BLAST of TPS42 vs. Genbank
Match Name:
NC_044374.1
Description: Cannabis sativa chromosome 5, cs10, whole genome shotgun sequence
HSP 1 Score: 529.262 bits (286), Expect = 7.001e-148
Identity = 290/292 (99.32%), Postives = 290/292 (99.32%), Query Frame = 1
Query: 1422 GGATGAAATGAAAAGAGGCGATGTTCCTACATCAATTCAATGTTACATGCATGATACTGGTGTTTCTGAAGACGAAGCTCGTGAGCACATCAAGCATTTGATAAGCGAATCATGGAAGGAGATGAATAATGAAAATGGAGATCATAATTCTTCTTTCTCGAAAGAATTTGTTCATGTTTGCAAAAATCTTGGTAGAGCGTCACAATTTATATACCAATATGGAGATGGACATGCTTCTCAAAATACTCTATCAAAAGATCGTATTTTTAAAATTATTATTAATCCTTTCCCC 1713
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Sbjct: 2422654 GGATGAAATGAAAAGAGGCGATGTTCCTACATCAATTCAATGTTACATGCATGATACTGGTATTTCTGAAGACGAAGCTCGTGAGCACATCAAGCATTTGATAAGCGAATCATGGAAGGAGATGAATAATGAAAATGGAGATCATAATTCTTCTTTCTCGAAAGAATTTGTTCATGTTTGCAAAAATCTTGGTAGAGCGTCACAATTTATTTACCAATATGGAGATGGACATGCTTCTCAAAATACTCTATCAAAAGATCGTATTTTTAAAATTATTATTAATCCTTTCCCC 2422363
HSP 2 Score: 459.089 bits (248), Expect = 9.316e-127
Identity = 252/254 (99.21%), Postives = 252/254 (99.21%), Query Frame = 1
Query: 1170 GTGGATAGACATATGTAAACATCAATTGCAAGAGGCAAAATGGTTCTATAGTGGATACCAACCAACATTGCAAGAATATACTGAAAATGCTTGGATTTCAGTAGGAGGACCAGCTTTTCTTATGCATGCTTATTTCTGTTTTACAAATCTCATAACAAATGAAGAAGTGGAATGTCTTAAAGAGGGTTATCCCAATATTGTTCGACATGGATCCCTAATATTACGACTTGCAGATGATCTAGGAACATGTTCGG 1423
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Sbjct: 2423062 GTGGATAGACATATGTAAACATCAATTGCAAGAGGCAAAATGGTTCTATAGTGGATACCAACCAACATTGCAAGAATATACTGAAAATGCTTGGATTTCAGTAGGAGGACCAGCTTTTCTTATGCATGCTTATTTCTGTTTTACCAATCTCATAACAAATGAAGAAGTGGAATGTCTTAAAGAGGGTTATCCCAATATTGTTCGACATGGATCCCTAATATTACGACTTGCGGATGATCTAGGAACATGTTCGG 2422809
HSP 3 Score: 459.089 bits (248), Expect = 9.316e-127
Identity = 357/409 (87.29%), Postives = 357/409 (87.29%), Query Frame = 1
Query: 408 AGAAATTTTCAATGATTTTAAGGATGATGAAACAGGAGAGTTCAAGGCAACTATAAATGATGATATTATGGGAGCATTGGCTTTATATGAAGCTTCATTTTATGGGAAAAATGGTGAAAGTGTTTTGGAAGAAGCAAGAATTTTCACAACCAAATGTCTTGAAAAATACAAAATATTGTCAAGTGATAATAATAATAATAATAATAAT-ATATTATTATTAGTGGATCATGCTTTGGAAATGCCACTTCATTGGAGAATCACAAAATCAGAAGCTAGATGGTTCATTGAAGAAATATATGAGAAAAAACAAGACATGATGATGAATTCTACTTTGCTTGAGTTTGCCAAATTGGATTTCAACATTGTGCAATCAACATATCAAGAAGAGCTCAAA-TATCTCTCTAGGT 814
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Sbjct: 2429137 AGAAATTTTCAATAATTTTAAAAATCACAAGACAGGAGAGTTCAAGGCAAATATAAGTAATGATATTATGGGAGCATTGGGCTTATATGAAGCTTCATTCCATGGGAAAAAGGGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCAAGAATTTTCACAACAAAATGTCTCAAAAAATACAAATTAATGTCAAGTAGTAATAATAATAATA-TGACATTAATATCATTATTAGTGAATCATGCTTTGGAGATGCCACTTCAATGGAGAATCACAAGATCAGAAGCTAAATGGTTTATTGAAGAAATATATGAAAGAAAACAAGACATGA--ATCCA----ACTTTACTTGAGTTTGCCAAATTGGATTTCAATATGCTGCAATCAACATATCAAGAGGAGCTCAAAGTA-CTCTCTAGGT 2428737
HSP 4 Score: 407.383 bits (220), Expect = 3.423e-111
Identity = 222/223 (99.55%), Postives = 222/223 (99.55%), Query Frame = 1
Query: 811 AGGTGGTGGAAGCATTCTAAACTTGGAGAGAAATTGCCTTTCGTTAGAGATAGATTGATGGAGTGTTTCATGTGGCAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAGAATTCAGTTACTTTAGAATAATTGCTACACAAATCTATGTTCTAATCACAATAATTGATGATATGCATGACATATATGCAACTTTGGAGGAACTACAACTCTTCGCTAATGCTCTTCAAAGGT 1033
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Sbjct: 2424197 AGGTGGTGGAAGCATTCTAAACTTGGAGAGAAATTGCCTTTCGTTAGAGATAGATTGATGGAGTGTTTCATGTGGCAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAGAATTCAGTTACTTTAGAATAATTGCTACACAAATCTATGTTCTAATCACAATAATTGATGATATGCATGACATATATGCAACTTTGGAGGAACTACAACTTTTCGCTAATGCTCTTCAAAGGT 2423975
HSP 5 Score: 399.997 bits (216), Expect = 5.727e-109
Identity = 358/423 (84.63%), Postives = 358/423 (84.63%), Query Frame = 1
Query: 408 AGAAATTTTCAATGATTTT-AAGGATGATGAAACAGGAGAGTTCAAGGCAACTATAAATGATGATATTATGGGAGCATTGGCTTTATATGAAGCTTCATTTTATGGGAAAAATGGTGAAAGTGTTTTGGAAGAAGCAAGAATTTTCACAACCAAATGTCTTGAAAAATACAAAATA-T-TGTCAAGTGATAATAATAATAATAATAA--T-A-AT--ATATTATTATTAGTGGATCATGCTTTGGAAATGCCAC---TTCATTGGAGAATCACAAAATCAGAAGCTAGATGGT-TC---ATTGAAGAAATATATGAGAAAAAACAAGACATGATGATGAATTCTACTTTGCTTGAGTTTGCCAAATTGGATTTCAACATTGTGCAATCAACATATCAAGAAGAGCTCAAATATCTCTCTAGGT 814
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Sbjct: 2541692 AGAAATTTTCAATAATTTTTAAGGATGATGAGAGTGGAGAGATCAAGGCAAATATAAGTAATGATATTATGGGAGCATTGGGCTTATATGAAGCTTCATTCCATGGGAAAAAGGGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCAAGAATTTTCACAACAAAATGTCTCAAAAAATACAGATTAATGTGTCAAGTAGTAATAGTAATAATAATAACATGACATTAATATCATTATTAGTGAATCATGCTTTGGAGATGCCACAGCTTCAATGGAGAATC-CTTGATAAGAAGCTAAATGGTCTATTAATTGAAGAAATATATGAAAGAAAACAAGACATGA--ATCCA----ACTTTACTTGAGTTTGCCAAATTGGATTTCAATATGGTGCAATCAACATATCAAGAGGAGCTCAAATTACTCTCTAGGT 2541277
HSP 6 Score: 329.824 bits (178), Expect = 7.621e-88
Identity = 255/293 (87.03%), Postives = 255/293 (87.03%), Query Frame = 1
Query: 1422 GGATGAAATGAAAAGAGGCGATGTTCCTACATCAATTCAATGTTACATGCATGATACTGGTGTTTCTGAAGACGAAGCTCGTGAGCACATCAAGCATTTGATAAGCGAATCATGGAAGGAGATGAATAATGAAAATGGAGATCATAATTCTTCTTTCTCGAAAGAATTTGTTCATGTTTGCAAAAATCTTGGTAGAGCGTCACAATTTATATACCAATATGGAGATGGACATGCTTCTCAAAATACTCTATCAAAAGATCGTATTTTTAAAATT-ATTATTAATCCTTTCCCC 1713
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Sbjct: 2426184 GGATGAACTGAAAAGAGGCGATGTTCCTAAATCAATTCAATGTTATATGCACGATACTGGTGCTTCTGAAGATGAAGCTCGTGAGCACATAAAATATTTAATAAGTGAATCATGGAAGGAGATGAATAATGAAGATGGAAATATTAACTCTTTTTTCTCAAATGAATTTGTTCAAGTTTGCAAAAATCTTGGTAGAGCGTCACAATTCATGTATCAGTATGGCGATGGACATGCTTCTCAGAATAATCTATCGAAAGAGCGCGTTTT-AGGGTTGATTATTACTCCTATCCCC 2425893
HSP 7 Score: 318.744 bits (172), Expect = 1.650e-84
Identity = 206/223 (92.38%), Postives = 206/223 (92.38%), Query Frame = 1
Query: 811 AGGTGGTGGAAGCATTCTAAACTTGGAGAGAAATTGCCTTTCGTTAGAGATAGATTGATGGAGTGTTTCATGTGGCAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAGAATTCAGTTACTTTAGAATAATTGCTACACAAATCTATGTTCTAATCACAATAATTGATGATATGCATGACATATATGCAACTTTGGAGGAACTACAACTCTTCGCTAATGCTCTTCAAAGGT 1033
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Sbjct: 2427777 AGGTGGTGGAAGGATTCTAAACTTGGAGAGAAATTGCCTTTCGTTAGAGATAGATTGGTGGAGTGTTTCTTATGGCAAGTTGGAGTAAGATTTGAGCCACAATTCAGTTACTTTAGAATAATGGATACAAAACTCTATGTTCTATTAACAATAATTGATGATATGCATGACATTTATGGAACATTGGAGGAACTACAACTTTTCACTAATGCTCTTCAAAGGT 2427555
HSP 8 Score: 255.958 bits (138), Expect = 1.312e-65
Identity = 140/141 (99.29%), Postives = 140/141 (99.29%), Query Frame = 1
Query: 1030 AGGTGGGATTTGAAAGTAATAGATGAGTTACCGGATTACATGAAGATGGCTTTCTTCATTTTATACAATTTCACAAATGAAATGGTGTTTAATGTATTAGGAGAACATGGTTTTGTTAACCTTGAATACTTCAAGAAATTG 1170
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Sbjct: 2423466 AGGTGGGATTTGAAAGTAATAGATGAGTTACCGGATTACATGAAGATGGCTTTCCTCATTTTATACAATTTCACAAATGAAATGGTGTTTAATGTATTAGGAGAACATGGTTTTGTTAACCTTGAATACTTCAAGAAATTG 2423326
HSP 9 Score: 235.645 bits (127), Expect = 1.709e-59
Identity = 200/236 (84.75%), Postives = 200/236 (84.75%), Query Frame = 1
Query: 1183 TGTAAACATCAATTGCAAGAGGCAAAATGGTTCTATAGTGGATACCAACCAACATTGCAAGAATATACTGAAAATGCTTGGATTTCAGTAGGAGGACCAGCTTTTCTTATGCATGCTTATTTCTGTTTTACAAAT-CTCATAACAAATGAAGAAGTGGAATGTCTTAAAGAGGGTTATCCCAATATTGTTCGACATGGATCCCTAATATTACGACTTGCAGATGATCTAGGAACAT 1417
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Sbjct: 2426522 TGTAAACATCATTTGCAAGAGGCAAAATGGTTTTATAGTGGATACAAACCAACATTGCAAGAATATGTTGAGAATGGATGGTTGTCTGTGGGAGGACAAGTTATTCTTATGCATGCATATTTCGCTTTTACAAATCCTGTTACCAAA-GAGGCATTGGAATGTCTAAAAGACGGTCATCCTAACATAGTTCGCCATGCATCGATAATATTACGACTTGCAGATGATCTAGGAACAT 2426288
HSP 10 Score: 178.399 bits (96), Expect = 2.921e-42
Identity = 315/415 (75.90%), Postives = 315/415 (75.90%), Query Frame = 1
Query: 408 AGAAATTTTCAATGATTTTAAGGATGATGAAACAGGAGAGTTCAAGGCA-ACTATAAATGATGATATTATGGGAGCATTGGCTTTATATGAAGCTTCATTTTATGGGAAAAATGGTGAAAGTGTTTTGGAAGAAGCAAGAATTTTCACAACCAAATGTCTTGAAAAATACA------AAAT----ATTG-TCAAGTG---ATAATA--A-TAATA-ATAATAATAATAT--AT--T-A--T--TATTAGTGGATCATGCTTTGGAAATGCCACTTCATTGGAGAATCACAAAATCAGAAGCTAGATGGTTCATTGAAGAAATATATGAGAAAAAACAAGACATGATGATGAATTCTACTTTGCTTGAGTTTGCCAAATTGGATTTCAACATTGTGCAATCAACATATCAAGAAGA 794
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Sbjct: 2483289 AGAAATTTTTAATGCTTTCAAGGAT-AAGAGA-GGGA-AATTTAAAACATGCT-TGAGTGATGATATTATGGGAGTATTGTGTTTATATGAAGCTTCATTCTATGCTATGAAACATGAAAATATTTTGGAGGAAGCAAGAATTTTTTCAACTAAATGTCTTAAAAAATACATGGAGAAAATGGAGAATGAGGAAGAGAAAAAAATATTATTATTAGATGATAATAATATTAATAGTAATTTGCTATTAATTAATCACGCTTTCGAGCTTCCGCTTCATTGGAGAATAACAAGATCGGAAGCTAGGTGGTTCATTGACGAAATATATGAGAAAAAACAAGACATGA--AT---T-CGACTTTGTTCGAGTTTGCGAAATTAGATTTTAATATAGTGCAATCAACACACCAAGAAGA 2482885
HSP 11 Score: 178.399 bits (96), Expect = 2.921e-42
Identity = 315/415 (75.90%), Postives = 315/415 (75.90%), Query Frame = 1
Query: 408 AGAAATTTTCAATGATTTTAAGGATGATGAAACAGGAGAGTTCAAGGCA-ACTATAAATGATGATATTATGGGAGCATTGGCTTTATATGAAGCTTCATTTTATGGGAAAAATGGTGAAAGTGTTTTGGAAGAAGCAAGAATTTTCACAACCAAATGTCTTGAAAAATACA------AAAT----ATTG-TCAAGTG---ATAATA--A-TAATA-ATAATAATAATAT--AT--T-A--T--TATTAGTGGATCATGCTTTGGAAATGCCACTTCATTGGAGAATCACAAAATCAGAAGCTAGATGGTTCATTGAAGAAATATATGAGAAAAAACAAGACATGATGATGAATTCTACTTTGCTTGAGTTTGCCAAATTGGATTTCAACATTGTGCAATCAACATATCAAGAAGA 794
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Sbjct: 2521890 AGAAATTTTTAATGCTTTCAAGGAT-AAGAGA-GGGA-AATTTAAAACATGCT-TGAGTGATGATATTATGGGAGTATTGTGTTTATATGAAGCTTCATTCTATGCTATGAAACATGAAAATATTTTGGAGGAAGCAAGAATTTTTTCAACTAAATGTCTTAAAAAATACATGGAGAAAATGGAGAATGAGGAAGAGAAAAAAATATTATTATTAGATGATAATAATATTAATAGTAATTTGCTATTAATTAATCACGCTTTCGAGCTTCCGCTTCATTGGAGAATAACAAGATCGGAAGCTAGGTGGTTCATTGACGAAATATATGAGAAAAAACAAGACATGA--AT---T-CGACTTTGTTCGAGTTTGCGAAATTAGATTTTAATATAGTGCAATCAACACACCAAGAAGA 2521486
HSP 12 Score: 89.7595 bits (48), Expect = 1.408e-15
Identity = 68/77 (88.31%), Postives = 68/77 (88.31%), Query Frame = 1
Query: 63 TAGAAGATCAGGAAACTATGAACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCATTCTCTTTCA---AGCAAATATAAGG 136
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Sbjct: 2399481 TAGAAGATCAGCCAATTATGAACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTACATTCAATCTCTTTCATCAAGCCAATATAAGG 2399405