98.65%), Postives = 220/223 (98.65%), Query Frame = 1
Query: 676 AGGTGGTGGAAAGAATCAAACTTTGTACAAAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGAATTGTGGAGCTCTATCTGTGGATGTTAGGAGTCTATTATGAACCCCAATACTCTTTGGCAAGAAATATTTTAGCCAAAATCATAGCTTTTTCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACATTTGAAGAGCTTGAACTCCTAACTCAAGCAATTGAAAGGT 898
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Sbjct: 52214642 AGGTGGTGGAAAGAATCAAACTTTGTACAAAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGAATTGTGGAGCTCTATCTTTGGATGTTAGGAGTCTATTATGAACCCCAATACTCTTTGGCAAGAAATATTTTAGCCAAAATCATAGCTTTTTCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGAACATTTGAAGAACTTGAACTCCTAACTCAAGCAATTGAAAGGT 52214420
HSP 8 Score: 342.75 bits (185), Expect = 9.129e-92
Identity = 254/285 (89.12%), Postives = 254/285 (89.12%), Query Frame = 1
Query: 1 CAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAGGTGATTAGAAGAGAAATATTTGGGGAATCATCAATATCATCATCAGCTTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATATGATAGAACAAATCTACAACAAAACCAATAATTTTGATCTTCTTAAGGATGAAGAGTTGCATGATGTTTCCTTGTGGG-TTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGGGTTTCTTC 284
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Sbjct: 52206681 CAACAAGAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGGGAAATATTTGGAGAATCATCAATATCATCATCAGCTTATTATGATGGTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGGCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATATGATAGAACAAATCTGCAACCAAACCAATA-TT--GAT---------GATGAAGATTTACATCATGTTTC-TGATCGGTTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTC 52206410
HSP 9 Score: 326.131 bits (176), Expect = 9.194e-87
Identity = 250/287 (87.11%), Postives = 250/287 (87.11%), Query Frame = 1
Query: 1286 AGTTTGAGAAAGACAAATATGATGAAGATTCTGCCATTGAATCGTATATGATGCAACATGGTGTTTGTGAAGAAGAAGCCTATGATGAACTCAATAAGCTTATAATTAATTCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCAACTAAATTAGCTTCACCCATATTACTTAGGGTTCTTAATTTTTCTAGGGTTATGGATCTTCTCTACAAAAATGGTGATGGTTTTACACATGTTGGAAAAGTCACCAAAGATACTGTTGCTGCTTTGCTAATTGATCCCATT 1572
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Sbjct: 52203092 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTTGAATGCTATATGATTGAACATGGTGTTTGTGAAGAAGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATTAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTGTGAAGCCAACTCAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAATTTTTCTAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACTAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 52202806
HSP 10 Score: 292.891 bits (158), Expect = 9.325e-77
Identity = 223/255 (87.45%), Postives = 223/255 (87.45%), Query Frame = 1
Query: 1035 GTTTAAAGAGTTAATCCGATCATATTTTGATGAAGCTCGATGGTTGAATAGTGGACGTGTCCCA--AATTTTGAAGAGTACATGGAATTTGCAACCATTAATTGTGGTTACTATATGTTGATAGTGAGTTCTTTGGTTGGAATAAAAACTAGTATTGTAACCAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTATTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 1287
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Sbjct: 52204545 GTTTAAGGAATTAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCATGTTTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 52204291
HSP 11 Score: 291.044 bits (157), Expect = 3.354e-76
Identity = 201/223 (90.13%), Postives = 201/223 (90.13%), Query Frame = 1
Query: 676 AGGTGGTGGAAAGAATCAAACTTTGTACAAAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGAATTGTGGAGCTCTATCTGTGGATGTTAGGAGTCTATTATGAACCCCAATACTCTTTGGCAAGAAATATTTTAGCCAAAATCATAGCTTTTTCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACATTTGAAGAGCTTGAACTCCTAACTCAAGCAATTGAAAGGT 898
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Sbjct: 52205269 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTATACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTTTACTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGCTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 52205047
HSP 12 Score: 285.504 bits (154), Expect = 1.560e-74
Identity = 200/223 (89.69%), Postives = 200/223 (89.69%), Query Frame = 1
Query: 676 AGGTGGTGGAAAGAATCAAACTTTGTACAAAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGAATTGTGGAGCTCTATCTGTGGATGTTAGGAGTCTATTATGAACCCCAATACTCTTTGGCAAGAAATATTTTAGCCAAAATCATAGCTTTTTCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACATTTGAAGAGCTTGAACTCCTAACTCAAGCAATTGAAAGGT 898
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Sbjct: 52164919 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGTTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 52165141
HSP 13 Score: 285.504 bits (154), Expect = 1.560e-74
Identity = 220/253 (86.96%), Postives = 220/253 (86.96%), Query Frame = 1
Query: 1035 GTTTAAAGAGTTAATCCGATCATATTTTGATGAAGCTCGATGGTTGAATAGTGGACGTGTCCCAAATTTTGAAGAGTACATGGAATTTGCAACCATTAATTGTGGTTACTATATGTTGATAGTGAGTTCTTTGGTTGGAATAAAAACTAGTATTGTAACCAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTATTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 1287
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Sbjct: 52165707 GTTTAAGGGATTAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCTGAACACAAG 52165959
HSP 14 Score: 261.498 bits (141), Expect = 2.630e-67
Identity = 141/141 (100.00%), Postives = 141/141 (100.00%), Query Frame = 1
Query: 895 AGGTGGGATATAAATTGTATTGATACACTCAATCAAGAATATTTGAAAACATTTTATAAGGATCTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTTACAAAAGAAGAAACTTATAGAGTTCATTATGCAAAAGAAGTG 1035
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Sbjct: 52214323 AGGTGGGATATAAATTGTATTGATACACTCAATCAAGAATATTTGAAAACATTTTATAAGGATCTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTTACAAAAGAAGAAACTTATAGAGTTCATTATGCAAAAGAAGTG 52214183
HSP 15 Score: 185.785 bits (100), Expect = 1.628e-44
Identity = 169/199 (84.92%), Postives = 169/199 (84.92%), Query Frame = 1
Query: 1 CAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAGGTGATTAGAAGAGAAATATTTGGGGAATCATCAATATCATCATCAGCTTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATATGATAGAACAAATCTACAACAAAACCAATA 199
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Sbjct: 52162552 CAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGG------------A-GAT--T-A--TTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGTTAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACCAATA 52162732
HSP 16 Score: 180.245 bits (97), Expect = 7.575e-43
Identity = 121/133 (90.98%), Postives = 121/133 (90.98%), Query Frame = 1
Query: 898 TGGGATATAAATTGTATTGATACACTCAATCAAGAATATTTGAAAACATTTTATAAGGATCTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTTACAAAAGAAGAAACTTATAGAGTTCATTATGCAAAAG 1030
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Sbjct: 52204784 TGGGATATAAACTGTGTGGATACACTCAATCAAGAATATATGCAAACATTTTATAAGGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTAGAAAAAGAAGAAACATACCGAGTTCATTATGCAAAAG 52204652
BLAST of TPS55 vs. Genbank
Match Name:
CM010792.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 2, whole genome shotgun sequence
HSP 1 Score: 689.921 bits (373), Expect = 0.000e+0
Identity = 387/394 (98.22%), Postives = 387/394 (98.22%), Query Frame = 1
Query: 286 GATATATTTAAAAAATTCAAAGATGAGGATGGAAACTTTAAAAAATGTTTGGTAAGTGATACTCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGATGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATATCGTGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTGAATCTTCATACTAAGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTTAATCTATTACAATCCCTACACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATCAGCAGGT 679
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Sbjct: 72111023 GATATATTTAAAAAATTCAAAGATGAGGATGGCAACTTTAAAAAATGTTTGGTAAGTGATACTCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACAACTAAAAGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCACGATGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATATCGTGCCCTAGAGAGGCCCTTACGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATACTAAGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTTAATCTATTACAATCCCTGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATCAGCAGGT 72110630
HSP 2 Score: 617.901 bits (334), Expect = 1.355e-174
Identity = 374/394 (94.92%), Postives = 374/394 (94.92%), Query Frame = 1
Query: 286 GATATATTTAAAAAATTCAAAGATGAGGATGGAAACTTTAAAAAATGTTTGGTAAGTGATACTCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGATGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATATCGTGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTGAATCTTCATACTAAGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTTAATCTATTACAATCCCTACACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATCAGCAGGT 679
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Sbjct: 72025062 GATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGTGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGATGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAGTCAGCAGGT 72025455
HSP 3 Score: 562.502 bits (304), Expect = 6.437e-158
Identity = 364/394 (92.39%), Postives = 364/394 (92.39%), Query Frame = 1
Query: 286 GATATATTTAAAAAATTCAAAGATGAGGATGGAAACTTTAAAAAATGTTTGGTAAGTGATACTCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGATGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATATCGTGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTGAATCTTCATACTAAGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTTAATCTATTACAATCCCTACACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATCAGCAGGT 679
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Sbjct: 72051753 GATATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAGGCTACACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACTTAACCGAGTTTTTGGCAAGGAAAAAAGAATACCATGATGACGATGATCCATTATCAAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTGAATCTTCATGCAAGGCATTTTATTTCGATATATGAAAAAGATGATTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTCAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAGTCAGCAGGT 72052146
HSP 4 Score: 468.323 bits (253), Expect = 1.444e-129
Identity = 272/281 (96.80%), Postives = 272/281 (96.80%), Query Frame = 1
Query: 1292 AGAAAGACAAATATGATGAAGATTCTGCCATTGAATCGTATATGATGCAACATGGTGTTTGTGAAGAAGAAGCCTATGATGAACTCAATAAGCTTATAATTAATTCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCAACTAAATTAGCTTCACCCATATTACTTAGGGTTCTTAATTTTTCTAGGGTTATGGATCTTCTCTACAAAAATGGTGATGGTTTTACACATGTTGGAAAAGTCACCAAAGATACTGTTGCTGCTTTGCTAATTGATCCCATT 1572
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Sbjct: 72108331 AGAAAGA-AAATATGATGAACATTCTGCCATTGAATCGTATATGATGCAACATGGTGTTTGTGAAGAAGAAGCCTATGATGAATTTAATAAGCTTATAAATAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTGTGAAGCCAACTAAATTAGCTTCATCCATATTACTTAGGGTTCTTAATTTTTCTAGGGTTATGGATCTTCTCTACAAAAATGGTGATGGTTTTACACATGTTGGAAAAGTCACCAAAGATACTGTTGCTGCTTTGTTAATTGATCCCATT 72108052
HSP 5 Score: 457.243 bits (247), Expect = 3.125e-126
Identity = 251/253 (99.21%), Postives = 251/253 (99.21%), Query Frame = 1
Query: 1035 GTTTAAAGAGTTAATCCGATCATATTTTGATGAAGCTCGATGGTTGAATAGTGGACGTGTCCCAAATTTTGAAGAGTACATGGAATTTGCAACCATTAATTGTGGTTACTATATGTTGATAGTGAGTTCTTTGGTTGGAATAAAAACTAGTATTGTAACCAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTATTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 1287
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Sbjct: 72109467 GTTTAAAGAGTTAATCCGATCATATTTTGATGAAGCTCGATGGTTGAATAGTGGACGTATCCCAAATTTTGAAGAGTACATGGAATTTGCAACCATTAATTGTGGTTACTATATGTTGATAGTGAGTTCTTTGGTTGGAATAAAAACTAGTATTGTAACCAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 72109215
HSP 6 Score: 427.696 bits (231), Expect = 2.450e-117
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Query: 37 AGAAGAGAAATATTTGGGGAATCATCAATATCATCATCAGCTTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATATGATAGAACAAATCTACAACAAAACCAATAATTTTGATCTTCTTAAGGATGAAGAGTTGCATGATGTTTCCTTGTGGGTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGGGTTTCTTCTGATA--TATTTA 295
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Sbjct: 72111763 AGAAGAGAAATATTTGGAGAATCATCAATATCATCATCAGCTTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATATGATAGAACAAATCTACAACAAAACCAATATTTTTGATCTTCTTAAGGA---AGATTTGCATGATGTTTCCTTGTGGGTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGGGTTTCTTCTGGTACATATTTA 72111506
HSP 7 Score: 396.303 bits (214), Expect = 6.909e-108
Identity = 220/223 (98.65%), Postives = 220/223 (98.65%), Query Frame = 1
Query: 676 AGGTGGTGGAAAGAATCAAACTTTGTACAAAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGAATTGTGGAGCTCTATCTGTGGATGTTAGGAGTCTATTATGAACCCCAATACTCTTTGGCAAGAAATATTTTAGCCAAAATCATAGCTTTTTCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACATTTGAAGAGCTTGAACTCCTAACTCAAGCAATTGAAAGGT 898
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Sbjct: 72110059 AGGTGGTGGAAAGAATCAAACTTTGTACAAAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGAATTGTGGAGCTCTATCTGTGGATGTTAGGAGTCTATTATGAACCCCAATACTCTTTGGCAAGAAATATTTTAGTCAAAATCATAGCTTTTTCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGAACATTTGAAGAACTTGAACTCCTAACTCAAGCAATTGAAAGGT 72109837
HSP 8 Score: 303.971 bits (164), Expect = 4.308e-80
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Query: 1286 AGTTTGAGAAAGACAAATATGATGAAGATTCTGCCATTGAATCGTATATGATGCAACATGGTGTTTGTGAAGAAGAAGCCTATGATGAACTCAATAAGCTTATAATTAATTCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCAACTAAATTAGCTTCACCCATATTACTTAGGGTTCTTAATTTTTCTAGGGTTATGGATCTTCTCTACAAAAATGGTGATGGTTTTACACATGTTGGAAAAGTCACCAAAGATACTGTTGCTGCTTTGCTAATTGATCCCATT 1572
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Sbjct: 72028033 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 72028319
HSP 9 Score: 296.584 bits (160), Expect = 7.209e-78
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Query: 1035 GTTTAAAGAGTTAATCCGATCATATTTTGATGAAGCTCGATGGTTGAATAGTGGACGTGTCCCAAATTTTGAAGAGTACATGGAATTTGCAACCATTAATTGTGGTTACTATATGTTGATAGTGAGTTCTTTGGTTGGAATAAAAACTAGTATTGTAACCAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTATTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 1287
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Sbjct: 72053047 GTTTAAGGGATTAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGCAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 72053299
HSP 10 Score: 291.044 bits (157), Expect = 3.354e-76
Identity = 201/223 (90.13%), Postives = 201/223 (90.13%), Query Frame = 1
Query: 676 AGGTGGTGGAAAGAATCAAACTTTGTACAAAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGAATTGTGGAGCTCTATCTGTGGATGTTAGGAGTCTATTATGAACCCCAATACTCTTTGGCAAGAAATATTTTAGCCAAAATCATAGCTTTTTCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACATTTGAAGAGCTTGAACTCCTAACTCAAGCAATTGAAAGGT 898
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Sbjct: 72052230 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCGATACTGTTTGGCAAGAAATATTTTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGCTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 72052452
HSP 11 Score: 279.964 bits (151), Expect = 7.260e-73
Identity = 199/223 (89.24%), Postives = 199/223 (89.24%), Query Frame = 1
Query: 676 AGGTGGTGGAAAGAATCAAACTTTGTACAAAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGAATTGTGGAGCTCTATCTGTGGATGTTAGGAGTCTATTATGAACCCCAATACTCTTTGGCAAGAAATATTTTAGCCAAAATCATAGCTTTTTCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACATTTGAAGAGCTTGAACTCCTAACTCAAGCAATTGAAAGGT 898
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Sbjct: 72025539 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACTCTTGAAGAACTTGAGATCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 72025761
HSP 12 Score: 261.498 bits (141), Expect = 2.630e-67
Identity = 200/229 (87.34%), Postives = 200/229 (87.34%), Query Frame = 1
Query: 1060 TTTG-ATGAAGCTCGATGGTTGAATAGTGGACGTGTCCCAAATTTTGAAGAGTACATGGAATTTGCAACCATTAATTGTGGTTACTATATGTTGATAGTGAGTTCTTTGGTTGGAATAAAAACTAGTATTGTAACCAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTATTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 1287
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Sbjct: 72027236 TTTGAATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGATACATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGGTAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCCGAACACAAG 72027464
HSP 13 Score: 261.498 bits (141), Expect = 2.630e-67
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Query: 895 AGGTGGGATATAAATTGTATTGATACACTCAATCAAGAATATTTGAAAACATTTTATAAGGATCTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTTACAAAAGAAGAAACTTATAGAGTTCATTATGCAAAAGAAGTG 1035
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Sbjct: 72109737 AGGTGGGATATAAATTGTATTGATACACTCAATCAAGAATATTTGAAAACATTTTATAAGGATCTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTTACAAAAGAAGAAACTTATAGAGTTCATTATGCAAAAGAAGTG 72109597
HSP 14 Score: 196.865 bits (106), Expect = 7.521e-48
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Query: 676 AGGTGGTGGAAAGAATCAAACTTTGTACAAAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGAATTGTGGAGCTCTATCTGTGGATGTTAGGAGTCTATTATGAACCCCAATACTCTTTGGCAAGAAATATTTTAGCCAAAATCATAGCTTTTTCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACATTTGAAGAGCTTGAACTCCTAACTCAAGCAATTGAAAGGT 898
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Sbjct: 54899051 AGGTGGTGGAAAGAAATAGACTTTGTACACAAACTACCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAGCTATACCTTTGGCTATTAGGAGTTTTTCATGAACCTGAATTGTCACTGGCAAGAATTATTTCAACAAAAGTTATTGCATTGGCCTCAGTTGCAGATGATATTTATGATGCATATGGTACATTTGAAGAGCTTGAGCTCCTTACTGAATCAATTAATAGGT 54899273
HSP 15 Score: 196.865 bits (106), Expect = 7.521e-48
Identity = 231/286 (80.77%), Postives = 231/286 (80.77%), Query Frame = 1
Query: 1 CAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAGGTGATTAGAAGAGAAATATTTGGGGAATCATCAATATCATCATCAGCTTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATATGATAGAACAAATCTACAACAAAACCAATAATTTTGATCTTCTTAAGGATGAAGAGTTGCATGATGTTTCCTTGTGGGTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGGGTTTCTTCTG 286
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Sbjct: 72023119 CAACAACAAAAGGTTGAGAAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGG------------A-GAT--T-A--TTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACCAATA-TT--GAT---------GATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGGCAACATGGATTTAGAATTTCTTCTG 72023374
HSP 16 Score: 191.325 bits (103), Expect = 3.499e-46
Identity = 171/202 (84.65%), Postives = 171/202 (84.65%), Query Frame = 1
Query: 83 ATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATATGATAGAACAAATCTACAACAAAACCAATAATTTTGATCTTCTTAAGGATGAAGAGTTGCATGATGTTTCCTTGTGGGTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGGGTTTCTTC 284
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Sbjct: 72050757 ATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAATCTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACCAATA-TT--GAT---------GATGAAGATTTACACCATGTTTCTTTACGGTTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTC 72050946
HSP 17 Score: 180.245 bits (97), Expect = 7.575e-43
Identity = 125/139 (89.93%), Postives = 125/139 (89.93%), Query Frame = 1
Query: 895 AGGTGGGATATAAATTGTATTGATACACTCAATCAAGAATATTTGAAAACATTTTATAAGGATCTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTTACAAAAGAAGAAACTTATAGAGTTCATTATGCAAAAGAAG 1033
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Sbjct: 72052817 AGGTGGGATATAAATTGTGTGGATACACTGAATCAAGAATATATGCAAACATTTTATAAGGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTAGAAAAAGAAGAACAATACAAAGTTCATTATGCAAAAGAAG 72052955
HSP 18 Score: 147.006 bits (79), Expect = 7.683e-33
Identity = 121/141 (85.82%), Postives = 121/141 (85.82%), Query Frame = 1
Query: 895 AGGTGGGATATAAATTGTATTGATACACTCAATCAAGAATATTTGAAAACATTTTATAA--GGATCTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTTACAAAAGAAGAAACTTATAGAGTTCATTATGCAAAAGAAG 1033
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Sbjct: 72026975 AGGTGGGATATAAATTGTGTAGATAAACTGAATCAGGAATATATGCAAACATTTTATAAAATGATTGTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAACTGCTAGAAAAAGAAG-AACATACAGAGTTCATTATGCAAA-GAAG 72027113
HSP 19 Score: 117.459 bits (63), Expect = 6.024e-24
Identity = 71/75 (94.67%), Postives = 71/75 (94.67%), Query Frame = 1
Query: 1 CAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAGGTGATTAGAAGAGAAATATTTGGGGAATCATCAATATCATCATCA 75
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Sbjct: 72045661 CAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGATTAGAAGAGAAATATTTGGAGAATCATCATCATCATCATCA 72045735
BLAST of TPS55 vs. Genbank
Match Name:
AGQN03004425.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 004429F, whole genome shotgun sequence
HSP 1 Score: 455.396 bits (246), Expect = 1.124e-125
Identity = 343/390 (87.95%), Postives = 343/390 (87.95%), Query Frame = 1
Query: 286 GATATATTTAAAAAATTCAAAGATGAGGATGGAAACTTTAAAAAATGTTTGGTAAGTGATACTCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGG---CGAAGAAAAAAGAACACCATGATGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATATCGTGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTGAATCTTCATACTAAGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTTAATCTATTACAATCCCTACACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATC 672
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Sbjct: 66426 GATATATTTGACAAGTTCAAAGATGAGAATGGCAACTTTAAAGAATGTTTGGCGAGTGACACCGTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAGGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATTTACTAGATGAAGCCCTTTCTTTCACTACCAAACACCTAACTGAATTTTTGGAAAATAATAAAAAAGAACACC-CCA--ATGATGATCCATTATCAAAGGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTGAATCTCCATGCAAGGTATTTCATTTCAATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTATTACAATCCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATC 66040
HSP 2 Score: 219.025 bits (118), Expect = 1.605e-54
Identity = 188/223 (84.30%), Postives = 188/223 (84.30%), Query Frame = 1
Query: 676 AGGTGGTGGAAAGAATCAAACTTTGTACAAAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGAATTGTGGAGCTCTATCTGTGGATGTTAGGAGTCTATTATGAACCCCAATACTCTTTGGCAAGAAATATTTTAGCCAAAATCATAGCTTTTTCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACATTTGAAGAGCTTGAACTCCTAACTCAAGCAATTGAAAGGT 898
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Sbjct: 8804 AGGTGGTGGAAGGAATTAGACAGTGCACACAACTTTCCATTTGCAAGAAATAGGATTGTGGAACTATACATTTGGATATTAGGAGTCTATTATGAACCCCAATACTCTTTTGCAAGAAATATTTTAGTGAAGATCATAGCCCTTGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATTCATATGGTATATTTGAAGAACATAAGCTCCTTATTGAAGCAATTGACAGGT 8582
HSP 3 Score: 219.025 bits (118), Expect = 1.605e-54
Identity = 188/223 (84.30%), Postives = 188/223 (84.30%), Query Frame = 1
Query: 676 AGGTGGTGGAAAGAATCAAACTTTGTACAAAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGAATTGTGGAGCTCTATCTGTGGATGTTAGGAGTCTATTATGAACCCCAATACTCTTTGGCAAGAAATATTTTAGCCAAAATCATAGCTTTTTCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACATTTGAAGAGCTTGAACTCCTAACTCAAGCAATTGAAAGGT 898
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Sbjct: 65929 AGGTGGTGGAAGGAATTAGACAGTGCACACAACTTTCCATTTGCAAGAAATAGGATTGTGGAACTATACATTTGGATATTAGGAGTCTATTATGAACCCCAATACTCTTTTGCAAGAAATATTTTAGTGAAGATCATAGCACTTTCCTCAATCGCTGATGATATTTATGATTCATATGGTATATTTGAAGAACATAAGCTCCTTATTGAAGCAATTGATAGGT 65707
HSP 4 Score: 206.098 bits (111), Expect = 1.250e-50
Identity = 197/240 (82.08%), Postives = 197/240 (82.08%), Query Frame = 1
Query: 1333 ATGATGCAACATGGTGTTTGTGAAGAAGAAGCCTATGATGAACTCAATAAGCTTATAATTAATTCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCAACTAAATTAGCTTCACCCATATTACTTAGGGTTCTTAATTTTTCTAGGGTTATGGATCTTCTCTACAAAAATGGTGATGGTTTTACACATGTTGGAAAAGTCACCAAAGATACTGTTGCTGCTTTGCTAATTGATCCCATT 1572
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Sbjct: 63177 ATGAAGCAATATGGTGTATCAGAAGAAGAAGCATGTGATGAAATGAATAGGCGAGTGGTTATTGCATGGAAAGAAATAAACGAAGAGTTTCTCAAACCAACTGAAGCAGCTTCACCTATATTAGTTCGTGCTCTGAATCTTGCTAGGGTTATGGATCTTCTCTACAAAAATGGTGATAACTATACACAAGTTGGAAAAGTCACTAAAGATAGTGTTGCTGTCTTGCTCATTGATCCAATT 62938
HSP 5 Score: 163.625 bits (88), Expect = 7.629e-38
Identity = 109/118 (92.37%), Postives = 109/118 (92.37%), Query Frame = 1
Query: 560 ATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAA-----GTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTTAATCTATTACAATCCCTACACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATC 672
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Sbjct: 9031 ATTTCATTTCAATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAATTAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTATTACAATCCTTGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATC 8914
BLAST of TPS55 vs. Genbank
Match Name:
AGQN03002522.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 002526F, whole genome shotgun sequence
HSP 1 Score: 453.549 bits (245), Expect = 4.042e-125
Identity = 343/390 (87.95%), Postives = 343/390 (87.95%), Query Frame = 1
Query: 286 GATATATTTAAAAAATTCAAAGATGAGGATGGAAACTTTAAAAAATGTTTGGTAAGTGATACTCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGG---CGAAGAAAAAAGAACACCATGATGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATATCGTGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTGAATCTTCATACTAAGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTTAATCTATTACAATCCCTACACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATC 672
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Sbjct: 105180 GATATATTTGACAAGTTCAAAGATGAGAATGGCAACTTTAAAGAATGTTTGGCGAGTGACACCGTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAGGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATTTACTAGATGAAGCCCTTTCTTTCACTACCAAACACCTAACTGAATTTTTGGAAAATAATAAAAAAGAACACCCA-AT---GATGATCCATTATCAAAGGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTGAATCTCCATGCAAGGTATTTCATTTCAATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTATTACAATCCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATC 105565
HSP 2 Score: 219.025 bits (118), Expect = 1.605e-54
Identity = 188/223 (84.30%), Postives = 188/223 (84.30%), Query Frame = 1
Query: 676 AGGTGGTGGAAAGAATCAAACTTTGTACAAAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGAATTGTGGAGCTCTATCTGTGGATGTTAGGAGTCTATTATGAACCCCAATACTCTTTGGCAAGAAATATTTTAGCCAAAATCATAGCTTTTTCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACATTTGAAGAGCTTGAACTCCTAACTCAAGCAATTGAAAGGT 898
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Sbjct: 105676 AGGTGGTGGAAGGAATTAGACAGTGCACACAACTTTCCATTTGCAAGAAATAGGATTGTGGAACTATACATTTGGATATTAGGAGTCTATTATGAACCCCAATACTCTTTTGCAAGAAATATTTTAGTGAAGATCATAGCACTTTCCTCAATCGCTGATGATATTTATGATTCATATGGTATATTTGAAGAACATAAGCTCCTTATTGAAGCAATTGATAGGT 105898
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Query: 1333 ATGATGCAACATGGTGTTTGTGAAGAAGAAGCCTATGATGAACTCAATAAGCTTATAATTAATTCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCAACTAAATTAGCTTCACCCATATTACTTAGGGTTCTTAATTTTTCTAGGGTTATGGATCTTCTCTACAAAAATGGTGATGGTTTTACACATGTTGGAAAAGTCACCAAAGATACTGTTGCTGCTTTGCTAATTGATCCCATT 1572
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Sbjct: 108415 ATGAAGCAATATGGTGTATCAGAAGAAGAAGCATGTGATGAAATGAATAGGCGAGTGGTTATTGCATGGAAAGAAATAAACGAAGAGTTTCTCAAACCAACTGAAGCAGCTTCACCTATATTAGTTCGTGCTCTGAATCTTGCTAGGGTTATGGATCTTCTCTACAAAAATGGTGATAACTATACACAAGTTGGAAAAGTCACTAAAGATAGTGTTGCTGTCTTGCTCATTGATCCAATT 108654
BLAST of TPS55 vs. Genbank
Match Name:
CM010793.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 3, whole genome shotgun sequence
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Sbjct: 42308296 AGGTGGTGGAAAGAA-CATGACTTTGCAAACAAATTCCCTTTTGCAAGGGATAGAATGGTGGAATTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTTTGAGCCGAAATACTCTCGAGCAAGAAAACTTTTAGCCAAAGTCATTGCCTTCGCCTCAATCATTGATGATATTTATGATGCATATGGTACAATTGATGAGCTTGAGCTTCTTACCAAAGCAATTGAAAGGT 42308074
BLAST of TPS55 vs. Genbank
Match Name:
CM010794.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 4, whole genome shotgun sequence
HSP 1 Score: 167.319 bits (90), Expect = 5.897e-39
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Sbjct: 916336 AGGTGGTGGAAAGAATTAGACTTGGCAAACAAACTACCATTTGCAAGAAATAGGATTGTGGAGCTATACCTTTGGATACTAGGAGTCTTTCATGAACCTCAATTCTCTCTTGCAAGAAAAATCTTAATTAAAGCCATTTCAATGGCCTCAGTTGCAGATGATATTTATGATGCATATGGTACATTTGAAGAACTTGAGCTCCTCACCGAAGCAATT 916551
BLAST of TPS55 vs. Genbank
Match Name:
CM010799.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 7, whole genome shotgun sequence
HSP 1 Score: 163.625 bits (88), Expect = 7.629e-38
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Sbjct: 22557733 AGGTGGTGGAAAGA-GCATGAGTTTGCAAAGAAATTTCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACAGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTCGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTAGCCTCAATCACTGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTGAGCTTCTTACAAAAGCAATGCAAAGGT 22557511
HSP 2 Score: 163.625 bits (88), Expect = 7.629e-38
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Query: 676 AGGTGGTGGAAAGAATCA-AACTTTGTACAAAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGAATTGTGGAGCTCTATCTGTGGATGTTAGGAGTCTATTATGAACCCCAATACTCTTTGGCAAGAAATATTTTAGCCAAAATCATAGCTTTTTCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACATTTGAAGAGCTTGAACTCCTAACTCAAGCAATTGAAAGGT 898
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Sbjct: 47133503 AGGTGGTGGAAAGA-GCATGAGTTTGCAAAGAAATTTCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACAGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTCGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTAGCCTCAATCACTGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTGAGCTTCTTACAAAAGCAATGCAAAGGT 47133725
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Query: 676 AGGTGGTGGAAAGAATCA-AACTTTGTACAAAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGAATTGTGGAGCTCTATCTGTGGATGTTAGGAGTCTATTATGAACCCCAATACTCTTTGGCAAGAAATATTTTAGCCAAAATCATAGCTTTTTCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACATTTGAAGAGCTTGAACTCCTAACTCAAGCAAT 890
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Sbjct: 22530333 AGGTGGTGG-AAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTCGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACTGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAAT 22530119
HSP 4 Score: 158.086 bits (85), Expect = 3.549e-36
Identity = 173/216 (80.09%), Postives = 173/216 (80.09%), Query Frame = 1
Query: 676 AGGTGGTGGAAAGAATCA-AACTTTGTACAAAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGAATTGTGGAGCTCTATCTGTGGATGTTAGGAGTCTATTATGAACCCCAATACTCTTTGGCAAGAAATATTTTAGCCAAAATCATAGCTTTTTCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACATTTGAAGAGCTTGAACTCCTAACTCAAGCAAT 890
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Sbjct: 47154083 AGGTGGTGG-AAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGT-TATTATGAACCCAAATACTCTGAG-CAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACTGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAAGCAAT 47154295
Match Name | Summary |
CM010796.2 | E-Value: 6.258e-178, PID: 99.49 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 5, whole genome shotgun sequence [more] |
CM010792.2 | E-Value: 1.355e-174, PID: 98.22 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 2, whole genome shotgun sequence [more] |
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AGQN03002522.1 | E-Value: 4.042e-125, PID: 87.95 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 002526F, whole genome shotgun sequence [more] |
CM010793.2 | E-Value: 1.628e-44, PID: 81.70 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 3, whole genome shotgun sequence [more] |
CM010794.2 | E-Value: 5.897e-39, PID: 80.56 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 4, whole genome shotgun sequence [more] |
CM010799.2 | E-Value: 7.629e-38, PID: 79.91 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 7, whole genome shotgun sequence [more] |