TPS59 | ICGRC

Annotations

Contact

Cross Reference

Location on Map

Properties

Relationship

Publication

Sequences

Summary

Annotations

This record has the following annotations.
Term	Name	Definition
GO:0000287	magnesium ion binding	Interacting selectively and non-covalently with magnesium (Mg) ions. [GOC:ai]
GO:0016829	lyase activity
GO:0010333	terpene synthase activity	Catalysis of the formation of cyclic terpenes through the cyclization of linear terpenes (e.g. isopentenyl-PP, geranyl-PP, farnesyl-PP and geranylgeranyl-PP) containing varying numbers of isoprene units. [EC:4.2.3.-, GOC:tair_curators]
INTERPRO:IPR008930	Terpenoid_cyclase/PrenylTrfase
INTERPRO:IPR008949	Isoprenoid_synthase_dom_sf
INTERPRO:IPR005630	Terpene_synthase_metal-bd
INTERPRO:IPR036965	Terpene_synth_N_sf
INTERPRO:IPR001906	Terpene_synth_N

Click a tab below to view blast alignments.

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS59 vs. Genbank
Match Name: CM010796.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 5, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 689.921 bits (373), Expect = 0.000e+0
Identity = 387/394 (98.22%), Postives = 387/394 (98.22%), Query Frame = 1

Query:      391 GATATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCTTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGTGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTCAATCTATTACAATGCATGCATAAAAAGGAACTTAGTGAAGTCAGCAGGT 784
                ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 52164441 GATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAGTCAGCAGGT 52164834

HSP 2 Score: 652.988 bits (353), Expect = 0.000e+0
Identity = 381/394 (96.70%), Postives = 381/394 (96.70%), Query Frame = 1

Query:      391 GATATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCTTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGTGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTCAATCTATTACAATGCATGCATAAAAAGGAACTTAGTGAAGTCAGCAGGT 784
                ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct: 52205743 GATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATAAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTACGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAGTTAGATTTT--TCTATTACAAT-CATGCACAAAAAGGA-CTTAGTGAAGTGAGCAGGT 52205354

HSP 3 Score: 590.202 bits (319), Expect = 3.154e-166
Identity = 369/394 (93.65%), Postives = 369/394 (93.65%), Query Frame = 1

Query:      391 GATATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCTTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGTGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTCAATCTATTACAATGCATGCATAAAAAGGAACTTAGTGAAGTCAGCAGGT 784
                ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | | || |||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct: 52215614 GATATATTTAAAAAATTCAAAGATGAGGATGGAAACTTTAAAAAATGTTTGGTAAGTGATACTCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGGTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGATGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATATCGTGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTGAATCTTCATACTAAGCATTTCATTTCGATATACGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTTAATCTATTACAATCCCTACACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATCAGCAGGT 52215221

HSP 4 Score: 475.709 bits (257), Expect = 9.214e-132
Identity = 277/287 (96.52%), Postives = 277/287 (96.52%), Query Frame = 1

Query:     1391 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCCATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAGTCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1677
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 52166556 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTAGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTGTGATGCCAACTGAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTGTAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACAAACGTTGGAAAAATCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 52166842

HSP 5 Score: 464.629 bits (251), Expect = 1.995e-128
Identity = 275/287 (95.82%), Postives = 275/287 (95.82%), Query Frame = 1

Query:     1391 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCCATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAGTCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1677
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 52203092 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTTGAATGCTATATGATTGAACATGGTGTTTGTGAAGAAGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATTAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTGTGAAGCCAACTCAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAATTTTTCTAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACTAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 52202806

HSP 6 Score: 451.703 bits (244), Expect = 1.553e-124
Identity = 250/253 (98.81%), Postives = 250/253 (98.81%), Query Frame = 1

Query:     1140 GTTTAAGGGATTAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 1392
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 52165707 GTTTAAGGGATTAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCTGAACACAAG 52165959

HSP 7 Score: 448.01 bits (242), Expect = 2.009e-123
Identity = 251/255 (98.43%), Postives = 251/255 (98.43%), Query Frame = 1

Query:     1140 GTTTAAGGGATTAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTT--GAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 1392
                |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 52204545 GTTTAAGGAATTAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCATGTTTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 52204291

HSP 8 Score: 442.47 bits (239), Expect = 9.345e-122
Identity = 258/266 (96.99%), Postives = 258/266 (96.99%), Query Frame = 1

Query:      126 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGATTATTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACTAATATTATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTCTG 391
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||
Sbjct: 52162545 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGATTATTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGTTAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACCAA---TATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGA-A--ATGGATTTAGAATTTCTTCTG 52162804

HSP 9 Score: 396.303 bits (214), Expect = 7.379e-108
Identity = 220/223 (98.65%), Postives = 220/223 (98.65%), Query Frame = 1

Query:      781 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTATACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATATTGTTTGGCAAGAAATATTTTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCGGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGCTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 1003
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 52205269 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTATACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTTTACTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGCTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 52205047

HSP 10 Score: 385.223 bits (208), Expect = 1.597e-104
Identity = 218/223 (97.76%), Postives = 218/223 (97.76%), Query Frame = 1

Query:      781 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTATACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATATTGTTTGGCAAGAAATATTTTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCGGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGCTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 1003
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 52164919 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGTTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 52165141

HSP 11 Score: 326.131 bits (176), Expect = 9.820e-87
Identity = 250/287 (87.11%), Postives = 250/287 (87.11%), Query Frame = 1

Query:     1391 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCCATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAGTCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1677
                |||||||| ||||  | ||||| ||| |||| ||  | ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | | ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||| |||
Sbjct: 52211401 AGTTTGAGAAAGACAAATATGATGAAGATTCTGCCATTGAATCGTATATGATGCAACATGGTGTTTGTGAAGAAGAAGCCTATGATGAACTCAATAAGCTTATAATTAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCAACTAAATTAGCTTCACCCATATTACTTCGTGTTCTTAATTTTTCTAGGGTTATGGATCTTCTCTACAAAAATGGTGATGGTTTTACACATGTTGGAAAAGTCACCAAAGATTCTGTTGCTGCTTTGCTAATTGATCCCATT 52211115

HSP 12 Score: 302.124 bits (163), Expect = 1.655e-79
Identity = 223/253 (88.14%), Postives = 223/253 (88.14%), Query Frame = 1

Query:     1140 GTTTAAGGGATTAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 1392
                |||||| |  ||| |||||||  |||| |||||||||||||| ||| |||| ||||   |||||| ||||||||||||| || |||||||      ||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 52214057 GTTTAAAGAGTTAATCCGATCATATTTTGATGAAGCTCGATGGTTGAATAGTGGACGTGTCCCAAATTTTGAAGAGTACATGGAATTTGCAACCATTAATTGTGGTTACTATATGTTGATAGTGAGTTCTTTGGTTGGAATGAAAACAAGTATTGTAACCAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTATTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 52213805

HSP 13 Score: 279.964 bits (151), Expect = 7.754e-73
Identity = 242/282 (85.82%), Postives = 242/282 (85.82%), Query Frame = 1

Query:      126 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGA-------------T--T-A--TTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACTAATATTATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTC 389
                ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||             |  | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||   || | |||| |||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 52206688 GTATTGTCAACAAGAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGGGAAATATTTGGAGAATCATCAATATCATCATCAGCTTATTATGATGGTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGGCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATATGATAGAACAAATCTGCAACCAAACCAATATT---GATGATGAAGATTTACATCATGTTTCTGATCGGTTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTC 52206410

HSP 14 Score: 233.798 bits (126), Expect = 6.123e-59
Identity = 242/293 (82.59%), Postives = 242/293 (82.59%), Query Frame = 1

Query:      126 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGA-------------T--T-A--TTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACTAATATTATTGAT---------GATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTCTG 391
                ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||             |  | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||   || ||||||||||| |||| | |||||         |||||||| || ||  |||||||  |  |  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||
Sbjct: 52216411 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAGGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGAATCATCAATATCATCATCAGCTTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATATGATAGAACAAATCTACAACAAAACCAATAATTTTGATCTTCTTAAGGATGAAGAGTTGCATGATGTTTCCTTGTGGGTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGGGTTTCTTCTG 52216119

HSP 15 Score: 222.718 bits (120), Expect = 1.325e-55
Identity = 132/138 (95.65%), Postives = 132/138 (95.65%), Query Frame = 1

Query:     1003 TGGGATATAAATTGTGTGGATACACTGAATCAAGAATATATGCAAACATTTTATAAGGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTAGAAAAAGAAGAACAATACAAAGTTCATTATGCAAAAGCAGCG 1140
                ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 52204784 TGGGATATAAACTGTGTGGATACACTCAATCAAGAATATATGCAAACATTTTATAAGGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTAGAAAAAGAAGAAACATACCGAGTTCATTATGCAAAAGCAGCG 52204647

HSP 16 Score: 200.558 bits (108), Expect = 6.210e-49
Identity = 125/132 (94.70%), Postives = 125/132 (94.70%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGTTCACACAAATCTTAG-----T-ATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTG 126
                |||||||| ||||||||||     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 52162308 ATGTTCACTCAAATCTTAGCATCATCATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTG 52162439

HSP 17 Score: 174.705 bits (94), Expect = 3.764e-41
Identity = 122/136 (89.71%), Postives = 122/136 (89.71%), Query Frame = 1

Query:     1000 AGGTGGGATATAAATTGTGTGGATACACTGAATCAAGAATATATGCAAACATTTTATAAGGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTAGAAAAAGAAGAACAATACAAAGTTCATTATGCAAAAG 1135
                |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||   || | |||||||||||||||||
Sbjct: 52214323 AGGTGGGATATAAATTGTATTGATACACTCAATCAAGAATATTTGAAAACATTTTATAAGGATCTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTTACAAAAGAAGAAACTTATAGAGTTCATTATGCAAAAG 52214188

[Close]

BLAST of TPS59 vs. Genbank
Match Name: CM010792.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 2, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 689.921 bits (373), Expect = 0.000e+0
Identity = 387/394 (98.22%), Postives = 387/394 (98.22%), Query Frame = 1

Query:      391 GATATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCTTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGTGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTCAATCTATTACAATGCATGCATAAAAAGGAACTTAGTGAAGTCAGCAGGT 784
                ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 72025062 GATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGTGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGATGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAGTCAGCAGGT 72025455

HSP 2 Score: 623.441 bits (337), Expect = 3.110e-176
Identity = 375/394 (95.18%), Postives = 375/394 (95.18%), Query Frame = 1

Query:      391 GATATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCTTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGTGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTCAATCTATTACAATGCATGCATAAAAAGGAACTTAGTGAAGTCAGCAGGT 784
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 72051753 GATATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAGGCTACACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACTTAACCGAGTTTTTGGCAAGGAAAAAAGAATACCATGATGACGATGATCCATTATCAAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTGAATCTTCATGCAAGGCATTTTATTTCGATATATGAAAAAGATGATTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTCAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAGTCAGCAGGT 72052146

HSP 3 Score: 590.202 bits (319), Expect = 3.154e-166
Identity = 369/394 (93.65%), Postives = 369/394 (93.65%), Query Frame = 1

Query:      391 GATATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCTTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGTGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTCAATCTATTACAATGCATGCATAAAAAGGAACTTAGTGAAGTCAGCAGGT 784
                ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct: 72111023 GATATATTTAAAAAATTCAAAGATGAGGATGGCAACTTTAAAAAATGTTTGGTAAGTGATACTCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACAACTAAAAGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCACGATGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATATCGTGCCCTAGAGAGGCCCTTACGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATACTAAGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTTAATCTATTACAATCCCTGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATCAGCAGGT 72110630

HSP 4 Score: 520.029 bits (281), Expect = 4.197e-145
Identity = 285/287 (99.30%), Postives = 285/287 (99.30%), Query Frame = 1

Query:     1391 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCCATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAGTCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1677
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 72028033 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 72028319

HSP 5 Score: 492.329 bits (266), Expect = 9.149e-137
Identity = 280/287 (97.56%), Postives = 280/287 (97.56%), Query Frame = 1

Query:     1391 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCCATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAGTCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1677
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 72053905 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAACTAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAATTTTTGAAGCCAACTAAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACTAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 72054191

HSP 6 Score: 462.783 bits (250), Expect = 7.174e-128
Identity = 252/253 (99.60%), Postives = 252/253 (99.60%), Query Frame = 1

Query:     1140 GTTTAAGGGATTAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 1392
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 72053047 GTTTAAGGGATTAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGCAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 72053299

HSP 7 Score: 455.396 bits (246), Expect = 1.200e-125
Identity = 260/266 (97.74%), Postives = 260/266 (97.74%), Query Frame = 1

Query:      126 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGATTATTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACTAATATTATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTCTG 391
                ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 72023112 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGAAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGATTATTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACCAA---TATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGGCAACATGGATTTAGAATTTCTTCTG 72023374

HSP 8 Score: 412.923 bits (223), Expect = 7.327e-113
Identity = 243/253 (96.05%), Postives = 243/253 (96.05%), Query Frame = 1

Query:     1140 GTTTAAGGGATTAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 1392
                ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 72027212 GTTTAAGGGATTAGTTCAATCTCATTTGAATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGATACATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGGTAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCCGAACACAAG 72027464

HSP 9 Score: 390.763 bits (211), Expect = 3.433e-106
Identity = 219/223 (98.21%), Postives = 219/223 (98.21%), Query Frame = 1

Query:      781 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTATACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATATTGTTTGGCAAGAAATATTTTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCGGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGCTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 1003
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 72052230 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCGATACTGTTTGGCAAGAAATATTTTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGCTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 72052452

HSP 10 Score: 379.683 bits (205), Expect = 7.432e-103
Identity = 217/223 (97.31%), Postives = 217/223 (97.31%), Query Frame = 1

Query:      781 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTATACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATATTGTTTGGCAAGAAATATTTTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCGGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGCTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 1003
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 72025539 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACTCTTGAAGAACTTGAGATCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 72025761

HSP 11 Score: 313.204 bits (169), Expect = 7.645e-83
Identity = 225/253 (88.93%), Postives = 225/253 (88.93%), Query Frame = 1

Query:     1140 GTTTAAGGGATTAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 1392
                |||||| |  ||| |||||||  |||| |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||| ||||||||||||| || |||||||      ||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 72109467 GTTTAAAGAGTTAATCCGATCATATTTTGATGAAGCTCGATGGTTGAATAGTGGACGTATCCCAAATTTTGAAGAGTACATGGAATTTGCAACCATTAATTGTGGTTACTATATGTTGATAGTGAGTTCTTTGGTTGGAATAAAAACTAGTATTGTAACCAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 72109215

HSP 12 Score: 309.511 bits (167), Expect = 9.890e-82
Identity = 185/193 (95.85%), Postives = 185/193 (95.85%), Query Frame = 1

Query:      197 ATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACTAATATTATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTC 389
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 72050757 ATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAATCTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACCAA---TATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTTTACGGTTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTC 72050946

HSP 13 Score: 291.044 bits (157), Expect = 3.582e-76
Identity = 201/223 (90.13%), Postives = 201/223 (90.13%), Query Frame = 1

Query:      781 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTATACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATATTGTTTGGCAAGAAATATTTTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCGGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGCTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 1003
                |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||  | || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 72110059 AGGTGGTGGAAAGAATCAAACTTTGTACAAAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGAATTGTGGAGCTCTATCTGTGGATGTTAGGAGTCTATTATGAACCCCAATACTCTTTGGCAAGAAATATTTTAGTCAAAATCATAGCTTTTTCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGAACATTTGAAGAACTTGAACTCCTAACTCAAGCAATTGAAAGGT 72109837

HSP 14 Score: 289.198 bits (156), Expect = 1.288e-75
Identity = 232/270 (85.93%), Postives = 232/270 (85.93%), Query Frame = 1

Query:     1408 TATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCCATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAGTCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1677
                ||||| |||||||| ||  | ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||||| | | ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||| |||
Sbjct: 72108321 TATGATGAACATTCTGCCATTGAATCGTATATGATGCAACATGGTGTTTGTGAAGAAGAAGCCTATGATGAATTTAATAAGCTTATAAATAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTGTGAAGCCAACTAAATTAGCTTCATCCATATTACTTAGGGTTCTTAATTTTTCTAGGGTTATGGATCTTCTCTACAAAAATGGTGATGGTTTTACACATGTTGGAAAAGTCACCAAAGATACTGTTGCTGCTTTGTTAATTGATCCCATT 72108052

HSP 15 Score: 255.958 bits (138), Expect = 1.307e-65
Identity = 140/141 (99.29%), Postives = 140/141 (99.29%), Query Frame = 1

Query:     1000 AGGTGGGATATAAATTGTGTGGATACACTGAATCAAGAATATATGCAAACATTTTATAAGGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTAGAAAAAGAAGAACAATACAAAGTTCATTATGCAAAAGCAGCG 1140
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 72052817 AGGTGGGATATAAATTGTGTGGATACACTGAATCAAGAATATATGCAAACATTTTATAAGGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTAGAAAAAGAAGAACAATACAAAGTTCATTATGCAAAAGAAGCG 72052957

HSP 16 Score: 215.332 bits (116), Expect = 2.218e-53
Identity = 177/206 (85.92%), Postives = 177/206 (85.92%), Query Frame = 1

Query:      192 TTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACTAATATTATTGATGAT------GAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTCTG 391
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||   || ||||||||||| |||||| |||||  |      |||||||| ||  |||||||  |  |  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||
Sbjct: 72111722 TTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATATGATAGAACAAATCTACAACAAAACCAATATTTTTGATCTTCTTAAGGAAGATTTGCATGATGTTTCCTTGTGGGTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGGGTTTCTTCTG 72111517

HSP 17 Score: 206.098 bits (111), Expect = 1.335e-50
Identity = 126/132 (95.45%), Postives = 126/132 (95.45%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGTTCACACAAATCTTAGT------ATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTG 126
                ||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 72022868 ATGTTCACACAAATCTTAGTATCATCATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTG 72022999

HSP 18 Score: 189.479 bits (102), Expect = 1.344e-45
Identity = 130/143 (90.91%), Postives = 130/143 (90.91%), Query Frame = 1

Query:     1000 AGGTGGGATATAAATTGTGTGGATACACTGAATCAAGAATATATGCAAACATTTTATAA--GGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTAGAAAAAGAAGAACAATACAAAGTTCATTATGCAAAAGCAGCG 1140
                |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||
Sbjct: 72026975 AGGTGGGATATAAATTGTGTAGATAAACTGAATCAGGAATATATGCAAACATTTTATAAAATGATTGTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAACTGCTAGAAAAAGAAGAAC-ATACAGAGTTCATTATGCAAA-GAAGCG 72027115

HSP 19 Score: 174.705 bits (94), Expect = 3.764e-41
Identity = 122/136 (89.71%), Postives = 122/136 (89.71%), Query Frame = 1

Query:     1000 AGGTGGGATATAAATTGTGTGGATACACTGAATCAAGAATATATGCAAACATTTTATAAGGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTAGAAAAAGAAGAACAATACAAAGTTCATTATGCAAAAG 1135
                |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||   || | |||||||||||||||||
Sbjct: 72109737 AGGTGGGATATAAATTGTATTGATACACTCAATCAAGAATATTTGAAAACATTTTATAAGGATCTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTTACAAAAGAAGAAACTTATAGAGTTCATTATGCAAAAG 72109602

HSP 20 Score: 163.625 bits (88), Expect = 8.148e-38
Identity = 100/106 (94.34%), Postives = 100/106 (94.34%), Query Frame = 1

Query:       21 ATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTG 126
                ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 72045446 ATCTTCAAATGACAACCCAAATAAAATTGTTCGTCCTACAAAATCATTTCATCCACATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTG 72045551

HSP 21 Score: 111.919 bits (60), Expect = 2.993e-22
Identity = 62/63 (98.41%), Postives = 62/63 (98.41%), Query Frame = 1

Query:      126 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGA 188
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 72045654 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGATTAGAAGAGAAATATTTGGAGA 72045716

[Close]

BLAST of TPS59 vs. Genbank
Match Name: AGQN03004425.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 004429F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 460.936 bits (249), Expect = 2.580e-127
Identity = 342/387 (88.37%), Postives = 342/387 (88.37%), Query Frame = 1

Query:      391 GATATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCTTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGG---TGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTCAATCTATTACAATGCATGCATAAAAAGGAACTTAGTGAA 774
                ||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||| || | |||||||| ||| |||||||     || |||||||||||||    | | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||
Sbjct:    66426 GATATATTTGACAAGTTCAAAGATGAGAATGGCAACTTTAAAGAATGTTTGGCGAGTGACACCGTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAGGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATTTACTAGATGAAGCCCTTTCTTTCACTACCAAACACCTAACTGAATTTTTGGAAAATAATAAAAAAGAACACC--CCA-ATGATGATCCATTATCAAAGGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTGAATCTCCATGCAAGGTATTTCATTTCAATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTATTACAATCCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAA 66043

HSP 2 Score: 141.466 bits (76), Expect = 3.818e-31
Identity = 103/115 (89.57%), Postives = 103/115 (89.57%), Query Frame = 1

Query:      665 ATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAA-----GTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTCAATCTATTACAATGCATGCATAAAAAGGAACTTAGTGAA 774
                |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||
Sbjct:     9031 ATTTCATTTCAATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAATTAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTATTACAATCCTTGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAA 8917

[Close]

BLAST of TPS59 vs. Genbank
Match Name: AGQN03002522.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 002526F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 459.089 bits (248), Expect = 9.280e-127
Identity = 342/387 (88.37%), Postives = 342/387 (88.37%), Query Frame = 1

Query:      391 GATATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCTTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGG---TGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTCAATCTATTACAATGCATGCATAAAAAGGAACTTAGTGAA 774
                ||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||| || | |||||||| ||| |||||||     || |||||||||||||    | | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||
Sbjct:   105180 GATATATTTGACAAGTTCAAAGATGAGAATGGCAACTTTAAAGAATGTTTGGCGAGTGACACCGTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAGGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATTTACTAGATGAAGCCCTTTCTTTCACTACCAAACACCTAACTGAATTTTTGGAAAATAATAAAAAAGAACACC---CA-ATGATGATCCATTATCAAAGGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTGAATCTCCATGCAAGGTATTTCATTTCAATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTATTACAATCCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAA 105562

[Close]

BLAST of TPS59 vs. Genbank
Match Name: AGQN03007528.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 007533F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 189.479 bits (102), Expect = 1.344e-45
Identity = 200/249 (80.32%), Postives = 200/249 (80.32%), Query Frame = 1

Query:     1429 GAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCCATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAGTCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1677
                ||||| || ||||   || ||||||| |  ||||| ||||| | ||||||| |||||| || | |  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||  || | |||||||| |||||| | | ||||  ||| |||   |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||
Sbjct:    16848 GAATGTTACATGAAGCAATATGGCGTATCAGAAGAAGAAGCATGTGATGAAATGAATAGGCGAGTGGTTATTGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTCTGAAACCAACTGAAGCAGCTTCACCTATATTAGTTCGTGCTCTGAATCTTGCTAGGGTTATAGATCTTCTCTACAAAAATGGTGATAACTATACACAAGTTGGAAAAGTCACTAAAGATAGTGTTGCTGTCTTGCTCATTGATCCAATT 16600


Match Name	Summary
CM010796.2	E-Value: 3.154e-166, PID: 98.22 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 5, whole genome shotgun sequence [more]
CM010792.2	E-Value: 3.110e-176, PID: 98.22 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 2, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03004425.1	E-Value: 2.580e-127, PID: 88.37 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 004429F, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03002522.1	E-Value: 9.280e-127, PID: 88.37 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 002526F, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03007528.1	E-Value: 1.344e-45, PID: 80.32 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 007533F, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS59 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-774_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 804.413 bits (435), Expect = 0.000e+0
Identity = 453/462 (98.05%), Postives = 453/462 (98.05%), Query Frame = 1

Query:     1189 AGAGGACTCATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCCATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAGTCACCAAAGATATT 1650
                ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct:       22 AGAGGATACATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGGTAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCCGAACACAAGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACCAAAGATATT 483

[Close]

BLAST of TPS59 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-66359_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 754.553 bits (408), Expect = 0.000e+0
Identity = 430/441 (97.51%), Postives = 430/441 (97.51%), Query Frame = 1

Query:     1175 CTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCCATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATG 1615
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      374 CTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCTGAACACAAGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTAGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTGTGATGCCAACTGAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTGTAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATG 814

[Close]

BLAST of TPS59 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-776_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 492.329 bits (266), Expect = 1.207e-137
Identity = 280/287 (97.56%), Postives = 280/287 (97.56%), Query Frame = 1

Query:     1391 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCCATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAGTCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1677
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     1280 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAACTAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAATTTTTGAAGCCAACTAAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACTAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1566

HSP 2 Score: 399.997 bits (216), Expect = 7.524e-110
Identity = 218/219 (99.54%), Postives = 218/219 (99.54%), Query Frame = 1

Query:     1174 GCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 1392
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     1006 GCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGCAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 1224

[Close]

BLAST of TPS59 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-66366_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 470.169 bits (254), Expect = 5.654e-131
Identity = 278/290 (95.86%), Postives = 278/290 (95.86%), Query Frame = 1

Query:     1388 ACAAGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCCATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAGTCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1677
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      578 ACAAGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTTGAATGCTATATGATTGAACATGGTGTTTGTGAAGAAGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATTAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTGTGAAGCCAACTCAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAATTTTTCTAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACTAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 867

HSP 2 Score: 329.824 bits (178), Expect = 1.001e-88
Identity = 313/376 (83.24%), Postives = 313/376 (83.24%), Query Frame = 1

Query:       21 ATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTGTATTG-TCAACAACAA-AA--GGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAA-GAGAAATATTTGGAGATTA--TTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACTAATATTATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTC 389
                |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||   ||  | || ||  |||| | |||   ||| |  |||  ||||  |  ||||  |    || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||   || | |||| |||| ||   ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:       30 ATCTTCAAATGAAAACCCAAATAAAATTGTTCGTCCTACAAAAACATTTCATCCACATATTTGGGGAGAACAATTCTTACATTACAATATTTCAGAACAAGATTTG-GTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTT-A-GAAGGGAAATATTTGG--AGAATCATCAATA--TCATCATCAGCTTATTATGATGGTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGGCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATATGATAGAACAAATCTGCAACCAAACCAA---TATTGATGATGAAGATTTACATCATGTTTCTGATCGGTTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTC 395

[Close]

BLAST of TPS59 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-66368_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 278.118 bits (150), Expect = 3.678e-73
Identity = 190/210 (90.48%), Postives = 190/210 (90.48%), Query Frame = 1

Query:     1438 ATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCCATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAGTCACCAAAGAT 1647
                |||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | | ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct:        1 ATGATGCAACATGGTGTTTGTGAAGAAGAAGCCTATGATGAACTCAATAAGCTTATAATTAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCAACTAAATTAGCTTCACCCATATTACTTCGTGTTCTTAATTTTTCTAGGGTTATGGATCTTCTCTACAAAAATGGTGATGGTTTTACACATGTTGGAAAAGTCACCAAAGAT 210


Match Name	Summary
PKGMv1-774_t	E-Value: 0.000e+0, PID: 98.05 Description: No definition line [more]
PKGMv1-66359_t	E-Value: 0.000e+0, PID: 97.51 Description: No definition line [more]
PKGMv1-776_t	E-Value: 1.207e-137, PID: 97.56 Description: No definition line [more]
PKGMv1-66366_t	E-Value: 5.654e-131, PID: 95.86 Description: No definition line [more]
PKGMv1-66368_t	E-Value: 3.678e-73, PID: 90.48 Description: No definition line [more]

blastn of TPS CDS against cs10 genome

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS59 vs. Genbank
Match Name: NC_044377.1
Description: Cannabis sativa chromosome 6, cs10, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 701.001 bits (379), Expect = 0.000e+0
Identity = 389/394 (98.73%), Postives = 389/394 (98.73%), Query Frame = 1

Query:      391 GATATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCTTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGTGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTCAATCTATTACAATGCATGCATAAAAAGGAACTTAGTGAAGTCAGCAGGT 784
                ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 77957146 GATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAACTTAGTGAAGTCAGCAGGT 77957539

HSP 2 Score: 678.841 bits (367), Expect = 0.000e+0
Identity = 385/394 (97.72%), Postives = 385/394 (97.72%), Query Frame = 1

Query:      391 GATATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCTTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGTGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTCAATCTATTACAATGCATGCATAAAAAGGAACTTAGTGAAGTCAGCAGGT 784
                ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 77998467 GATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATAAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTACGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTATTACAATGTATGCACAAAAAGGAACTTAGTGAAGTGAGCAGGT 77998074

HSP 3 Score: 512.642 bits (277), Expect = 6.900e-143
Identity = 356/395 (90.13%), Postives = 356/395 (90.13%), Query Frame = 1

Query:      391 GATATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCTTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGTGAAGAAAAAA-GAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTCAATCTATTACAATGCATGCATAAAAAGGAACTTAGTGAAGTCAGCAGGT 784
                ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||  ||||||||| |||||| |||| |||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| |||||| |||||| |  ||| |||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct: 78008319 GATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAAGATGGCAACTTTAAAAAATATTTGGTAAGTGATACTCTTGGTTTGCTTAGCCTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACTTGACCGAGTTTTTGGCAAAGAAAAAAAGAACACTATGATGACGATGATTTCTTGTCAAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGACCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATGTTCATGCTAAGCATTTCATTTCGATATGTGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGCCAGATTTTAATCTACTACAATCCCAGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATCAGCAGGT 78007925

HSP 4 Score: 507.102 bits (274), Expect = 3.210e-141
Identity = 354/394 (89.85%), Postives = 354/394 (89.85%), Query Frame = 1

Query:      391 GATATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCTTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGTGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTCAATCTATTACAATGCATGCATAAAAAGGAACTTAGTGAAGTCAGCAGGT 784
                ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||  |||| |||||| ||| |||| |||||||||   || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||
Sbjct: 78019508 GATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAAGATGGCAACTTTAAAAAATATTTGGTAAGTGATACTCTTGGTTTGCTTAGCCTATATGAAGCTTCACATTTGAGTTGTGTTGTAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACTTGATTGAGTTTTTGGCAAAGACAAAAGATCACTATGATGACGATGATTTCTTGTCAAAAGAAATATCTCAAGCCCTAGAGAGACCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCTAAGCATTTTATTTCGACGTATGAAAAAGATGCCTCACATAATAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGCTAGATTTCAATCTATTACAATCCATGCACAAAGAGGAGCTTAGTGAAATCAGCAGGT 78019115

HSP 5 Score: 475.709 bits (257), Expect = 9.053e-132
Identity = 277/287 (96.52%), Postives = 277/287 (96.52%), Query Frame = 1

Query:     1391 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCCATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAGTCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1677
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 77959274 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTAGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTGTGATGCCAACTGAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTGTAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACAAACGTTGGAAAAATCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 77959560

HSP 6 Score: 466.476 bits (252), Expect = 5.448e-129
Identity = 343/387 (88.63%), Postives = 343/387 (88.63%), Query Frame = 1

Query:      391 GATATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCTTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGG---TGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTCAATCTATTACAATGCATGCATAAAAAGGAACTTAGTGAA 774
                ||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||| || | |||||||| ||| |||||||     || |||||||||||||    | | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||
Sbjct: 78969935 GATATATTTGACAAGTTCAAAGATGAGAATGGCAACTTTAAAGAATGTTTGGCGAGTGACACCGTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAGGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATTTACTAGATGAAGCCCTTTCTTTCACTACCAAACACCTAACTGAATTTTTGGAAAATAATAAAAAAGAACACC--CCA-ATGATGATCCATTATCAAAGGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTGAATCTCCATGCAAGGTATTTCATTTCAATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTATTACAATCCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAA 78969552

HSP 7 Score: 464.629 bits (251), Expect = 1.960e-128
Identity = 275/287 (95.82%), Postives = 275/287 (95.82%), Query Frame = 1

Query:     1391 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCCATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAGTCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1677
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 77995812 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTTGAATGCTATATGATTGAACATGGTGTTTGTGAAGAAGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATTAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTGTGAAGCCAACTCAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAATTTTTCTAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACTAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 77995526

HSP 8 Score: 451.703 bits (244), Expect = 1.526e-124
Identity = 250/253 (98.81%), Postives = 250/253 (98.81%), Query Frame = 1

Query:     1140 GTTTAAGGGATTAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 1392
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 77958419 GTTTAAGGGATTAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCTGAACACAAG 77958671

HSP 9 Score: 448.01 bits (242), Expect = 1.973e-123
Identity = 251/255 (98.43%), Postives = 251/255 (98.43%), Query Frame = 1

Query:     1140 GTTTAAGGGATTAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTT--GAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 1392
                |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 77997265 GTTTAAGGAATTAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCATGTTTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 77997011

HSP 10 Score: 444.316 bits (240), Expect = 2.553e-122
Identity = 258/266 (96.99%), Postives = 258/266 (96.99%), Query Frame = 1

Query:      126 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGATTATTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACTAATATTATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTCTG 391
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 77955179 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGATTAGAAGAGAAATATTTGGAGATTATTATTATGATGGTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAATTAA---TATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCAATTCGATTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTACAATTTCTTCTG 77955441

HSP 11 Score: 401.843 bits (217), Expect = 1.558e-109
Identity = 221/223 (99.10%), Postives = 221/223 (99.10%), Query Frame = 1

Query:      781 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTATACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATATTGTTTGGCAAGAAATATTTTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCGGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGCTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 1003
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 77997989 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTATACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATATTGTTTGGCAAGAAATATTTTACTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGCTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 77997767

HSP 12 Score: 385.223 bits (208), Expect = 1.569e-104
Identity = 218/223 (97.76%), Postives = 218/223 (97.76%), Query Frame = 1

Query:      781 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTATACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATATTGTTTGGCAAGAAATATTTTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCGGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGCTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 1003
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 77957624 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTAGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTTTAATCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGCTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 77957846

HSP 13 Score: 326.131 bits (176), Expect = 9.648e-87
Identity = 250/287 (87.11%), Postives = 250/287 (87.11%), Query Frame = 1

Query:     1391 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCCATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAGTCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1677
                |||||||| ||||  | ||||| ||| |||| ||  | ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | | ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||| |||
Sbjct: 78004115 AGTTTGAGAAAGACAAATATGATGAAGATTCTGCCATTGAATCGTATATGATGCAACATGGTGTTTGTGAAGAAGAAGCCTATGATGAACTCAATAAGCTTATAATTAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCAACTAAATTAGCTTCACCCATATTACTTCGTGTTCTTAATTTTTCTAGGGTTATGGATCTTCTCTACAAAAATGGTGATGGTTTTACACATGTTGGAAAAGTCACCAAAGATTCTGTTGCTGCTTTGCTAATTGATCCCATT 78003829

HSP 14 Score: 283.658 bits (153), Expect = 5.889e-74
Identity = 220/253 (86.96%), Postives = 220/253 (86.96%), Query Frame = 1

Query:     1140 GTTTAAGGGATTAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 1392
                |||||| |  ||| |||||||  |||| ||||||||| |||| ||| |||| ||||   |||||| ||||||||||||| || |||||||      ||||||||||||  | ||||||||| | || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78006764 GTTTAAAGAGTTAATCCGATCATATTTTGATGAAGCTGGATGGTTGAATAGTGGACATGTCCCAAATTTTGAAGAGTACATGGAATTTGCAACCATTAATTGTGGTTA--ATATGTTGATAGTGAGTTCTTTGGTTGGAATGAAAACAAGTATTGTAACCAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTATTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 78006514

HSP 15 Score: 279.964 bits (151), Expect = 7.618e-73
Identity = 242/282 (85.82%), Postives = 242/282 (85.82%), Query Frame = 1

Query:      126 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGA-------------T--T-A--TTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACTAATATTATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTC 389
                ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||             |  | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||   || | |||| |||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 77999412 GTATTGTCAACAAGAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGGGAAATATTTGGAGAATCATCAATATCATCATCAGCTTATTATGATGGTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGGCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATATGATAGAACAAATCTGCAACCAAACCAATATT---GATGATGAAGATTTACATCATGTTTCTGATCGGTTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTC 77999134

HSP 16 Score: 239.338 bits (129), Expect = 1.293e-60
Identity = 243/293 (82.94%), Postives = 243/293 (82.94%), Query Frame = 1

Query:      126 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGA-------------T--T-A--TTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACTAATA-T--T-ATTGA-T----GATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTCTG 391
                ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||             |  | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  ||   || ||||||||||| |||| |  | |||   |    ||||||||||| ||  |||||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||
Sbjct: 78008755 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAGGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGAATCATCAATATCATCATCAGCTTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAATCTGAAATAGAAAATATGATAGAACAAATCTACAACAAAACCAATAGTGATGATTTTCTCAAAGATGAAGATTTGCATGATGTTTCCTTGTGGTTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGGGTTTCTTCTG 78008463

HSP 17 Score: 239.338 bits (129), Expect = 1.293e-60
Identity = 243/293 (82.94%), Postives = 243/293 (82.94%), Query Frame = 1

Query:      126 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGA-------------T--T-A--TTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACTAATA-T--T-ATTGA-T----GATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTCTG 391
                ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |  | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  ||   || ||||||||||| |||| |  | |||   |    ||||||||||| ||  |||||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||
Sbjct: 78019944 GTATTGTCAACAAGAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGAATCATCATCATCATCATCAGCTTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAATCTGAAATAGAAAATATGATAGAACAAATCTACAACAAAACCAATAGTGATGATTTTCTCAAAGATGAAGATTTGCATGATGTTTCCTTGTGGTTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGGGTTTCTTCTG 78019652

HSP 18 Score: 228.258 bits (123), Expect = 2.799e-57
Identity = 135/141 (95.74%), Postives = 135/141 (95.74%), Query Frame = 1

Query:     1000 AGGTGGGATATAAATTGTGTGGATACACTGAATCAAGAATATATGCAAACATTTTATAAGGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTAGAAAAAGAAGAACAATACAAAGTTCATTATGCAAAAGCAGCG 1140
                |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 77997507 AGGTGGGATATAAACTGTGTGGATACACTCAATCAAGAATATATGCAAACATTTTATAAGGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTAGAAAAAGAAGAAACATACCGAGTTCATTATGCAAAAGCAGCG 77997367

HSP 19 Score: 226.412 bits (122), Expect = 1.007e-56
Identity = 207/248 (83.47%), Postives = 207/248 (83.47%), Query Frame = 1

Query:      145 GTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGA-TTATTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACTAATATTA-TTG-ATG-ATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTT 388
                ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||| | ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||  | | ||| || ||  |   |||||  ||| ||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||
Sbjct: 78976625 GTTGAAGAATTGAAAGAAGTGGTAAGAAAGGAGATATTTGGAGAATTATTA-TGTGATGATTGGAATAATCGATTGAAGTTAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCCTATCATTTTGAGAGTGAAATACAAAATGAGCTTCAACACATTTACAACATTAATGATAATAATTTCAAACATGAAACTTTGCATGATGCTTCTATTCGGTTTAGACTTCTACGACAACATGGATATAGGGTTTCTT 78976379

HSP 20 Score: 196.865 bits (106), Expect = 7.892e-48
Identity = 106/106 (100.00%), Postives = 106/106 (100.00%), Query Frame = 1

Query:       21 ATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTG 126
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 77933230 ATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTG 77933335

HSP 21 Score: 169.165 bits (91), Expect = 1.721e-39
Identity = 121/136 (88.97%), Postives = 121/136 (88.97%), Query Frame = 1

Query:     1000 AGGTGGGATATAAATTGTGTGGATACACTGAATCAAGAATATATGCAAACATTTTATAAGGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTAGAAAAAGAAGAACAATACAAAGTTCATTATGCAAAAG 1135
                |||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||   || | |||||||||||||||||
Sbjct: 78007030 AGGTGGGATATAAATTGCATTGATACACTCAATCAAGAATATTTGAAAACATTTTATAAGGATCTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTTACAAAAGAAGAAACTTATAGAGTTCATTATGCAAAAG 78006895

HSP 22 Score: 169.165 bits (91), Expect = 1.721e-39
Identity = 101/106 (95.28%), Postives = 101/106 (95.28%), Query Frame = 1

Query:       21 ATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTG 126
                ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78008958 ATCTTCAAATGACAACCCAAATAAAATTGTTCGTCCTACAAAAACATTTCATCCACATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTG 78008853

HSP 23 Score: 158.086 bits (85), Expect = 3.724e-36
Identity = 99/106 (93.40%), Postives = 99/106 (93.40%), Query Frame = 1

Query:       21 ATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTG 126
                |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78020156 ATCTTCAAATGAAAACCCAAATAAAATTGTTCGTCCTACAAAAACATTTCATCCACATATTTGGGGAGAACAATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTG 78020051

HSP 24 Score: 141.466 bits (76), Expect = 3.751e-31
Identity = 103/115 (89.57%), Postives = 103/115 (89.57%), Query Frame = 1

Query:      665 ATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAA-----GTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTCAATCTATTACAATGCATGCATAAAAAGGAACTTAGTGAA 774
                |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||
Sbjct: 78946167 ATTTCATTTCAATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAATTAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTATTACAATCCTTGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAA 78946053


Match Name	Summary
NC_044377.1	E-Value: 6.900e-143, PID: 98.73 Description: Cannabis sativa chromosome 6, cs10, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS59 vs. Genbank
Match Name: XM_030622631.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa germacrene-A synthase-like (LOC115695574), mRNA

HSP 1 Score: 2830.19 bits (1532), Expect = 0.000e+0
Identity = 1616/1657 (97.53%), Postives = 1616/1657 (97.53%), Query Frame = 1

Query:       21 ATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTGTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGATTATTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACTAATATTATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTCTGATATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCTTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGTGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTCAATCTATTACAATGCATGCATAAAAAGGAACTTAGTGAAGTCAGCAGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTATACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATATTGTTTGGCAAGAAATATTTTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCGGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGCTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGTGGGATATAAATTGTGTGGATACACTGAATCAAGAATATATGCAAACATTTTATAAGGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTAGAAAAAGAAGAACAATACAAAGTTCATTATGCAAAAGCAGCGTTTAAGGGATTAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCCATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAGTCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1677
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:       27 ATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTGTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGATTAGAAGAGAAATATTTGGAGATTATTATTATGATGGTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAA-T--TAATATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCAATTCGATTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTACAATTTCTTCTGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAACTTAGTGAAGTCAGCAGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTAGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTTTAATCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGCTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGTGGGATATAAATTGTGTAGATAAACTGAATCAGGAATATATGCAAACATTTTATAAAGATGTTTTGAATTGTTACGAAGAGTTTGAGCAACTGCTAGAAAAAGAAGAAACATACAGAGTTCATTATGCAAAAGAAGCGTTTAAGGGATTAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCTGAACACAAGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTAGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTGTGATGCCAACTGAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTGTAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACAAACGTTGGAAAAATCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1680

[Close]

BLAST of TPS59 vs. Genbank
Match Name: XM_030654009.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa alpha-humulene synthase-like (LOC115724669), mRNA

HSP 1 Score: 1947.49 bits (1054), Expect = 0.000e+0
Identity = 1479/1685 (87.77%), Postives = 1479/1685 (87.77%), Query Frame = 1

Query:       21 ATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTGTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGA-------------T--T-A--TTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAAC---TA---AT-ATTAT-T-GATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTCTGATATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCTTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGTGAAG-AAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTCAATCTATTACAATGCATGCATAAAAAGGAACTTAGTGAAGTCAGCAGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTATACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATATTGTTTGGCAAGAAATATTTTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCGGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGCTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGTGGGATATAAATTGTGTGGATACACTGAATCAAGAATATATGCAAACATTTTATAAGGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTAGAAAAAGAAGAACAATACAAAGTTCATTATGCAAAAGCAGCGTTTAAGGGATTAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCCATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAGTCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1677
                ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||             |  | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  ||   || |||||||||||   ||   || ||| | |  | ||||||||||| ||  |||||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| |||||| |||||| |  ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||   || | ||||||||||||||||| || |||||| |  ||| |||||||  |||| ||||||||| |||| ||| |||| ||||   |||||| ||||||||||||| || |||||||      ||||||||||    | ||||||||| | || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||| |||| ||  | ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | | ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||| |||
Sbjct:       27 ATCTTCAAATGACAACCCAAATAAAATTGTTCGTCCTACAAAAACATTTCATCCACATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTGTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAGGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGAATCATCAATATCATCATCAGCTTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAATCTGAAATAGAAAATATGATAGAACAAATCTACAACAAAACCAATAGTGATGATTTTCTCAAAGATGAAGATTTGCATGATGTTTCCTTGTGGTTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGGGTTTCTTCTGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAAGATGGCAACTTTAAAAAATATTTGGTAAGTGATACTCTTGGTTTGCTTAGCCTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACTTGACCGAGTTTTTGGC-AAGAAAAAAAGAACACTATGATGACGATGATTTCTTGTCAAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGACCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATGTTCATGCTAAGCATTTCATTTCGATATGTGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGCCAGATTTTAATCTACTACAATCCCAGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATCAGCAGGTGGTGGAAAGAATCAAACTTTGTACAAAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGAATTGTGGAGCTCTATCTTTGGATGTTAGGAGTCTATTATGAACCCCAATACTCTTTGGCAAGAAACATTTTAGCCAAAATCATAGCTTTTTCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGAACATTTGAAGAACTTGAACTCCTAACTCAAGCAATTGAAAGGTGGGATATAAATTGCATTGATACACTCAATCAAGAATATTTGAAAACATTTTATAAGGATCTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTTACAAAAGAAGAAACTTATAGAGTTCATTATGCAAAAGAAGTGTTTAAAGAGTTAATCCGATCATATTTTGATGAAGCTGGATGGTTGAATAGTGGACATGTCCCAAATTTTGAAGAGTACATGGAATTTGCAACCATTAATTGTGGTNNTAATATGTTGATAGTGAGTTCTTTGGTTGGAATGAAAACAAGTATTGTAACCAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTATTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAGTTTGAGAAAGACAAATATGATGAAGATTCTGCCATTGAATCGTATATGATGCAACATGGTGTTTGTGAAGAAGAAGCCTATGATGAACTCAATAAGCTTATAATTAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCAACTAAATTAGCTTCACCCATATTACTTCGTGTTCTTAATTTTTCTAGGGTTATGGATCTTCTCTACAAAAATGGTGATGGTTTTACACATGTTGGAAAAGTCACCAAAGATTCTGTTGCTGCTTTGCTAATTGATCCCATT 1710

[Close]

BLAST of TPS59 vs. Genbank
Match Name: XM_030653866.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa alpha-humulene synthase (LOC115724563), transcript variant X1, mRNA

HSP 1 Score: 1293.78 bits (700), Expect = 0.000e+0
Identity = 1349/1667 (80.92%), Postives = 1349/1667 (80.92%), Query Frame = 1

Query:       27 AAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTGTATTGTCAACAA-CAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGA-TTATTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACA--AA-ACTAATATTATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTCTGATATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCTTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGG---TGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTCAATCTATTACAATGCATGCATAAAAAGGAACTTAGTGAAGTCAGCAGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTATACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATATTGTTTGGCAAGAAATATTTTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCGGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGCTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGTGGGATATAAATTGTGTGGATACACTGAATCAAGAATATATGCAAACATTTTATAAGGATG-TTTTG-AATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTAGAAAAAGAAGAACAATACAAAGTTCATTATGCAAAAGCAGCGTTTAAGGGATTAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATA-CTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACT---AATATTGTAACAAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAGTTTGAGGAAGATGATTA-TGAGGAAC-ATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCCATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAGTCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1677
                |||||||||   | ||| ||||||||| || |||| ||| |  || ||   |||||||||||| ||||| || |||||| | ||| || || |||| ||| ||| | |||||    || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||| | ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||  ||   ||||| | |  |  |||||  ||| ||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||| || | |||||||| ||| |||||||     || |||||||||||||    | | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||   ||||||||||| |||| |||   || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |  ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||| | | | |||||||| |||||||| | ||||||| |||||| |||  ||| ||||||  |||| | || ||||||| ||  ||||| |||  || ||| || ||||| |||| | | ||||| || |||   ||||||||| | |||| ||||| | |||||||  ||||| |  ||  | |||| || ||||||||||| ||| ||  ||||  ||| |||||||| || ||| | || ||| || |||||| || || |||||| | |||||||||  ||  ||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||  ||| |||   | || | ||||||||  |||||||||| | ||||  ||||||  |||| |||| ||  | | |   || ||  | || | ||||| |||||||   || |||| || |  ||||| ||||| | ||||||| |||||| || | |  | | |||||||||||||||||| ||||||||| | || || ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||  || | ||||||||||||||| | | ||||  ||| |||   |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||
Sbjct:       83 AAATGACAATATACATAAAATTGTTCGGCCAACAACAAATTATCATCCTTCTATTTGGGGAGACCGATTTTTGCATTACGATATTCCAAAAGAAGAATTGAATTATAAACAAGGCCAA-GTTGAAGAATTGAAAGAAGTGGTAAGAAAGGAGATATTTGGAGAATTATTA-TGTGATGATTGGAATAATCGATTGAAGTTAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCCTATCATTTTGAGAGTGAAATACAAAATGAGCTTCAACACATTTACAACATTAATGATAATAATTTCAAACATGAAACTTTGCATGATGCTTCTATTCGGTTTAGACTTCTACGACAACATGGATATAGGGTTTCTTTAGATATATTTGACAAGTTCAAAGATGAGAATGGCAACTTTAAAGAATGTTTGGCGAGTGACACCGTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAGGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATTTACTAGATGAAGCCCTTTCTTTCACTACCAAACACCTAACTGAATTTTTGGAAAATAATAAAAAAGAACACC--CCA-ATGATGATCCATTATCAAAGGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTGAATCTCCATGCAAGGTATTTCATTTCAATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTATTACAATCCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATCTCAAGGTGGTGGAAGGAATTAGACAGTGCACACAACTTTCCATTTGCAAGAAATAGGATTGTGGAACTGTACATTTGGATATTAGGAGTCTATTATGAACCCCAATACTCTTTTGCAAGAAATATTTTAGTGAAGATCATAGCACTTTCCTCAATCGCTGATGATATTTATGATTCATATGGTATATTTGAAGAACATAAGCTCCTTATTGAAGCAATTGATAGGTGGGACAAAAATTGTATGGATAAACTCCATCCAGAATACTTGCAGAAATATTATAAG-ATACTTTTGCAATCTTT-TGAGGAATTTGAACAAGAGTTTGAAAAGGAGGAAACTTACAAAGTTTACTATGGAAAAGAAACGTTTAAAAGATTATTAAGAGGTTATTTTGAAGAAGCTCGATGGTTGAATGAAGGATACATGCCAAGTTTGGAGGAGCATTTAAAAGTTTCTTTGGTTACTTCTGGTTATTTCATGTTGATGGCTT-GCTCTTTAGTTGGAATGAAAAGTAACAATATTGTAACCAAACAAGTTTTCGAGTGGCTCTCCAAAGACCCCAAGATTGCTAGGGCAAGCGCTAGTGTTTGTAGGTACATGGATGACGTGGCTGGTCACAAGAATGAGCAAGA-GAGAAATCATATACCATCTA-CAATAGAATGTTATATGAAGCAATATGGTGTATCAGAAGAAGAAGCATGTGATGAAATGAATAGGCGAGTGGTTATTGCATGGAAAGAAATAAACGAAGAGTTTCTCAAACCAACTGAAGCAGCTTCACCTATATTAGTTCGTGCTCTGAATCTTGCTAGGGTTATGGATCTTCTCTACAAAAATGGTGATAACTATACACAAGTTGGAAAAGTCACTAAAGATAGTGTTGCTGTCTTGCTCATTGATCCAATT 1739

[Close]

BLAST of TPS59 vs. Genbank
Match Name: XM_030622635.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa alpha-humulene synthase-like (LOC115695577), mRNA

HSP 1 Score: 1136.81 bits (615), Expect = 0.000e+0
Identity = 865/983 (88.00%), Postives = 865/983 (88.00%), Query Frame = 1

Query:       21 ATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTGTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGA-------------T--T-A--TTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAAC---TA---AT-ATTAT-T-GATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTCTGATATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCTTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGTGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTCAATCTATTACAATGCATGCATAAAAAGGAACTTAGTGAAGTCAGCAGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTATACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATATTGTTTGGCAAGAAATATTTTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCGGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTG 976
                |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |  | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  ||   || |||||||||||   ||   || ||| | |  | ||||||||||| ||  |||||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||  |||| |||||| ||| |||| |||||||||   || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||
Sbjct:       85 ATCTTCAAATGAAAACCCAAATAAAATTGTTCGTCCTACAAAAACATTTCATCCACATATTTGGGGAGAACAATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTGTATTGTCAACAAGAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGAATCATCATCATCATCATCAGCTTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAATCTGAAATAGAAAATATGATAGAACAAATCTACAACAAAACCAATAGTGATGATTTTCTCAAAGATGAAGATTTGCATGATGTTTCCTTGTGGTTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGGGTTTCTTCTGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAAGATGGCAACTTTAAAAAATATTTGGTAAGTGATACTCTTGGTTTGCTTAGCCTATATGAAGCTTCACATTTGAGTTGTGTTGTAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACTTGATTGAGTTTTTGGCAAAGACAAAAGATCACTATGATGACGATGATTTCTTGTCAAAAGAAATATCTCAAGCCCTAGAGAGACCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCTAAGCATTTTATTTCGACGTATGAAAAAGATGCCTCACATAATAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGCTAGATTTCAATCTATTACAATCCATGCACAAAGAGGAGCTTAGTGAAATCAGCAGGTGGTGGAAAGAATCAAACTTTGTACAAAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGAATTGTGGAGCTCTATCTTTGGATGTTAGGAGTCTATTATGAACCCCAATACTCTTTGGCAAGAAATATTTTAGCCAAAATCATAGCTTTTTCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACTTTTGAAGAAGTTG 1067

[Close]

BLAST of TPS59 vs. Genbank
Match Name: XM_030653867.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa alpha-humulene synthase (LOC115724563), transcript variant X2, mRNA

HSP 1 Score: 725.007 bits (392), Expect = 0.000e+0
Identity = 637/756 (84.26%), Postives = 637/756 (84.26%), Query Frame = 1

Query:       27 AAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTGTATTGTCAACAA-CAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGA-TTATTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACA--AA-ACTAATATTATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTCTGATATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCTTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGG---TGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTCAATCTATTACAATGCATGCATAAAAAGGAACTTAGTGAA 774
                |||||||||   | ||| ||||||||| || |||| ||| |  || ||   |||||||||||| ||||| || |||||| | ||| || || |||| ||| ||| | |||||    || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||| | ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||  ||   ||||| | |  |  |||||  ||| ||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||| || | |||||||| ||| |||||||     || |||||||||||||    | | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||
Sbjct:       83 AAATGACAATATACATAAAATTGTTCGGCCAACAACAAATTATCATCCTTCTATTTGGGGAGACCGATTTTTGCATTACGATATTCCAAAAGAAGAATTGAATTATAAACAAGGCCAA-GTTGAAGAATTGAAAGAAGTGGTAAGAAAGGAGATATTTGGAGAATTATTA-TGTGATGATTGGAATAATCGATTGAAGTTAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCCTATCATTTTGAGAGTGAAATACAAAATGAGCTTCAACACATTTACAACATTAATGATAATAATTTCAAACATGAAACTTTGCATGATGCTTCTATTCGGTTTAGACTTCTACGACAACATGGATATAGGGTTTCTTTAGATATATTTGACAAGTTCAAAGATGAGAATGGCAACTTTAAAGAATGTTTGGCGAGTGACACCGTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAGGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATTTACTAGATGAAGCCCTTTCTTTCACTACCAAACACCTAACTGAATTTTTGGAAAATAATAAAAAAGAACACC--CCA-ATGATGATCCATTATCAAAGGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTGAATCTCCATGCAAGGTATTTCATTTCAATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTATTACAATCCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAA 833


Match Name	Summary
XM_030622631.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 97.53 Description: PREDICTED: Cannabis sativa germacrene-A synthase-like (LOC115695574), mRNA [more]
XM_030654009.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 87.77 Description: PREDICTED: Cannabis sativa alpha-humulene synthase-like (LOC115724669), mRNA [more]
XM_030653866.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 80.92 Description: PREDICTED: Cannabis sativa alpha-humulene synthase (LOC115724563), transcript variant X1, mRNA [more]
XM_030622635.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 88.00 Description: PREDICTED: Cannabis sativa alpha-humulene synthase-like (LOC115695577), mRNA [more]
XM_030653867.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 84.26 Description: PREDICTED: Cannabis sativa alpha-humulene synthase (LOC115724563), transcript variant X2, mRNA [more]

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

Performed on: 2021-09-02
Display provided by the neXtProt Feature Viewer


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 1..5
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 34..52
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 23..33
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 6..22
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 53..58
None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 2..21
None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 31..53
None	No IPR available	PHOBIUS	SIGNAL_PEPTIDE_H_REGION	Signal peptide H-region	coord: 8..18
None	No IPR available	PHOBIUS	SIGNAL_PEPTIDE_N_REGION	Signal peptide N-region	coord: 1..7
None	No IPR available	PHOBIUS	SIGNAL_PEPTIDE	Signal Peptide	coord: 1..23
None	No IPR available	PHOBIUS	SIGNAL_PEPTIDE_C_REGION	Signal peptide C-region	coord: 19..23
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 24..75
None	No IPR available	SIGNALP_EUK	SignalP-noTM	SignalP-noTM	coord: 1..20 score: 0.759
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 14..52
None	No IPR available	PHOBIUS	SIGNAL_PEPTIDE	Signal Peptide	coord: 1..13
None	No IPR available	PHOBIUS	SIGNAL_PEPTIDE_N_REGION	Signal peptide N-region	coord: 1..1
None	No IPR available	PHOBIUS	SIGNAL_PEPTIDE_C_REGION	Signal peptide C-region	coord: 9..13
None	No IPR available	PHOBIUS	SIGNAL_PEPTIDE_H_REGION	Signal peptide H-region	coord: 2..8
None	No IPR available	SIGNALP_EUK	SignalP-noTM	SignalP-noTM	coord: 1..17 score: 0.69
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 1..23
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 46..48
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 24..45
None	No IPR available	PHOBIUS	SIGNAL_PEPTIDE_C_REGION	Signal peptide C-region	coord: 12..16
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 17..55
None	No IPR available	PHOBIUS	SIGNAL_PEPTIDE_N_REGION	Signal peptide N-region	coord: 1..3
None	No IPR available	PHOBIUS	SIGNAL_PEPTIDE_H_REGION	Signal peptide H-region	coord: 4..11
None	No IPR available	PHOBIUS	SIGNAL_PEPTIDE	Signal Peptide	coord: 1..16
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 25..55
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 7..24
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 1..6
None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 2..24
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225	FAMILY NOT NAMED	coord: 9..559
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225:SF42		coord: 9..559
IPR001906	Terpene synthase, N-terminal domain	PFAM	PF01397	Terpene_synth	coord: 27..207 e-value: 7.2E-55 score: 185.7
IPR036965	Terpene synthase, N-terminal domain superfamily	GENE3D	1.50.10.130		coord: 66..232 e-value: 5.6E-183 score: 610.9
IPR005630	Terpene synthase, metal-binding domain	PFAM	PF03936	Terpene_synth_C	coord: 238..504 e-value: 4.5E-97 score: 324.6
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	GENE3D	1.10.600.10		coord: 27..543 e-value: 5.6E-183 score: 610.9
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	SUPERFAMILY	48576	Terpenoid synthases	coord: 233..559
IPR008930	Terpenoid cyclases/protein prenyltransferase alpha-alpha toroid	SUPERFAMILY	48239	Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases	coord: 24..233

TPS59

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

blastn of TPS CDS against cs10 genome

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

NCBI Download

Sequences

Sequence	ATGTTCACACAAATCTTAGTATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGT TCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTAC ATTACAACATTTCACAACAAGATTTGTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAG GAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGATTATTATTATGA TGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGAT TGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTAC AACAAAACTAATATTATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCG ATTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTCTGATATATTTG AAAAATTCAAAGACGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGAT ACCTTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGG AGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATG AGTTTTTGGTGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCG AAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAA TCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATA ACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTCAATCTATTACAATGC ATGCATAAAAAGGAACTTAGTGAAGTCAGCAGGTGGTGGAAAGAATCAGA TTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTATACC TTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATATTGTTTGGCAAGAAAT ATTTTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCGGATGATATTTATGA TGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGCTCCTAACTCATGCAATTGAAA GGTGGGATATAAATTGTGTGGATACACTGAATCAAGAATATATGCAAACA TTTTATAAGGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTAGA AAAAGAAGAACAATACAAAGTTCATTATGCAAAAGCAGCGTTTAAGGGAT TAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATC CCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTA CATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAA AAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCT GTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAGTTTGAGGA AGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATG GCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAAT GCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTC ACCCATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTT TCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAGTCACCAAAGATATT GTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT
Sequence Length	1677
Sequence Checksum	f6b8f96779622a994ba1fe1b937949dc

Sequence

ATGTTCACACAAATCTTAGTATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGT
TCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTAC
ATTACAACATTTCACAACAAGATTTGTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAG
GAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGATTATTATTATGA
TGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGAT
TGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTAC
AACAAAACTAATATTATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCG
ATTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTCTGATATATTTG
AAAAATTCAAAGACGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGAT
ACCTTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGG
AGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATG
AGTTTTTGGTGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCG
AAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAA
TCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATA
ACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTCAATCTATTACAATGC
ATGCATAAAAAGGAACTTAGTGAAGTCAGCAGGTGGTGGAAAGAATCAGA
TTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTATACC
TTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATATTGTTTGGCAAGAAAT
ATTTTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCGGATGATATTTATGA
TGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGCTCCTAACTCATGCAATTGAAA
GGTGGGATATAAATTGTGTGGATACACTGAATCAAGAATATATGCAAACA
TTTTATAAGGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTAGA
AAAAGAAGAACAATACAAAGTTCATTATGCAAAAGCAGCGTTTAAGGGAT
TAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATC
CCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTA
CATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAA
AAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCT
GTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAGTTTGAGGA
AGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATG
GCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAAT
GCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTC
ACCCATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTT
TCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAGTCACCAAAGATATT
GTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT

Sequence Length

1677

Sequence Checksum

f6b8f96779622a994ba1fe1b937949dc

Summary

Resource Type	mRNA
Organism	Cannabis sativa L.
Name	TPS59
Identifier	TPS59
Time Accessioned	Thursday, April 18, 2024 - 23:49
Time Last Modified	Thursday, April 18, 2024 - 23:49